2004 Fiscal Year Annual Research Report
CGHアレイ法によるゲノム異常解析に基づく口腔癌の悪性度予測と治療標的分子の探索
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15209069
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| Research Institution | Tokyo Medical and Dental University |
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Principal Investigator |
天笠 光雄 東京医科歯科大学, 大学院・医歯学総合研究科, 教授 (00014332)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
稲澤 譲治 東京医科歯科大学, 難治疾患研究所, 教授 (30193551)
鵜澤 成一 東京医科歯科大学, 大学院・医歯学総合研究科, 助手 (30345285)
井本 逸勢 東京医科歯科大学, 難治疾患研究所, 助教授 (30258610)
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| Keywords | 口腔癌 / CGHアレイ / ゲノム / 分子標的 / DNAメチル化 |
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| Research Abstract |
(1)口腔癌及びその前癌病変の臨床検体と臨床・病理学的データの収集の推進
これまでに引き続いて、口腔扁平上皮癌細胞株の収集、ならびに口腔癌及び前癌病変臨床検体と臨床・病理学的情報の収集とデータベース化を進めることにより、解析に利用可能なリソースの充実化を図った。
(2)ゲノムアレイを用いたCGHアレイ解析ならびにゲノム異常の標的候補遺伝子の探索と解析
口腔癌細胞株、食道扁平上皮癌細胞株、ならびにこれらの癌の臨床検体よりマイクロダイセクションを用いて抽出したDNAについて、(1)ゲノムワイドなコピー数異常のスクリーニング用アレイ(MCG Whole Genome Array-4500)ならびに(2)癌関連遺伝子に特定したアレイ(MCG Cancer Array-800)を用いたCGHアレイ法による解析を行った。この結果検出できた新規のホモ欠失や増幅領域から、発現消失あるいは亢進により口腔癌や食道癌の病態に関与する遺伝子群が同定され、これらの臨床病理学的意義や生物学的機能の検討を進めた。
(3)ゲノムアレイの応用法の開発とメチル化遺伝子単離
ゲノムアレイとMethylated CpG Island Amplification (MCA)法と組み合わせた遺伝子プロモーター領域のメチル化異常の解析(BAC array-based MCA、BAMCA法)や、chromatin immunoprecipitation (ChIP)法と組み合わせた同領域の結合蛋白(複合体)異常の検出などの応用法の開発を進めた。特にBAMCA法を用いた口腔癌におけるメチル化遺伝子のスクリーニングにより新規の標的遺伝子候補を同定した。
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