2004 Fiscal Year Annual Research Report
海外コホートを用いたHIV曝露非感染状態を制御する宿主遺伝子の解析
Project/Area Number |
15406021
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Research Institution | Kinki University |
Principal Investigator |
宮澤 正顯 近畿大学, 医学部, 教授 (60167757)
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Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
河原 佐智代 近畿大学, 医学部, 講師 (60297629)
金成 安慶 近畿大学, 医学部, 助手 (60351590)
阿部 弘之 近畿大学, 医学部, 助手 (80309335)
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Keywords | エイズウイルス / 感染抵抗性 / 曝露非感染者 / 第22染色体 / 遺伝子多型 / 発現解析 / マイクロアレイ / 連鎖不平衡 |
Research Abstract |
イタリアコホートのHIV-1曝露非感染者42名、それらのHIV-1感染パートナー42名と同一地区・年齢層の他の感染者7名、及び同一地区・年齢層の非感染健常者47名を対象に、第22染色体マーカーの遺伝子型を決定した。その結果、D22S277遺伝子座について、対立遺伝子156または158を持つ者の頻度が、曝露非感染者群でHIV-1感染者群或いは健常者群のおよそ4倍高く、多重比較補正後も有意差があること(p=0.038-O.045)、D22S423についても、対立遺伝子229の頻度が曝露非感染者群で感染者群の4倍以上高く、多重比較補正後も有意差があること(p=0.032)が示された。また、感染者および健常者群ではD22S284からD22S1166に至る連鎖不平衡が認められるが、曝露非感染者群では、この領域の連鎖不平衡がD22S276座で分断されていた。 そこで、上記候補遺伝子存在範囲を含むMb遺伝子からPacsin2遺伝子までの領域について、そこに含まれる全既知遺伝子、および機能未同定のopen reading framesを網羅したDNAマイクロアレイを作製した。イタリアコホートの曝露非感染者及び感染者の末梢血単核球を、HIV-1 gag及びenv抗原ペプチド混合物で刺激前後RNAを抽出し、発現解析を行ったところ、少数の遺伝子について、曝露非感染者でのみその発現が刺激6時間後に増加していた。また、曝露非感染者でHIV抗原刺激により発現が誘導される遺伝子の内部、または近傍に存在する単一塩基多型(SNPs)について、それらの頻度をイタリア及びタイ・ランパンコホートで解析した。その結果、少なくともイタリアコホートの曝露非感染者で、一候補遺伝子内のSNPとD22S423の遺伝子型に強い連鎖が見られたが、感染者や健常人ではそのような連鎖は認められなかった。
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[Journal Article] Genotypes at chromosome 22q12-13 are associated with HIV-1-exposed but uninfected status in Italians2005
Author(s)
Kanari, Y., M.Clerici, H.Abe, H.Kawabata, D.Trabattoni, S.Lo Caputo, F.Mazzotta, H.Fujisawa, A.Niwa, C.Ishihara, Y.A.Takei, M.Miyazawa
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Journal Title
Description
「研究成果報告書概要(和文)」より
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[Journal Article] Cytotoxic T lymphocyte-based control of simian immunodeficiency virus replication in a preclinical AIDS vaccine trial2004
Author(s)
Matano, T., M.Kobayashi, H.Igarashi, A.Takeda, H.Nakamura, M.Kano, C.Sugimoto, K.Mori, A.Iida, T.Hirata, M.Hasegawa, T.Yuasa, M.Miyazawa.Y.Takahashi, M.Yasunami, A.Kimura, D.H.O'Connor, D.I.Watkins, Y.Nagai
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Journal Title
J.Exp.Med. 199
Pages: 1709-1718
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[Patent(Industrial Property Rights)] Resistance Genes2004
Inventor(s)
Miyazawa, M., M.Clerici, S.Irie
Industrial Property Rights Holder
Immunoclin Ltd., Osaka Idustrial Promotion Organization, Toppan Printing Co.
Industrial Property Number
UK Patent Application 0428301.6
Filing Date
2004-12-23