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2004 Fiscal Year Annual Research Report

大腸菌転写制御ネットワークの包括的解析

Research Project

Project/Area Number 15013221
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

饗場 浩文  名古屋大学, 大学院・生命農学研究科, 助教授 (60211687)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 饗場 弘二  名古屋大学, 大学院・理学研究科, 教授 (20025662)
大島 拓  奈良先端科学技術大学院大学, 情報科学研究科, 助手 (50346318)
山本 兼由  近畿大学, 農学部, 助手 (40351580)
Keywords2成分制御系 / 大腸菌 / 情報伝達 / 転写制御 / ヒスチジンキナーゼ / レスポンスレギュレーター / マイクロアレイ / リン酸化
Research Abstract

本研究では大腸菌をモデルとして、全2成分制御系が関わる細胞機能の全体像を解析した。その結果、大腸菌に存在する約30種類の2成分制御系のほぼ全てに関して、感知するストレスシグナルの同定が進み、それらは代謝シグナル応答(炭素、窒素、呼吸関連化合物など)とイオン/金属ストレス応答(Fe, Cu, Mg, Zn, K, Pなど)ならびに多面的ストレス応答(細胞表層ストレス、酸化ストレス、浸透圧ストレスなど)に大別できることを示した。さらにマイクロアレイやSELEX法を用いた解析により、各2成分制御系により制御される遺伝子群(レギュロン)の同定とレスポンスレギュレーターの認識配列の同定ならびに推定が進んだ。
他方、これまでの解析から存在が示唆されてきた2成分制御系間のネットワークに関する研究では、精製タンパク質を用いた網羅的リン酸化反応解析を行い、クロストークの存在を明らかにした。さらに、ヒスチジンキナーゼの自己リン酸化、ヒスチジンキナーゼからレスポンスレギュレーターへのリン酸転移、リン酸化型レスポンスレギュレーターの脱リン酸化の各反応ステップによって、それぞれの2成分制御系が特徴づけられることが明らかとなった。今後は、これらin vitroでの解析成果をin vivoの各2成分制御系の働きとの関連で解析する必要がある。
個別の解析では、嫌気状態の関知に関わる2成分制御系が鞭毛合成の制御に関与することなどが明らかとなった。
本研究の過程で、全2成分制御系遺伝子の欠失株セット、全遺伝子の高発現セット、全タンパク質 精製用の発現プラスミドセットと精製タンパク質、大腸菌内two hybrid解析用プラスミドセット、各2成分制御系の活性化状態をモニターするためのレポーター遺伝子セットなどの重要な研究リソースも蓄積した。

  • Research Products

    (6 results)

All 2005 2004

All Journal Article (6 results)

  • [Journal Article] Functional characterization in vitro of all two-component signal transduction systems from Escherichia coli.2005

    • Author(s)
      Yamamoto K.
    • Journal Title

      J.Biol.Chem. 280

      Pages: 1448-1456

  • [Journal Article] Transcriptional response of Escherichia coli to external copper.2005

    • Author(s)
      Yamamoto K.
    • Journal Title

      Mol.Microbiol. (In press)

  • [Journal Article] Analysis of hydrostatic pressure effects on transcription in Escherichia coli by DNA microarray procedure.2005

    • Author(s)
      Ishii A.
    • Journal Title

      Extremophiles 9

      Pages: 65-73

  • [Journal Article] Effects of mutations in the rpoS gene on cell viability and global gene expression under nitrogen starvation in Escherichia coli.2004

    • Author(s)
      Kabir M.S.
    • Journal Title

      Microbiology 150

      Pages: 2543-2553

  • [Journal Article] Signal transduction cascade between EvgA/EvgS and PhoP/PhoQ two-component systems of Escherichia coli.2004

    • Author(s)
      Eguchi E.
    • Journal Title

      J Bacteriol. 186

      Pages: 3006-3014

  • [Journal Article] Negative Regulation of DNA Repair Gene (ung) Expression by CpxR/CpxA Two-component System in Escherichia coli K-12 and Induction of Mutations by Increased Expression of CpxR.2004

    • Author(s)
      Ogasawara H.
    • Journal Title

      J.Bacteriol. 186

      Pages: 8317-8325

URL: 

Published: 2006-07-12   Modified: 2016-04-21  

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