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2004 Fiscal Year Annual Research Report

網羅的SAGE解析とGICHIP開発による消化管癌の分子病態解明と診断応用

Research Project

Project/Area Number 15390116
Research InstitutionHIROSHIMA UNIVERSITY

Principal Investigator

安井 弥  広島大学, 大学院・医歯薬学総合研究科, 教授 (40191118)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 中山 宏文  広島大学, 大学院・医歯薬学総合研究科, 助教授 (50253068)
大上 直秀  広島大学, 大学院・医歯薬学総合研究科, 助手 (60346484)
KeywordsSAGE解析 / 胃癌 / Ex-STOMACHIP / CLDN18 / SNP
Research Abstract

SAGE法により、世界最大のSAGEライブラリーを完成し(GEO accession no.GSE545)、胃癌の発生・進展に関与する多くの遺伝子を同定してきた。胃癌SAGEライブラリーとデータベース中の主要な12種類の正常臓器のライブラリーとの比較から、癌特異的発現遺伝子候補をリストアップし、定量的RT-PCR法による実際の胃癌と正常臓器における発現解析により、少なくとも8遺伝子が特異的に発現することを見い出した。これらについて、抗体作成、ELISA系の構築を行った。一方、SAGEライブラリーの比較から、胃癌において発現が低下あるいは消失している遺伝子をリストアップし、定量的RT-PCRによってClaudin-18(CLDN18)遺伝子が65%の胃癌で発現抑制されていることを見い出した。CLDN18遺伝子の5'UTRにG/AのSNPが存在することを新規に見い出した。胃癌症例(154例)と健常対照症例(304例)におけるジェノタイプ解析を行ったところ、A/GおよびG/G型が胃癌症例で有意に高頻度であり、ORは5.17(95%CI:2.01-13.3)であった。
独自に作成したオリゴDNAアレイ(Ex-STOMACHIP)を用いて診断への導入について検討を行った。まず、SAGEで抽出した164の特異遺伝子とともに、既知の癌関連遺伝子、悪性度や薬剤感受性のマーカー遺伝子を含む合計で395遺伝子を搭載したアレイを作成した。20例の胃癌組織について遺伝子発現を解析し、T grade、N grade、Histologyなどを判別する有意な遺伝子群を抽出した。これらについて、定量的RT-PCR法にて多数症例について発現を検討し、発現レベルと臨床病理学的事項との関連を検証した。今後、そのいくつかについては、発現ベクターを作成し、生物学的機能について検討する予定である。

  • Research Products

    (12 results)

All 2005 2004

All Journal Article (12 results)

  • [Journal Article] Loss of heterozygosity and histone hypoacetylation of the PINX1 gene are associated with reduced expression in gastric carcinoma2005

    • Author(s)
      Kondo, T.
    • Journal Title

      Oncogene 24

      Pages: 157-164

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Journal Article] Histone H3 acetylation is associated with reduced p21^<WAF1/CIP1> expression in gastric carcinoma2005

    • Author(s)
      Mitani, Y.
    • Journal Title

      J.Pathol. 205

      Pages: 65-73

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Journal Article] A single nucleotide polymorphism of the MMP9 promoter affects tumor progression and invasive phenotype of gastric cancer2005

    • Author(s)
      Matsumura, S.
    • Journal Title

      J.Cancer Res.Clin.Oncol. 131

      Pages: 19-25

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Journal Article] Gene expression profile of gastric carcinoma : Identification of genes and tags potentially involved in invasion, metastasis and carcinogenesis by serial analysis of gene expression2004

    • Author(s)
      Oue, N.
    • Journal Title

      Cancer Res. 64

      Pages: 2397-2405

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Journal Article] Search for new biomarkers of gastric cancer through serial analysis of gene expression and its clinical implication2004

    • Author(s)
      Yasui, W.
    • Journal Title

      Cancer Sci. 95

      Pages: 385-392

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Journal Article] Expression of POT1 is associated with tumor stage and telomere length in gastric carcinoma2004

    • Author(s)
      Kondo, T.
    • Journal Title

      Cancer Res. 64

      Pages: 523-529

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Journal Article] Frequent epigenetic inactivation of RIZ1 by promoter hypermethylation in human gastric carcinoma2004

    • Author(s)
      Oshimo, Y.
    • Journal Title

      Int.J.Cancer 110

      Pages: 212-218

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Journal Article] Epigenetic inactivation of SOCS-1 by CpG island hypermethylation in human gastric carcinoma2004

    • Author(s)
      Oshimo, Y.
    • Journal Title

      Int.J.Cancer 112

      Pages: 1003-1009

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Journal Article] Frequent loss of RUNX3 expression by promoter hypermethylation in gastric carcinoma2004

    • Author(s)
      Oshimo, Y.
    • Journal Title

      Pathobiol. 71

      Pages: 137-143

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Journal Article] Presence of vascular adventitial fibroblastic cells in diffuse-type gastric carcinomas2004

    • Author(s)
      Nakayama, H.
    • Journal Title

      J.Clin.Pathol. 57

      Pages: 970-972

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Journal Article] A single nucleotide polymorphism in the MMP-1 promoter is correlated with histological differentiation of gastric cancer2004

    • Author(s)
      Matsumura, S.
    • Journal Title

      J.Cancer Res.Chin.Oncol. 130

      Pages: 259-265

  • [Journal Article] Expression of Cbl linking with the epidermal growth factor receptor system is associated with tumor progression and poor prognosis of human gastric carcinoma2004

    • Author(s)
      Ito, R.
    • Journal Title

      Virchow Arch. 444

      Pages: 324-331

URL: 

Published: 2006-07-12   Modified: 2016-04-21  

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