2004 Fiscal Year Annual Research Report
| Project/Area Number |
15200032
|
|---|
| Research Institution | The Institute of Physical and Chemical Research |
|---|
Principal Investigator |
権藤 洋一 独立行政法人理化学研究所, 個体遺伝情報研究チーム, チームリーダー (40225678)
|
|---|
| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
古関 明彦 独立行政法人理化学研究所, 免疫器官形成研究グループ, グループディレクター (40225446)
木南 凌 国立大学法人新潟大学, 大学院・医歯学総合研究科, 教授 (40133615)
山田 源 国立大学法人熊本大学, 生命資源研究・支援センター, 教授 (80174712)
西田 圭吾 独立行政法人理化学研究所, サイトカイン制御研究グループ, 上級研究員 (80360618)
阿部 訓也 独立行政法人理化学研究所, 動物変異動態解析技術開発チーム, チームリーダー (40240915)
|
|---|
| Keywords | ミュータジェネシス / マウス / モデル動物 / 逆遺伝学 / ゲノム機能 / 遺伝子機能 / 突然変異誘発 / エチルニトロソウレア |
|---|
| Research Abstract |
マウスゲノムに誘発した新規点突然変異のアーカイブ化と変異高速発見システムを駆使し、特定の遺伝子機能解明を普遍的に誰でも利用できる基盤開発を目的とする。利用者が標的とする遺伝子領域を特異的に増幅するPCRプライマーさえ準備すれば、どのマウスゲノム配列/遺伝子配列でも点突然変異をもつマウス系統を提供できる。利用者は提供された変異マウス系統を用いてゲノム機能を個体表現型レベルから遺伝子ネットワークに至るまで自在に解析する。今年度は、まず凍結精子アーカイブを約10,000に、ゲノムDNAアーカイブを8,000に増強した(権藤)。点突然変異を検索する標的として生殖形態形成関連(山田)や生殖細胞発生関連(北田)の未知遺伝子群を探索同定しプライマー設計が可能となった。脳神経関連(饗場)、老化関連(菅原)、がん関連(木南)、免疫関連(西田)、ポリコーム群(古関)、PCP関連(上野)、遺伝子発現関連(阿部)、それぞれの遺伝子群において、昨年度設定したプライマーを用いてTGCE法を用いてスクリーニングを行った(権藤)。すでにのべ14遺伝子から昨年度の3倍近くとなる合計30ほどの点突然変異を検出し(権藤)、そのうち6系統についてはすでにマウスとして交配し機能解析に入った(西田、阿部、木南、饗場、古関)。さらに、ほぼ同数の変異系統を、現在、凍結精子から回復し個体に戻すことを検討している(菅原、上野、他)。また昨年度示唆されていたTGCEの検出感度を検討するためにダイレクトシーケンシングや他の変異発見システムとの比較解析にも着手した。昨年に引き続き更なる利用者を募り標的遺伝子総数135となりhttp://www.gsc.riken.jp/Mouse/で公開している。
|
