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2004 Fiscal Year Annual Research Report

改変PEPC遺伝子導入植物の作出を目指したC4光合成酵素の構造生物学

Research Project

Project/Area Number 15370045
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

甲斐 泰  大阪大学, 大学院・工学研究科, 教授 (40029236)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 井上 豪  大阪大学, 大学院・工学研究科, 助教授 (20263204)
金久 展子  大阪大学, 大学院・工学研究科, 講師 (20177538)
松村 浩由  大阪大学, 大学院・工学研究科, 助手 (30324809)
KeywordsC4植物 / ホスホエノールピルビン酸カルボキシラーゼ / 活性調節メカニズム / 構造-機能相関 / NADP依存型リンゴ酸酵素 / PEPC-PK / PEPC変異体K620S
Research Abstract

本研究では、C4植物に特徴的な酵素であるホスホエノールピルビン酸カルボキシラーゼ(PEPC)のin vitro活性調節機構を解明することを目的として、PEPCに元来備わっている活性調節の分子機構解明に加えて、PEPCの活性調節に関与する同じ代謝系の酵素群の機能を構造科学的に解明することを目的とした。
まず、アロステリック阻害剤であるリンゴ酸に阻害を受けない大腸菌由来酵素変異体K620Sの立体構造解明を目的として、酵素を大量発現し結晶化を行った。その後、放射光施設SPring-8にて回折強度データ収集を行い、3.0Å分解能までのデータを収集した。続いて、分子置換法により構造解析を行い、アロステリック阻害剤脱感作の分子機構を明らかにした。現在、論文執筆中である。
次に、PEPCの活性調節に重要な役割を担っているPEPCに特異的なリン酸化酵素(PEPC-PK)の立体構造解明を目的とし、本酵素の大量発現・精製・結晶化を行った。微結晶は得られたものの残念ながらX線構造解析に適した単結晶が現在のところ得られなかった。
続いて、PEPCの阻害剤であるリンゴ酸を基質とするNADP依存型リンゴ酸酵素(NADP-ME)の構造-機能相関解明を目的とし、本酵素の大量発現・精製・結晶化を行った。単結晶を得ることが非常に困難であったが、SPring-8にて3.0Å分解能の回折強度データを収集することに成功した。現在、更なる結晶化条件の検索と立体構造解析を行っている。
更に、本研究では、立体構造情報を元に生化学者と共同でPEPC変異体を作成し、詳細なPEPC活性調節メカニズムにおける構造-機能相関を解明した。これらの成果に加えて、本研究では数種類のタンパク質を扱い結晶化を行う過程で、溶液状態制御による新しい結晶化手法を考案し、これら新規手法が良質のタンパク質結晶成長に有効であることを明らかにした。

  • Research Products

    (27 results)

All 2005 2004 2003

All Journal Article (26 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Identification of single Mn^<2+> binding sites required for activation of the mutant proteins of E.coli RNase HI at Glu48 and/or Asp134 by X-ray crystallography2005

    • Author(s)
      Yasuo Tsunaka et al.
    • Journal Title

      J.Mol.Biol. 345

      Pages: 1171-1183

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Journal Article] Crystallization and preliminary X-ray diffraction study of thermostable RNase HIII from Bacillus2005

    • Author(s)
      Hyongi Chon et al.
    • Journal Title

      Acta Crystallogr F61

      Pages: 293-295

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Journal Article] Overproduction and preliminary crystallographic study of a human kynurenine aminotransferase II homologue from Pyrococcus horikoshii OT32005

    • Author(s)
      Hyongi Chon et al.
    • Journal Title

      Acta Crystallogr F61

      Pages: 319-322

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Journal Article] Maize phosphoenolpyruvate carboxylase: Mutations at the putative binding site for glucose 6-phosphate caused desensitization and abolished responsiveness2005

    • Author(s)
      Akiko Takahashi-Terada et al.
    • Journal Title

      J.Biol.Chem. (in press)

  • [Journal Article] Structural Evidence of pH-induced Change Potential of Mavicyanin from Cucurbita pepo medullosa (Zucchini)2005

    • Author(s)
      Y.Xie, T.Inoue, et al.
    • Journal Title

      J.Biochem. (In press)

  • [Journal Article] Crystallization and preliminary X-ray crystallographic studies of dissimilatory nitrite reductase isolated from Hyphomicrobium denitrificans A3151.2004

    • Author(s)
      Y.Xie, T.Inoue, et al.
    • Journal Title

      Acta Cryst. D60

      Pages: 2383-2386

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Journal Article] Two-liquid hanging-drop vapor-diffusion technique of protein crystallization2004

    • Author(s)
      H.Adachi, et al.
    • Journal Title

      Jpn.J.Appl.Phys. 43

      Pages: L79-L81

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Journal Article] Protein Crystal Growth with a Two-Liquid System and Stirring Solution2004

    • Author(s)
      H.Adachi, et al.
    • Journal Title

      J.Synchrotron Rad. 11

      Pages: 121-124

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Journal Article] A Semiautomatic Protein Crystallization System with Preventing Evaporation of Drops and Surface Sensor of Solution2004

    • Author(s)
      H.Adachi, et al.
    • Journal Title

      Jpn.J.Appl.Phys. 43

      Pages: L76-L78

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Journal Article] Protein Crystal Processing Using a Deep-UV Laser2004

    • Author(s)
      H.Adachi, et al.
    • Journal Title

      Jpn.J.Appl.Phys. 43

      Pages: L73-L75

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Journal Article] Pre-Stirring Promotes Nucleation of Protein Crystals2004

    • Author(s)
      H.Adachi, et al.
    • Journal Title

      Jpn.J.Appl.Phys. 43

      Pages: L243-L246

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Journal Article] New Approach to Improve X-ray Diffraction Pattern of Protein Crystal Using UV-Laser Ablative Processing2004

    • Author(s)
      H.Kitano, et al.
    • Journal Title

      Jpn.J.Appl.Phys. 43

      Pages: L297-L299

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Journal Article] The effects of Solution Stirring on Protein Crystal Growth2004

    • Author(s)
      Mari Yaoi, et al.
    • Journal Title

      Jpn.J.Appl.Phys. 43

      Pages: L686-L688

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Journal Article] Generation of protein crystals using a solution-stirring technique.2004

    • Author(s)
      H.Adachi, et al.
    • Journal Title

      Jpn.J.Appl.Phys. 43

      Pages: L762-L764

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Journal Article] Universal processing technique for protein crystals using a pulsed UV laser.2004

    • Author(s)
      A.Murakami, et al.
    • Journal Title

      Jpn.J.Appl.Phys. 43

      Pages: L873-L876

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Journal Article] Novel and simple screening methods for protein crystallization by vapor diffusion rate control2004

    • Author(s)
      H.Adachi, et al.
    • Journal Title

      Jpn.J.Appl.Phys. 43

      Pages: 6264-6267

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Journal Article] レーザー照射による蛋白質結晶成長制御2004

    • Author(s)
      安達宏昭, et al.
    • Journal Title

      日本結晶学会誌 46

      Pages: 238-242

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Journal Article] Application of UV-laser Ablation to Detaching Protein Crystal from Growth Vessel2004

    • Author(s)
      H.Kitano, et al.
    • Journal Title

      Jpn.J.Appl.Phys. 43

      Pages: L1271-L1274

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Journal Article] Effect of Stirring Method on Protein Crystallization2004

    • Author(s)
      M.Yaoi, et al.
    • Journal Title

      Jpn.J.Appl.Phys. 43

      Pages: L1318-L1319

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Journal Article] Control of Protein Crystal Nucleation and Growth Using Stirring Solution2004

    • Author(s)
      A.Niino, et al.
    • Journal Title

      Jpn.J.Appl.Phys. 11

      Pages: L1442-L1444

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Journal Article] 紫外レーザーを用いた蛋白質結晶の加工2004

    • Author(s)
      北野博史, et al.
    • Journal Title

      日本結晶学会誌 46

      Pages: 292-296

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Journal Article] Phosphoenolpyruvate carboxylase; A New Era of Structural Biology2004

    • Author(s)
      Katsura Izui, et al.
    • Journal Title

      Annu.Rev.Plant Biol. 55

      Pages: 69-84

  • [Journal Article] First Determination of the Inhibitor Complex Structure of Human Hematopoietic Prostaglandin D Synthase2004

    • Author(s)
      T.Inoue, et al.
    • Journal Title

      J.BIochem. 135

      Pages: 279-283

  • [Journal Article] Improving the Quality of Protein Crystals Using Stirring Crystallization2004

    • Author(s)
      H.Adachi, et al.
    • Journal Title

      Jpn.J.APpl.Phys. 43

      Pages: L522-L525

  • [Journal Article] Membrane Protein Crystallization Using Laser Irradiation2004

    • Author(s)
      H.Adaci, et al.
    • Journal Title

      Jpn.J.Appl.Phys. 43

      Pages: L1376-L1378

  • [Journal Article] Phosphoenolpyruvate carboxylase: Three-dimensional structure and molecular mechanisms2003

    • Author(s)
      Yasushi Kai, et al.
    • Journal Title

      Arch.Biochem.Biophys. 414

      Pages: 170-179

  • [Book] 生体高分子化合物の結晶成長(第5版 実験化学講座5、化学実験のための基礎技術)2005

    • Author(s)
      井上豪, 松村浩由, 甲斐泰
    • Total Pages
      278-288
    • Publisher
      丸善(株)
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より

URL: 

Published: 2006-07-12   Modified: 2016-04-21  

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