2003 Fiscal Year Annual Research Report

網膜マイクロアレイと候補SNPを用いた糖尿病網膜症の遺伝素因の同定

Research Project

Project/Area Number	15012207
Research Institution	Gifu University
Principal Investigator	武田純岐阜大学, 医学部, 教授 (40270855)
Keywords	生活習慣病 / 遺伝子発現 / インスリン分泌 / ゲノム解析 / DNAチップ / 関連解析 / 遺伝子多型 / オーダーメイド医療
Research Abstract	SNPを用いた2型糖尿病との関連解析において最も重要なことは均一集団を設定することである。そこで申請者は、体外から詳細に「病気の質」が目で観察できる増殖網膜症に注目した。候補遺伝子について検出感度の高いSNPマーカーを開発し、病型との関連解析を実施した。候補遺伝子の選別に対しては、2種類のアプローチを試みた。 1)HIF候補遺伝子の解析血管新生において血管内皮増殖因子VEGFが重要な働きを担う。そこで、VEGF遺伝子の転写因子Hypoxia inducible factor (HIF)のコード遺伝子解析を前年度に開始した。13個のSNPを求めて、168人の増殖網膜症を有する症例と185人の非糖尿病者の間で関連解析を行ったところ、3'端のSNP-13の出現頻度に有意差を認めた(P=0.0171)。連鎖不平衡を考慮してSNPハプロタイプを構築し、300サンプル数を用いて成績を確認した。このSNPは近隣のcSNP(ミスセンス変異)と有意の連鎖不平衡にあったので、同SNPが原因サイトである可能性が示唆された。現在、PCR mutagenesis法により変異導入を行ない、変異蛋白の機能解析を行なっている。 2)網膜ESTマイクロアレイの作成 17,184個の3'ESTを用いたクラスタリング解析により、約半数のESTが未知遺伝子由来であることを既に明らかにしている。この内からハウスキーパーを除去し、先ず既知遺伝子を中心としたアレイを作成した。同アレイを用いてGKラットの糖尿病発症前後の網膜組織について解析を行なった。現在、発現変化遺伝子の区分を行なっている。

Research Products
(6 results)

All Other

All Publications (6 results)

[Publications] Y.Horikawa, et al.: "Genetic variations in CAPN10 are not a major factor in the occurrence of type 2 diabetes in Japanese."J.Clin.Endocrinol.Metab.. 88. 244-247 (2003)
[Publications] M.Hayashi, et al.: "Secretory granule-mediated co-secretion of L-glutamate and glucagon triggers glutamatergic signal transmission in islets of Langerhans."J.Biol.Chem.. 278. 1966-1974 (2003)
[Publications] Q.Zhu, et al.: "T130I mutation in HNF-4α gene is a loss-of-function mutation in hepatocytes and is associated with late-onset Type II diabetes mellitus in Japanese subjects."Diabetologia. 46. 567-573 (2003)
[Publications] T.Tanaka, et al.: "Genomewide linkage and linkage disequilibrium analyses pinpoint the ossification of the posterior longitudinal ligament of the spine to COL6A1 locus on chromosome 21."Am.J.Hum.Genet.. 73. 812-822 (2003)
[Publications] A.N.Smith, et al.: "Revised nomenclature for mammalian vacuolar-type H^+-ATPase subunit genes."Mol.Cell. 12. 801-803 (2003)
[Publications] J.Lin, et al.: "Expression profile of mRNAs from human pancreatic islet tumors."J.Mol.Endocrinol.. 12. 29-34 (2003)

2003 Fiscal Year Annual Research Report

網膜マイクロアレイと候補SNPを用いた糖尿病網膜症の遺伝素因の同定

Principal Investigator

武田 純 岐阜大学, 医学部, 教授 (40270855)

Research Products

[Publications] Y.Horikawa, et al.: "Genetic variations in CAPN10 are not a major factor in the occurrence of type 2 diabetes in Japanese."J.Clin.Endocrinol.Metab.. 88. 244-247 (2003)

[Publications] M.Hayashi, et al.: "Secretory granule-mediated co-secretion of L-glutamate and glucagon triggers glutamatergic signal transmission in islets of Langerhans."J.Biol.Chem.. 278. 1966-1974 (2003)

[Publications] Q.Zhu, et al.: "T130I mutation in HNF-4α gene is a loss-of-function mutation in hepatocytes and is associated with late-onset Type II diabetes mellitus in Japanese subjects."Diabetologia. 46. 567-573 (2003)

[Publications] T.Tanaka, et al.: "Genomewide linkage and linkage disequilibrium analyses pinpoint the ossification of the posterior longitudinal ligament of the spine to COL6A1 locus on chromosome 21."Am.J.Hum.Genet.. 73. 812-822 (2003)

[Publications] A.N.Smith, et al.: "Revised nomenclature for mammalian vacuolar-type H^+-ATPase subunit genes."Mol.Cell. 12. 801-803 (2003)

[Publications] J.Lin, et al.: "Expression profile of mRNAs from human pancreatic islet tumors."J.Mol.Endocrinol.. 12. 29-34 (2003)

武田純岐阜大学, 医学部, 教授 (40270855)