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2005 Fiscal Year Annual Research Report

酸化DNA損傷を認識する塩基除去修復酵素の網羅的同定と機能解析

Research Project

Project/Area Number 15310038
Research InstitutionHIROSHIMA UNIVERSITY

Principal Investigator

井出 博  広島大学, 大学院・理学研究科, 教授 (30223126)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 寺東 宏明  広島大学, 大学院・理学研究科, 助手 (00243543)
久保 喜平  大阪府立大学, 大学院・生命環境科学研究科, 教授 (40117619)
KeywordsDNA損傷 / 塩基除去修復酵素 / DNAグリコシラーゼ / クロスリンク / オキザニン / デオキシリボノラクトン
Research Abstract

1.DNAグリコシラーゼの特性解析
酵素トラップ反応基質であるoxanineを含むオリゴヌクレオチドを用いて,各種DNAグリコシラーゼの損傷除去活性を検討した。ヒト酵素(hSMUG1,hMPG, hNTH1, hNEIL1, hNEIL2, hOGG1)および大腸菌酵素(Ung, AlkA, Endo III, Endo VIII, Fpg)は,いずれもoxanineに対し無視できる程度の極めて弱い損傷除去活性(N-グリコシラーゼ活性)しか示さなかった。また,spermineとの反応により,oxanineをoxanine-spermine付加体に変換した場合は,上記の酵素はまったく損傷除去活性を示さなかった。これらの結果から,細胞粗抽出物を用いて修復タンパクの探索を行う場合,oxanineは内在性のDNAグリコシラーゼにより除去されることなく安定にプローブDNA中に存在し,トラップ反応が可能であることが示された。
2.トラップ反応を用いたDNA修復酵素の探索
HeLa細胞から細胞粗抽出物を調製し,これとプローブDNA(oxanineを含む二重鎖オリゴヌクレオチド)をインキュベートした。oxanine-タンパク質クロスリンク生成物を精製し,さらに,SDS-PAGEにより各生成物を分離した。得られたクロスリンク生成物の見かけのサイズは28-100kDaであった。個々のバンドをゲルから切り出し,mass fingerprintingにより分析した。その結果,クロスリンクタンパクとして,ヒストンおよびRNAスプライシング関連タンパク質のほかに,複数の機能未知タンパク質およびDNA修復との関連が示唆されるタンパク質が同定された。後者のタイプのタンパク質については,DNA修復との関連の解明および機能解析に向けて検討を進めている。

  • Research Products

    (3 results)

All 2005

All Journal Article (3 results)

  • [Journal Article] Repair activity of base and nucleotide excision repair enzymes for guanine lesions induced by nitrosative stress2005

    • Author(s)
      Nakano, T.
    • Journal Title

      Nucleic Acids Research 33

      Pages: 2181-2191

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Journal Article] Assessment of the genotoxic potential of nitric oxide-induced guanine lesions by in vitro reactions with Eschericia coli DNA polymelase I2005

    • Author(s)
      Nakano, T.
    • Journal Title

      Mutagenesis 20

      Pages: 209-216

  • [Journal Article] Roles of base excision repair enzymes Nthlp and Apn2p from Schizosaccharomyces pombe in processing alkylation and oxidative DNA damage2005

    • Author(s)
      Sugimoto, T.
    • Journal Title

      DNA Repair 4

      Pages: 1270-1280

URL: 

Published: 2007-04-02   Modified: 2016-04-21  

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