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2006 Fiscal Year Annual Research Report

遺伝情報系と細胞シグナル系における超分子複合体の立体構造と機能

Research Project

Project/Area Number 15107002
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

横山 茂之  東京大学, 大学院理学系研究科, 教授 (00159229)

KeywordsX線結晶構造解析 / 立体構造 / 翻訳 / tRNA / アミノアシルtRNA合成酵素 / 転写 / RNAポリメラーゼ
Research Abstract

ショウジョウバエにおいて生殖細胞の分化に関与しているRNAヘリケースであるVasaとRNA、ATPアナログとの三重複合体のX線結晶構造解析にすでに成功していた。この構造を基に酵素の変異体解析を行い、DEAD-box RNAヘリケースがRNA二重鎖をほどく分子機構を推定し、投稿論文として発表した。DEAD-box RNAヘリケースは真核生物に広く存在しており、その活性機構を解き明かした本研究の意義は大きい。
一部の古細菌においてシステイン生合成の第一段階として機能するホスホセリルtRNA合成酵素とtRNA^<cys>との複合体の構造解析に成功し、リン酸化セリンをタンパク質の部位特異的に導入する技術につながる基盤を確立した。古細菌由来フェニルアラニルtRNA合成酵素の校正ドメインの構造解析に成功した。変異体の活性測定とあわせて、誤って導入された活性化チロシンの校正機構の詳細について明らかにし、発表した。また、高度高熱菌由来グルタミルtRNA合成酵素とtRNA^<Glu>とが協調してグルタミン酸を特異的に認識する機構を結晶構造学的に明らかにし、発表した。さらに、アスパラギニルtRNA合成酵素とアスパラギンとの複合体の高分解能構造の解析に成功し、変異体の解析とあわせて水を介したアスパラギンの詳細な認識機構を解明し、発表した。
古細菌由来Trm56およびTrm5というtRNAの修飾を担うメチル基転移酵素について構造解析に既に成功している。また、tRNA前駆体の3'末端の成熟化に関与するRNase ZとtRNAとの複合体の構造解析にも成功している。
分裂酵母由来RNAポリメラーゼIIIの構成分子であるC17/25複合体の良質な電子密度を得ることに成功しており、現在構造精密化を行っている。

  • Research Products

    (11 results)

All 2007 2006

All Journal Article (11 results) (of which Peer Reviewed: 2 results)

  • [Journal Article] The C-Terminal Domain of the Archaeal Leucyl-tRNA Synthetase Prevents Misediting of Isoleucyl-tRNA^<Ile>2007

    • Author(s)
      Fukunaga, R.
    • Journal Title

      Biochemistry (In press)

  • [Journal Article] Structural basis of CoA recognition by the Pyrococcus single-domain CoA-vinding proteins2007

    • Author(s)
      Hiyama, T. B.
    • Journal Title

      J. Struct. Funct. Genomics (In press)

  • [Journal Article] Structural insights into the first step of RNA-dependent cysteine biosynthesis in archaea2007

    • Author(s)
      Fukunaga, R.
    • Journal Title

      Nat Struct Mol Biol. 14

      Pages: 272-279

  • [Journal Article] Structural bases of transfer RNA-dependent amino acid recognition and activation by glutamyl-tRNA synthetase2006

    • Author(s)
      Sekine, S.
    • Journal Title

      Structure 14

      Pages: 1791-9

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structural basis for RNA unwinding by the DEAD-box protein Drosophila Vasa2006

    • Author(s)
      Sengoku, T.
    • Journal Title

      Cell 125

      Pages: 287-300

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Site-specific incorporation of non-natural amino acids into proteins in mammalian cells with an expanded genetic code2006

    • Author(s)
      Hino, N.
    • Journal Title

      Nat. Protoc. 1

      Pages: 2957-2962

  • [Journal Article] Structural and mutational studies of the amino acid-editing domain from archaeal/eukaryal phenylalanyl-tRNA2006

    • Author(s)
      Sasaki, H. M.
    • Journal Title

      Proc. Natl. Acad. Sci. U S A 103

      Pages: 14744-14749

  • [Journal Article] Stimulation of Dmcl-mediated DNA strand exchange by the human Rad54B protein2006

    • Author(s)
      Sarai, N.
    • Journal Title

      Nucleic Acids Res. 34

      Pages: 4429-4437

  • [Journal Article] Structural basis of the water-assisted asparagine recognition by asparaginyl-tRNa synthetase2006

    • Author(s)
      Iwasaki, W.
    • Journal Title

      J. Mol. Biol. 360

      Pages: 329-342

  • [Journal Article] Crystal structure of the single-domain rhodanese homologue TTHA0613 from Thermus thermophilus HB82006

    • Author(s)
      Hattori, M.
    • Journal Title

      Proteins 64

      Pages: 284-287

  • [Journal Article] Structural basis for substrate recognition by the editing domain of isoleucyl-tRNA synthetase2006

    • Author(s)
      Fukunaga, R.
    • Journal Title

      J. Mol. Biol. 359

      Pages: 901-912

URL: 

Published: 2008-05-08   Modified: 2016-04-21  

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