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2005 Fiscal Year Annual Research Report

腫瘍学的一酸化窒素生体内動態の化学的・生化学的全解明

Research Project

Project/Area Number 15350099
Research InstitutionKYOTO UNIVERSITY

Principal Investigator

牧野 圭祐  京都大学, 国際融合創造センター, 教授 (50159141)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 小瀧 努  京都大学, エネルギー理工学研究所, 助教授 (70170264)
金折 賢二  京都工芸繊維大学, 繊維学部, 助教授 (30273543)
Keywords一酸化窒素 / 発ガン / デオキシオキザノシン / DNAオリゴマー合成 / 修復酵素検出 / DNA-核内化合物架橋
Research Abstract

一酸化窒素によって遺伝子内に生成するデオキシオキザノシン(dOxo)残基が捕捉する核内タンパク質を同定して一酸化窒素による発ガンの機構を解明するために、以下の研究を行った。
(1)dOxoアミダイトモノマー合成:dOxoからの5'-O-DMTr-dOxo-phosphoramidite合成法の収率向上に努めた。dGuoからのdOxo収率15%、dOxoからの5'-O-DMTr-dOxo(a)の収率70%、aからの高純度5'-O-DMTr-dOxo-phosphoramidite合成収率を72.5%に向上した。
(2)dOxoを鎖中にもったオリゴヌクレオチドの合成:5'-O-DMTr-dOxo-phosphoramidite(b)を5番目のアミダイトモノマーとした自動合成法を完成した。bのカップリング収率は93%以上であり、20量体全体の平均カップリング収率97%を達成した。修復酵素捕捉・同定に使用するdOxo含有DNAオリゴマーの量の獲得に成功した。また、鎖中dOxoは制限酵素およびライゲースによる反応ではdGuoと認識されることを明らかにした。また、担体への固定化法を完成した。
(3)dOxoを鎖中にもったオリゴヌクレオチドによる細胞内修復酵素の捕獲・同定:ライゲース反応がdOxoによって阻害されないため、場合によってはライゲーションを用いた、本目的に用いるdOxoを含む数十量体の巨大DNAオリゴマー合成法を完成した。dOxoを含むDNA二重鎖と株化した動物あるいはヒト細胞破砕液中のタンパク質との架橋反応を検出したが、期間中にこのタンパク質の同定は完了できなかった。
(4)i-motif構造形成因子解析:期間中には完了できなかった。
(5)総括:3年間の研究によって、一酸化窒素による細胞ガン化のメカニズム解明の成功に接近したと評価する。

  • Research Products

    (16 results)

All 2006 2005

All Journal Article (9 results) Book (3 results) Patent(Industrial Property Rights) (4 results)

  • [Journal Article] Complete reversal of coenzyme specificity of xylitol dehydrogenase and increase of thermostability by the introduction of structural zinc2006

    • Author(s)
      S.Watanabe, T.Kodaki, K.Makino
    • Journal Title

      Journal of Biological Chemistry 280

      Pages: 10340-10349

  • [Journal Article] Cloning, expression, and characterization of bacterial L-arabinose 1-dehydrogenase involved in an alternative pathway of L-arabinose metabolism2006

    • Author(s)
      S.Watanabe, T.Kodaki, K.Makino
    • Journal Title

      Journal of Biological Chemistry 281

      Pages: 2612-2623

  • [Journal Article] Chemical synthesis and thermodynamic characterization of oxanine-containing oligodeoxynucleotides2005

    • Author(s)
      S.-P.Pack, M.Nonogawa, T.Kodaki, K.Makin
    • Journal Title

      Nucleic Acid Research 33

      Pages: 5771-5780

  • [Journal Article] Repair activity of base and nucleotide excision repair enzymes for guanine lesions induced by nitrosative stress2005

    • Author(s)
      T.Nakano, A.Katafuchi, R.Shimizu, H.Terato, T.Suzuki, H.Tauchi, K.Makino, M.Skorvaga, B.Van Houten, H.Id
    • Journal Title

      Nucleic Acid Research 33

      Pages: 2181-2191

  • [Journal Article] Photodynamic effects of a novel pterin derivative on a pancreatic cancer cell line2005

    • Author(s)
      H.Yamada, T.Arai, N.Endo, K.Yamashita, M.Nonogawa, K.Makino, K.Fukuda, M.Sasada, T.Uchiyama
    • Journal Title

      Biochem.Biophys.Res.Commn 333

      Pages: 763-767

  • [Journal Article] Protective effects of intracellular reactive oxygen species generated by 6-formylpterin on tumor necrosis factor-・-induced apoptotic cell injury in cultured rat hepatocytes2005

    • Author(s)
      H.Ishii, T.Arai, H.Mori, H.Yamada, N.Endo, K.Makino, K.Fukuda
    • Journal Title

      Life Sciences 77

      Pages: 858-868

  • [Journal Article] A hydrogen peroxide-generating agent, 6-formylpterin, enhances heat-induced apoptosis2005

    • Author(s)
      S.Wada, Z.-G.Cui, T.Kondo, Q.-L.Zhao, R.Ogawa, M.Shoji, T.Arai, K.Makino, I.Furuta
    • Journal Title

      Int.J.Hyprethermia 21

      Pages: 231-246

  • [Journal Article] A novel method for synthesis of silica nanoparticles2005

    • Author(s)
      Kota Sreenivasa Rao, Khalil El-Hami, Tsutomu Kodaki, Kazumi Matsushige, Keisuke Makino
    • Journal Title

      J.Colloid and Interface Sci 289

      Pages: 125-131

  • [Journal Article] Electron spin resonance analysis of the oxidation reactions of nitrone type spin traps with gold(III) ion2005

    • Author(s)
      A.Nakajima, Y.Ueda, N.Endo, K.Tajima, K.Makino
    • Journal Title

      Canadian Journal of Chemistry 83

      Pages: 1178-1184

  • [Book] DNAマイクロアレイ(「生物薬科学実験講座 第2巻 核酸 [I]核酸の合成と分析 第2章核酸の分析)(杉浦幸雄編集)2005

    • Author(s)
      牧野圭祐, 金原秀行
    • Total Pages
      20
    • Publisher
      廣川書店
  • [Book] DNAマイクロアレイの構造と開発技術2005

    • Author(s)
      牧野圭祐
    • Total Pages
      8
    • Publisher
      MATERIAL STAGE
  • [Book] Reaction of NO with Nucleic Acid Bases and Its Biological Implication in"Genomic Chemistry2005

    • Author(s)
      S.P.Pack, T.Suzuki, H.Ide, T.Kodaki, K.Makino
    • Total Pages
      30
    • Publisher
      Bentham Science Publisher Ltd.,USA
  • [Patent(Industrial Property Rights)] リンカー用化合物、プローブ及びプローブ固定化担体2006

    • Inventor(s)
      牧野 圭祐, 小瀧 努, 渡邊 誠也, スンピル パック, 野々川 満, 和田 啓男, 吉田 安子, 山田 和成
    • Industrial Property Rights Holder
      京都大学, 日本碍子, 信和化工
    • Industrial Property Number
      PCT/JP2006/304641
    • Filing Date
      2006-03-09
  • [Patent(Industrial Property Rights)] プローブ及びプローブ固定化担体2006

    • Inventor(s)
      牧野 圭祐, 吉田 安子, 山田 和成
    • Industrial Property Rights Holder
      京都大学, 日本碍子
    • Industrial Property Number
      PCT/JF2006/304642
    • Filing Date
      2006-03-09
  • [Patent(Industrial Property Rights)] リンカー化合物、プローブ及びプローブ固定化担体2005

    • Inventor(s)
      牧野 圭祐, 小瀧 努, 渡邊 誠也, スンピル パック, 野々川 満, 和田 啓男, 吉田 安子, 山田 和成
    • Industrial Property Rights Holder
      京都大学, 日本碍子, 信和化工
    • Industrial Property Number
      特願2005-065948
    • Filing Date
      2005-03-09
  • [Patent(Industrial Property Rights)] L-アラビノースをα-ケトグルタル酸に変換する方法、この方法に使用する酵素、該酵素をコードする遺伝子、該遺伝子を含む組換え微生物2005

    • Inventor(s)
      牧野 圭祐, 小瀧 努, 渡邉 誠也, 和田 啓男
    • Industrial Property Rights Holder
      京都大学, 信和化工
    • Industrial Property Number
      特願2005-303253
    • Filing Date
      2005-10-18

URL: 

Published: 2007-04-02   Modified: 2016-04-21  

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