2007 Fiscal Year Annual Research Report
たんぱく質間相互作用を介した膜受容体による情報伝達機構の構造学的研究
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15083102
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| Research Institution | Kyoto University |
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Principal Investigator |
白川 昌宏 Kyoto University, 工学研究科, 教授 (00202119)
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| Keywords | NMR / 結晶構造解析 / 膜たんぱく質 / 免疫 |
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| Research Abstract |
インターフェロン18(IL-18)は,インターフェロンγの分泌促進、Tリンパ球ヘルパーI型の分化制御などの作用を持つサイトカインである。IL-18はIL-18受容体αと結合し、これとIL-18受容体βの会合を促進する事で免疫細胞の細胞内シグナル経路を活性化する。このシグナル経路は、Toll-like receptor 4(TLR-4)のシグナル伝達系にも関与するアダプター因子であるMyd88によって仲介される。H18年度までに我々は岐阜大学医学研究科の近藤直美博士らとの共同研究により、Myd88のC末端TIRドメインの立体構造をNMRによって決定した。またIL-18経路と自然免疫経路のシグナル伝達に関与する分子表面を同定するために、培養細胞を使ったアッセイ系による変異体解析を行い、TLR4経路のシグナル伝達に関与する3つの部位を同定した。また同様のアッセイ系によって、IL18シグナル伝達経路においてはこれら3つに加えて、さらに1つの部位が関与するという結果を得た。H19年度には、in vitroの結合実験変異体解析により、TLR4経路に関わる3つの部位のうち2つはアダプター分子MAL/TIRAPのTIRドメインとの相互作用部位である事を示唆する結果を得た。IL-18受容体の細胞外ドメインについては、構造解析に向けた準備段階として、IL-18/IL-18受容体α細胞外ドメイン/IL-18受容体β細胞外ドメインを調製し、3者複合体の形成条件を検討した。さらに昆虫細胞を使った発現系によりIL18結合タンパク質(IL18-binding protein:IL18BP)を調製した。
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[Journal Article] Kinetic and Thermodynamic evidence for flipping of amethyl-CpG binding domain on methylated DNA.2008
Author(s)
Inomata, K., Ohki, I., Tochio, H., Fujiwara, K., Hiroaki, H., Shirakawa, M.
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Journal Title
Biochemistry 47
Pages: 3216-3271
Peer Reviewed
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[Journal Article] Paramagnetic Relaxation-Based 19F MRI Probe to Detect Protease Activity.2008
Author(s)
Mizukami, S., Takikawa, R., Sugihara, F., Hori, Y., Tochio, H., Waelchli, M., Shirakawa, M., Kikuchi, K.
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Journal Title
Journal of the American Chemical Society 130
Pages: 794-795
Peer Reviewed
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[Journal Article] Structural Analysis of Pituitary Adenylate Cyclase-Activating polypeptides Bound to Phospholipid embranes by Magic Angle Spinning Solid-state NMR.2007
Author(s)
Komi, N., Okawa, K., Tateishi, Y., Shirakawa, M., Fujiwara, T., Akutsu, H.
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Journal Title
Biochimica et Biophysica Acta-Biomembranes 1768
Pages: 3001-3011
Peer Reviewed
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[Journal Article] Fluoroscopic assessment of protein leakage during Xenopusoocytes in-cell NMR experiment by co-injected EGFP.2007
Author(s)
Sakai, T., Tochio, H., Inomata, K., Sasaki, Y., Tenno, T., Tanaka, T., Kokubo, T., Hiroaki, H., Shirakawa, M.
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Journal Title
Analytical Biochemistry 371
Pages: 247-249
Peer Reviewed
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[Journal Article] Characterization of the sequence specificity of the R1Bm endonuclease domain by structural and biochemical studies.2007
Author(s)
Maita, N., Aoyagi, H., Osanai, M., Shirakawa, M., Fujiwara, H.,
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Journal Title
Nucleic Acid Research 35
Pages: 3918-3927
Peer Reviewed
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