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2007 Fiscal Year Annual Research Report

蛋白質フォールディング機構の物理化学的解明

Research Project

Project/Area Number 15076201
Research InstitutionNational Institutes of Natural Sciences Okazaki Research Facilities

Principal Investigator

桑島 邦博  National Institutes of Natural Sciences Okazaki Research Facilities, 岡崎統合バイオサイエンスセンター, 教授 (70091444)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 槙 亙介  名古屋大学, 大学院・理学研究科, 准教授 (30361570)
Keywords水 / 生体分子 / 蛋白質 / フォールデイング / 分子シャペロン / 速度論 / 遷移状態 / 中間体
Research Abstract

1.αラクトアルブミンとリゾチームは互いにアミノ酸配列の類似した相同蛋白質であり、それらのフォールディング反応が類似しているか否かを実験的に明らかにすることは、蛋白質のフォールディング問題を考える上で重要である。昨年までの研究で、ヤギαラクトアルブミンのフォールディング反応の速度論的解析を行い、フォールディングの遷移状態で構造化する領域は、Cヘリックスとα-βドメイン境界にあるカルシウム結合部位近傍に局在化していることが明らかになっている。本年は、イヌ乳リゾチームのフォールディング反応の速度論的解析を行い、遷移状態ではカルシウム結合部位の構造は形成されていないことが明らかとなった。したがって、αラクトアルブミンとリゾチームは互いに相同で立体構造も類似しているがフォールディング経路が異なることになる。
2.大腸菌のシャペロニンGroEL/ES複合体が、生理的条件下において、GroELとGroESのモル比が1:1の非対称な構造(弾丸型)を持つのか,あるいは,モル比が1:2の対称な構造(フットボール型)を持つのかは依然解決がついていない。電子顕微鏡の画像解析を利用した研究では,弾丸型であるとする結果とフットボール型であるとする結果の両方が報告されている。溶液X線小角散乱法は溶液中の蛋白質超分子複合体の構造を解析する有効な実験手法である。溶液X線散乱法を用いて,ATP存在下の生理的条件下におけるGroEL/ES複合体の立体構造を解析し,複合体が非対称な弾丸型の構造を持つことを明らかにした。ATP+BeF_x存在下では対称なフットボール型構造が形成されることも明らかとなったので,ATP加水分解を伴ったシャペロニン・サイクル中過渡的にフットボール型となることも期待される。

  • Research Products

    (19 results)

All 2008 2007 Other

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (13 results) Book (1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Asymmetry of the GroEL-GroES complex under physiological conditions as revealed by small-angle X-ray scattering2008

    • Author(s)
      Inobe, T.
    • Journal Title

      Biophys.J. 94

      Pages: 1392-1402

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 真性体および組換え体αラクトアルブミンの構造の安定性とダイナミクス2008

    • Author(s)
      桑島 邦博
    • Journal Title

      Milk Science 56

      Pages: 119-122

  • [Journal Article] Equilibrium and Kinetics of the Folding and Unfolding of Canine Milk Lysozyme2007

    • Author(s)
      Nakatani, H.
    • Journal Title

      Biochemistry 46

      Pages: 5238-5251

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Unfolding Pathways of Goat α-Lactalbumin as Revealed in Multiple Alignment of Molecular Dynamics Trajectories2007

    • Author(s)
      Oroguchi, T.
    • Journal Title

      J.Mol.Biol. 371

      Pages: 1354-1364

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] β_2ミクログロブリンの酸変性と巻き戻り2007

    • Author(s)
      向山 厚
    • Organizer
      第45回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜、横浜
    • Year and Date
      20071221-23
  • [Presentation] 水素/重水素NMR法によるヤギαラクトアルブミンの天然及びモルテン・グロビュール状態の構造解析2007

    • Author(s)
      中村 敬
    • Organizer
      第45回目本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜、横浜
    • Year and Date
      20071221-23
  • [Presentation] シャペロニンGroELの第二のATP結合部位の同定2007

    • Author(s)
      高橋 一暢
    • Organizer
      第45回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜、横浜
    • Year and Date
      20071221-23
  • [Presentation] プロリン残基を含まないスタフィロコッカル・ヌクレアーゼの変異体のアンフォールディング転移の解析2007

    • Author(s)
      中村 敬
    • Organizer
      第45回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜、横浜
    • Year and Date
      20071221-23
  • [Presentation] ペプチドタグを用いたタンパク質の溶解度向上の変異解析2007

    • Author(s)
      加藤 淳
    • Organizer
      第45回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜、横浜
    • Year and Date
      20071221-23
  • [Presentation] Folding of Canine Milk Lysozyme: A Ca^<2+>-Binding Lysozyme2007

    • Author(s)
      KUWAJIMA, Kunihiro
    • Organizer
      The 7th KIAS-Soongsil Conference on Protein Structure and Function
    • Place of Presentation
      Seoul.Korea
    • Year and Date
      20071004-06
  • [Presentation] Human tear lipocalinの折れたたみ初期構造に及ぼすS-S結合除去の影響2007

    • Author(s)
      塚本 精一
    • Organizer
      第7回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      仙台国際センター、仙台
    • Year and Date
      20070524-26
  • [Presentation] 水素/重水素NMR法によるヤギαラクトアルブミンの天然及びモルテン・グロビュール状態の構造解析2007

    • Author(s)
      中村 敬
    • Organizer
      第7回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      仙台国際センター、仙台
    • Year and Date
      20070524-26
  • [Presentation] イヌ・ミルク・リゾチームのフォールディング1アンフォールディングの平衡論と速度論2007

    • Author(s)
      仲谷 博安
    • Organizer
      第7回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      仙台国際センター、仙台
    • Year and Date
      20070524-26
  • [Presentation] グループII型シャペロニヒのサブユニット間協同性におけるhelical protrusionの機能2007

    • Author(s)
      神前 太郎
    • Organizer
      第7回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      仙台国際センター、仙台
    • Year and Date
      20070524-26
  • [Presentation] The native and molten globule states of goat α-lactalbumin characterized by the NMR hvdroeen-exchanee technique2007

    • Author(s)
      NAKAMUR, A, Takashi
    • Organizer
      21st Symposium of the Protein Society
    • Place of Presentation
      Boston,U.S.A.
    • Year and Date
      20070421-25
  • [Presentation] Molecular Mechanism of Protein Folding2007

    • Author(s)
      KUWAJiMA, Kunihiro
    • Organizer
      1st International Symposium on Nanomedicine-from Basic to Applications
    • Place of Presentation
      Okazaki,Aichi,Japan
    • Year and Date
      20070420-22
  • [Presentation] 真性体および組換え体aラクトアルブミンの構造の安定性とダイナミクス2007

    • Author(s)
      桑島 邦博
    • Organizer
      平成19年度目本酪農科学シンポジウム
    • Place of Presentation
      岐阜県岐阜市
    • Year and Date
      2007-08-24
  • [Book] 生物物理ハンドブック2007

    • Author(s)
      桑島 邦博
    • Total Pages
      662
    • Publisher
      朝倉書店
  • [Remarks]

    • URL

      http://gagliano.ims.ac.JP/Welcome.html

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Published: 2010-02-04   Modified: 2016-04-21  

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