2003 Fiscal Year Annual Research Report

急速凍結フリーズレプリカ法を駆使した細胞内蛋白質の構造ゲノミクス手法の開発と応用

Research Project

Project/Area Number	15011212
Research Institution	The University of Tokyo
Principal Investigator	片山栄作東京大学, 医科学研究所, 教授 (50111505)
Co-Investigator(Kenkyū-buntansha)	伊東祐二鹿児島大学, 工学部, 助教授 (60223195)
Keywords	急速凍結電子顕微鏡法 / 3次元像再構成法 / コンピュータ・シミュレーション / 生物分子モーター / X線結晶回折 / 「レバーアーム首振り」説 / サブドメイン / 高性能顕微鏡用標識
Research Abstract	本課題では、急速凍結電子顕微鏡法を用いて様々な材料に適用できる3次元構造解析法を開発し、溶液中あるいは細胞内において機能遂行中の蛋白質複合体の構造解析に応用することを目標とする。フリーズ・レプリカ試料を対象とする3次元再構成法はほぼ完成し、現在、ネガティブ染色や樹脂包埋切片に対象を拡張すべく改良中である。原子構造が判明している蛋白質を含む試料の場合には、観察されるべきレプリカ像をコンピュータ・シミュレーションにより予測し、それを実際に得られた像と比較して微妙な構造変化を定量的に評価する方法を開発している。実際の材料への応用として、まず、生物分子モーター、アクトミオシン系の機能中の構造を解析した。硬直複合体におけるミオシン頭部は、X線結晶回折のデータから予測されているものとほぼ同等の構造を示したが、滑り運動中には、「レバーアーム首振り」説により予測される分子の屈曲は見られず、むしろ逆方向に曲がるものが大多数であった。そのような構造がADP存在下で2価性試薬により架橋したミオシン頭部の形状に酷似することを見出し、それらの表面の凹凸プロファイルをシミュレーション画像のパターンマッチングにより定量的に比較した。両者は良く一致しており、ミオシン頭部が予想と逆方向に屈曲していることは確実である。他の結果も含め、これまでに観察したすべての構造データを取り込んで、滑り運動の作動機構に関する新たな作業仮説を構築した。現在、それを実験的に検証する手段を検討中である。一方、細胞内構築の表面における特定の分子やそのサブドメインの局在部位をレプリカ試料の視野内で示し、同時に生きた細胞中におけるその分子の動態を蛍光顕微鏡で追うために,高性能の顕微鏡用標識の開発を進めてきた。すでにその分子設計と標識の基本部分の発現は完了している。現在、その先端にさまざまな結合モジュールを融合した蛋白質を作成中である。

Research Products

(7 results)

All Other

All Publications (7 results)

[Publications] M.Tominaga, H.Kojima, E.Yokota H.Orii, R.Nakamori, E.Katayama, M.Anson, I.Shimmen, K.Oiwa: "Higher plant myosin Xl moves processively on actin with 35 nm steps at high velocity"EMBO J.. 22. 1263-1272 (2003)
[Publications] E.Katayama, N.Ichise, N.Yaeguchi, T.Yoshizawa, S.Maruta, N.Baba: "Three-dimensional structural analysis of individual myosin heads under various functional states"Adv.in Exp.Med.& Bioi.. 538. 295-304 (2004)
[Publications] Y.Fujita, E.Ohto, E.Katayama, Y.Atomi: "αB-crystallin-coated MAPs-microtubule resists nocodazole- and calcium -induced disassembly"J.Cell Sci.. (in press). (2004)
[Publications] K.Hama, T.Aril, E.Katayama, M.Malton, M.H.Ellisman: "Three dimensional morphometrical analyses of astrocytic processes with the high voltage electron microscopy of thick Golgi preparations"J.Neurocytology,. (in press). (2004)
[Publications] K.Tanaka, A.Miyazaki, K.Yoshinaga, S.Hashiguchi, Y.Ito, K.Yoshizaki, K.Sugimura: "Affinity maturation of IL-6 mimic peptide IL-6/37 isolated from phage library"Peptide Science 2003. 347-350 (2004)
[Publications] 伊東祐二, 田中孝一, 橋口周平, 杉村和久: "ヒト抗体エンジニアリングと分子標的医療"バイオインダストリー. 20-7. 34-42 (2003)
[Publications] 伊東祐二, 橋口周平, 杉村和久: "タンパク質研究のための抗体実験マニュアル(分担)"羊土社. 194 (2004)

2003 Fiscal Year Annual Research Report

急速凍結フリーズレプリカ法を駆使した細胞内蛋白質の構造ゲノミクス手法の開発と応用

Principal Investigator

片山 栄作 東京大学, 医科学研究所, 教授 (50111505)

Research Products

[Publications] M.Tominaga, H.Kojima, E.Yokota H.Orii, R.Nakamori, E.Katayama, M.Anson, I.Shimmen, K.Oiwa: "Higher plant myosin Xl moves processively on actin with 35 nm steps at high velocity"EMBO J.. 22. 1263-1272 (2003)

[Publications] E.Katayama, N.Ichise, N.Yaeguchi, T.Yoshizawa, S.Maruta, N.Baba: "Three-dimensional structural analysis of individual myosin heads under various functional states"Adv.in Exp.Med.& Bioi.. 538. 295-304 (2004)

[Publications] Y.Fujita, E.Ohto, E.Katayama, Y.Atomi: "αB-crystallin-coated MAPs-microtubule resists nocodazole- and calcium -induced disassembly"J.Cell Sci.. (in press). (2004)

[Publications] K.Hama, T.Aril, E.Katayama, M.Malton, M.H.Ellisman: "Three dimensional morphometrical analyses of astrocytic processes with the high voltage electron microscopy of thick Golgi preparations"J.Neurocytology,. (in press). (2004)

[Publications] K.Tanaka, A.Miyazaki, K.Yoshinaga, S.Hashiguchi, Y.Ito, K.Yoshizaki, K.Sugimura: "Affinity maturation of IL-6 mimic peptide IL-6/37 isolated from phage library"Peptide Science 2003. 347-350 (2004)

[Publications] 伊東祐二, 田中孝一, 橋口周平, 杉村和久: "ヒト抗体エンジニアリングと分子標的医療"バイオインダストリー. 20-7. 34-42 (2003)

[Publications] 伊東祐二, 橋口周平, 杉村和久: "タンパク質研究のための抗体実験マニュアル(分担)"羊土社. 194 (2004)

片山栄作東京大学, 医科学研究所, 教授 (50111505)