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2007 Fiscal Year Annual Research Report

膜結合型AAA-ATPasep47/p97複合体による細胞膜認識とその制御

Research Project

Project/Area Number 15083206
Research InstitutionYokohama City University

Principal Investigator

JEREMY R.H.Tame  Yokohama City University, 国際総合科学研究科, 教授 (00336588)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 朴 三用  横浜市立大学, 国際総合科学研究科, 准教授 (20291932)
雲財 悟  横浜市立大学, 国際総合科学研究科, 助教 (60336592)
Keywordsタンパク質 / X線結晶構造解析
Research Abstract

我々はタンパク質間のソフトなインタラクションについて知見を深めるため,TRAP(トリプトファンRNA結合タンパク質)を用いて研究を行っている。TRAPは熱安定性の非常に高いリング型11量体を形成する。TRAPモノマーをコードするDNAを2つ,3つ,または4つをタンデムに結合させて発現させることにより,複数のドメイン構造を持つ新しいTRAP構造体を作成することに成功した。新しく出来たTRAPはリング型12量体を形成しており,サブユニット間の水素結合パターンは11量体と12量体とで大きな差はない。12量体TRAPはペプチドリンカーにより立体構造的に無理な力がかかっているため,熱安定性が悪い。TRAPタンパク質が,11量体を形成してTRAP一分子を余らせるよりも,少々無理をしてでも12量体になったことは,タンパク質・タンパク質の間のエントロピー調節がいかに重要かを示している。最新の成果を以下に何点か挙げる。
(1)TRAPのトリプトファン結合の協同性について解析したところ,協同性に重要なアミノ酸残基を特定することに成功した。
(2)TRAPのリング状構造の中央に金のナノドットを結合させることに成功した。
(3)TRAPサブユニット同士を結合するリンカーの長さを調節することにより,TRAP複合体の安定性を飛躍的に向上させることに成功した。

  • Research Products

    (9 results)

All 2008 2007

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 6 results) Presentation (3 results)

  • [Journal Article] Intersubunit linker length as a modifier of protein stability:crystal structures and thermostability of mutant TRAP2008

    • Author(s)
      Watanabe M, Mishima Y, Yamashita I, Park SY, Tame JR, Heddle JG
    • Journal Title

      Protin Sci. 17(3)

      Pages: 518-26

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] EFFect of N-terminal reidues on the structural stability of recmbinant horse L-chain apoferritin in an acidic environment2007

    • Author(s)
      Yoshizwa K, Mishima Y, Park SY, Heddle JG, Tame JR, Iwahori K, Kobayashi M, Yamashita I
    • Journal Title

      J Biochem 142(6)

      Pages: 707-13

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Using the ringshaped protein TRAP to capture and confine gold nanod ots on a surface2007

    • Author(s)
      Heddle JG, Fujiwara I, Yamadaki H, Yoshii S, Nishio K, Addy C, Yamsdhita I, Tame JR
    • Journal Title

      Small 3(11)

      Pages: 1950-6

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Crystallication and preliminary crystallographic studies of the metallogl ycoprotein esterase A4 using a baculovirus expressio system2007

    • Author(s)
      Hiraki T, Shibayama N, Yoon YH, Yun KM, Hamamoto T, Tame JR, Park SY
    • Journal Title

      Acta Crystallogr sect F struct Biol Cryst Commun 63(Pt9)

      Pages: 734-6

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structure and mechanism of HpcG,a hydratase in the homoprotocatech uate degradation pathway of Escherichia coli2007

    • Author(s)
      Izumi A, Rea D, Adachi T, Unzai S, Park SY, Roper DI, Tame JR
    • Journal Title

      J Mol Biol 370(5)

      Pages: 899-911

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Dynamic allostery in the ring protein TRAP2007

    • Author(s)
      Heddle JG, Okajima T, Scott DJ, Akashi S, Psrk SY, Tame JR
    • Journal Title

      J Mol Biol 371(1)

      Pages: 154-67

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Structural insights into serine protease autotoransporter HBP rfom path ogentic Escherichia coli2008

    • Author(s)
      J.Tame
    • Organizer
      Society for General Microbiology
    • Place of Presentation
      Edinburgh,UK
    • Year and Date
      20080331-0403
  • [Presentation] Dynamic allosteRy in the tRyptohan-binding pRotein TRAP2007

    • Author(s)
      Heddle JG, Akashi S, Psrk SY, Tame JR
    • Organizer
      Biophysice of ligand binding to drug tagets
    • Place of Presentation
      Strasbourg,France
    • Year and Date
      20070514-16
  • [Presentation] X-ray Crystallography of Autotransporters from Pathogenic Bacteria2007

    • Author(s)
      Kaoru Nishimura, Sam-Yog Park, and Jeremy Tame
    • Organizer
      Molecular Microbiology Young Microbiologists Minisymposium Prokaryotic Membranes
    • Place of Presentation
      Paris,France
    • Year and Date
      2007-10-12

URL: 

Published: 2010-02-04   Modified: 2016-04-21  

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