染色体1q34領域にマップされた新規難聴責任遺伝子の同定と機能解析

2003 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 15012202
• Research Institution: Tohoku University
• Principal Investigator: 呉 繁夫 東北大学, 大学院・医学系研究科, 助教授 (10205221)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 大浦 敏博 東北大学, 大学院・医学系研究科, 助教授 (10176828)
• Keywords: 大家系 / リンケージ解析 / 候補遺伝子 / 多型マーカー / 遺伝子変異

Research Abstract

私共の教室では、以前より先天性難聴の遺伝学的背景の検索を行い、日本人connexin26(GJB2)遺伝子変異のうち60%は、235delCという高頻度変異によることを解明し(Am J Med Genet 90:141-145,2000)、その難聴の発症機構を明らかにした(Hum Mol Genet,2003;12:995-1004)。次に、東北地方の大きな難聴家系を見出し、その連鎖解析により染色体1q34に有意な連鎖が認めた。まず、この座位にマップされる既知の難聴遺伝子であるKCNQ4およびGJB3には遺伝子変異検索を行い、遺伝子変異が認められないことを確認した。更に責任領域をさらに狭めるために、1p34領域近傍のマーカーを用いた詳細な連鎖解析をおこなうと同時に、この領域に存在する多数のSNPをJSNPデータベースより入手し、解析を行うことにより、候補遺伝子領域を更に狭める事が出来た。次にヒトゲノム・データベースから、1p34領域近傍のいくつかの候補遺伝子を選出し、遺伝子変異のスクリーニングを行った。遺伝子変異の検索にあたっては、遺伝子の各エキソンをPCRで増幅し、denaturing high-performance liquid chromatography(DHPLC)法でheteroduplexを検出する方法を用いた。溶出パターンが異常を示すDNA断片については、順次、塩基配列の決定を行った。

Research Products

• [Publications] Kudo T., et al.: "Transgenic expression of a dominant-negative Connexin26 …"Hum Mol Genet. 12. 995-1004 (2003)
• [Publications] Katsuoka F., et al.: "Small Maf compound mutants display CNS …"Mol Cell Biol.. 23. 1163-1172 (2003)
• [Publications] Matsubara Y., et al.: "Detection of single nucleotide substitution by …"Hum Mutat. 22. 166-172 (2003)
• [Publications] Kayano S., et al.: "Novel IRF6 mutations in Japanese patients …"J Hum Genet. 48. 622-628 (2003)
• [Publications] Shintaku H., et al.: "Long-term treatment and diagnosis of …"Pediatr Res. in press. (2004)
• [Publications] Kojima K., et al.: "Genetic testing of glycogen storage disease …"Mol Genet Metabol. in press. (2004)