2003 Fiscal Year Annual Research Report

外来・ベッドサイドで使用できる迅速SNP検出法「SNP-strip」の開発と応用

Research Project

Project/Area Number	15390111
Research Institution	Tohoku University
Principal Investigator	松原洋一東北大学, 大学院・医学系研究科, 教授 (00209602)
Co-Investigator(Kenkyū-buntansha)	青木洋子東北大学, 大学院・医学系研究科, 助手 (80332500) 鈴木洋一東北大学, 大学院・医学系研究科, 講師 (80216457) 呉繁夫東北大学, 大学院・医学系研究科, 助教授 (10205221)
Keywords	遺伝子診断法 / 遺伝子変異 / 遺伝子多型 / 薬物代謝酵素
Research Abstract	本研究の目的は、私たちが独自に考案したCASSOH法を用いて、ベッドサイドで簡便・迅速にsingle nucleotide polymorphism(SNP)が検出できる遺伝子診断法を開発し、その臨床応用を検討することである。本年度は、以下のような研究を行った。1.CASSOH法の技術的改良。原法では、それぞれの置換塩基に対応する2種の反応を個別に行う必要がある。そこで、核酸の標識分子を2種類とし、夫々の標識分子に対する抗体を用いることによって反応系を1つに統合し、single tubeでの遺伝子型判定を可能とするために、基礎的な検討を行った。次に、検体試料として、微量の全血を直接反応系に加えて用いることに成功し、前段階としてのDNA抽出を省略することが可能となった。2.定温度核酸増幅法の検討。原法では、PCR法による目的遺伝子の増幅を行った後に、遺伝子型判定を行っていた。しかしながら、外来・ベッドサイドでの診断にあたっては、PCR機器がない環境でも遺伝子判定を行なえることが望ましい。そこで、定温度遺伝子増幅法として開発されたLAMP法を検討して、CASSOH法と組み合わせることが可能であることを確認した。3.臨床応用の検討。薬物代謝酵素遺伝子多型と単一遺伝子病における高頻度点変異を対象にした遺伝子検査を確立した。具体的には、薬物代謝酵素多型(CYP2C9・CYP2C19・TPMY・NAT2)、薬物標的分子多型(アミノグリコシド系抗生剤によって難聴をひきおこすミトコンドリアA1555G変異)、高頻度変異が報告されている単一遺伝子病(糖原病Ia型、高グリシン血症、Tay-Sachs病、Gaucher病)について検査法を確立した。本手法は、ヒトゲノム解析研究の成果を臨床に還元するにあたって重要な役割を果たすものと予想される。

Research Products

(7 results)

All Other

All Publications (7 results)

[Publications] Matsubara Y ほか: "Detection of single nucleotide substitution by CASSOH with immunochromatographic strip"Human Mutation. 22. 166-172 (2003)
[Publications] Kudo Tほか: "Transgenic expression of a dominant-negative connexin26 causes degeneration of the organ of Corti and non-syndromic deafness"Human Molecular Genetics. 12. 995-1004 (2003)
[Publications] Kayano S ほか: "A significant association between nonsyndromic oral clefts and arylhydrocarbon receptor nuclear translocator(ARNT)"American Journal of Medical Genetics. (印刷中). (2004)
[Publications] Kojima K ほか: "Genetic testing of GSD type Ib in Japan : mutation spectrum in the G6P T1 gene and a rapid detection method for a prevalent W118R mutation"Molecular Genetics and Metabolism. (印刷中). (2004)
[Publications] Kayano S ほか: "Novel IRF6 mutations in Japanese patients with van der Woude syndrome : two missense mutations and a 17-kb deletion"Journal of Human Genetics. 48. 622-628 (2003)
[Publications] Kanno K ほか: "Association between nonsyndromic cleft lip with or without cleft palate and the GAD 67 gene in the Japanese population"American Journal of Medical Genetics. (印刷中). (2004)
[Publications] 松原洋一: "内科学第8版(杉本恒明ほか編)"朝倉書店. 2297 (2003)

2003 Fiscal Year Annual Research Report

外来・ベッドサイドで使用できる迅速SNP検出法「SNP-strip」の開発と応用

Principal Investigator

松原 洋一 東北大学, 大学院・医学系研究科, 教授 (00209602)

Research Products

[Publications] Matsubara Y ほか: "Detection of single nucleotide substitution by CASSOH with immunochromatographic strip"Human Mutation. 22. 166-172 (2003)

[Publications] Kudo Tほか: "Transgenic expression of a dominant-negative connexin26 causes degeneration of the organ of Corti and non-syndromic deafness"Human Molecular Genetics. 12. 995-1004 (2003)

[Publications] Kayano S ほか: "A significant association between nonsyndromic oral clefts and arylhydrocarbon receptor nuclear translocator(ARNT)"American Journal of Medical Genetics. (印刷中). (2004)

[Publications] Kojima K ほか: "Genetic testing of GSD type Ib in Japan : mutation spectrum in the G6P T1 gene and a rapid detection method for a prevalent W118R mutation"Molecular Genetics and Metabolism. (印刷中). (2004)

[Publications] Kayano S ほか: "Novel IRF6 mutations in Japanese patients with van der Woude syndrome : two missense mutations and a 17-kb deletion"Journal of Human Genetics. 48. 622-628 (2003)

[Publications] Kanno K ほか: "Association between nonsyndromic cleft lip with or without cleft palate and the GAD 67 gene in the Japanese population"American Journal of Medical Genetics. (印刷中). (2004)

[Publications] 松原洋一: "内科学 第8版(杉本恒明ほか編)"朝倉書店. 2297 (2003)

松原洋一東北大学, 大学院・医学系研究科, 教授 (00209602)

[Publications] 松原洋一: "内科学第8版(杉本恒明ほか編)"朝倉書店. 2297 (2003)