2004 Fiscal Year Annual Research Report
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15390257
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| Research Institution | FUKUSHIMA MEDICAL UNIVERSITY |
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Principal Investigator |
本間 好 福島県立医科大学, 医学部, 教授 (60192324)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
棟方 充 福島県立医科大学, 医学部, 教授 (00209991)
鎌滝 章央 福島県立医科大学, 医学部, 助手 (60360004)
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| Keywords | ゲノム / CpG島 / DNAメチル化 / マイクロアレイ / 細胞増殖因子 / シグナリング分子 |
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| Research Abstract |
本研究の目的は、特発性肺線維症の病態にエピジェネティクスが関与するかどうかを明らかにすることである。患者血液由来ゲノム16サンプルと患者肺線維芽細胞由来ゲノム2サンプルを用いて、それぞれ正常血液および肺線維芽細胞由来ゲノムを対照として、次の2つの方法によりエピジェネティクス状態を比較解析した。ひとつは、オリジナルゲノムアレイシステムを用いる方法である。ホメオボックス転写因子や細胞増殖・アポトーシスの情報伝達に関与するシグナル分子の遺伝子プロモーターCpG island断片を搭載するアレイを、各ゲノムサンプルよりメチル化ゲノム断片のみを増幅し蛍光ラベルして作製したプローブでスクリーニングを行った。もう一つは、正常および患者由来肺線維芽細胞からクロマチン免疫沈降法で回収したゲノム断片を比較解析する方法である。この方法では、同時に、肺線維芽細胞から回収したmRNAにより発現レベルの解析を行った。以上のスクリーニングから、DNAメチル化状態の異なる候補遺伝子を10数個選定した。現在、これらの遺伝子についてbisulfiteシーケンス法により個々のCpGのメチル化状態の解析を進めている。メチル化状態の違いが患者間で同様の傾向が認められるかどうか、正常サンプルとの違いが再現性良く観察できるかどうかについて検討する。また、各遺伝子の転写量を解析することによりメチル化と転写量との関連性を明らかにし、病態メカニズムに迫る。
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