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2004 Fiscal Year Annual Research Report

高等植物のエタノール耐性に関わるGEK1遺伝子の機能解析

Research Project

Project/Area Number 15570045
Research InstitutionRIKEN

Principal Investigator

平山 隆志  独立行政法人理化学研究所, 篠崎植物分子生物学研究室, 先任研究員 (10228819)

Keywordsシロイヌナズナ / エタノール感受性 / NMR測定 / 古細菌
Research Abstract

主に以下の研究を行った。
1.変異株を用いた解析
これまでの研究から、GEK1遺伝子がエタノールの代謝、もしくはその近辺で機能していると考えられたので、13C,15Nでラベルした植物を用いての多次元NMR測定による代謝物解析を試みた。その結果、gek1変異株ではエタノール存在下で、野生株に比べアミノ酸などの代謝が活性化していることが明らかとなったが、エタノール感受性を引き起こす原因物質を同定するにはいたらなかった。また、マイクロアレー解析を行い、gek1変異株の生理的状態を発現遺伝子から推測することを試みた。その結果、ストレス誘導性遺伝子の発現が認められたが、特別な遺伝子群が影響を受けているということは見いだせなかった。また、gek1抑制変異株を分離し解析を試みた。いくつかの候補変異株が得られたが、今まで調べた限りでは、それらはadh1変異であることが判明した。
2.組換えGEK1蛋白質の解析
大腸菌で発現させたGEK1組換え蛋白質を用いて生化学的活性の同定を試みた。エタノールの代謝物であるアセトアルデヒドが毒性を持つことから、これの分解活性を調べた。様々な条件で調べたが結局、そのような活性は見いだせなかった。可能性としてシロイヌナズナのGEK1蛋白質が不安定である可能性もあったので、構造的に安定と考えられる好高熱菌P.horikosiiのGEK1類似遺伝子の組換え蛋白質を入手し、活性測定を行った。しかし、アセトアルデヒドの分解活性は見いだせなかった。この蛋白質を13C,15Nでラベルした植物の抽出物に混合し、NMR測定により代謝物シグナルの変化の検出を試みた。しかし、残念ながら顕著な変化は見いだせなかった。また、酵母two-hybrid系を用いてGEK1と相互作用するシロイヌナズナ蛋白質の同定を試みた。その結果、ある類似した2つの蛋白質が選択された。

  • Research Products

    (7 results)

All 2004

All Journal Article (5 results) Book (1 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Journal Article] A novel ethanol-hypersensitive mutant of Arabidopsis2004

    • Author(s)
      Hirayama, et al.
    • Journal Title

      Plant & Cell Physiology 45

      Pages: 703-711

  • [Journal Article] A novel Arabidopsis gene required for ethanol tolerance is conserved among plants and archaea2004

    • Author(s)
      Fujishige, N. et al.
    • Journal Title

      Plant & Cell Physiology 45

      Pages: 659-666

  • [Journal Article] Stable isotope labeling of Arabidopsis thaliana for an NMR-based metabolomics approach2004

    • Author(s)
      Kikuchi, J. et al.
    • Journal Title

      Plant & Cell Physiology 45

      Pages: 1099-1104

  • [Journal Article] Isolation and characterization of novel mutants affecting the abscisic acid sensitivity of Arabidopsis germination and seedling growth2004

    • Author(s)
      Nishimura et al.
    • Journal Title

      Plant & Cell Physiology 45

      Pages: 1485-1499

  • [Journal Article] A collection of 11 800 single-copy Ds transposon insertion lines in Arabidopsis2004

    • Author(s)
      Kuromori et al.
    • Journal Title

      Plant Journal 37

      Pages: 897-905

  • [Book] 細胞工学別冊、植物細胞工学20、植物ホルモンのシグナル伝達2004

    • Author(s)
      平山 隆志
    • Total Pages
      151-163
    • Publisher
      エチレンのシグナル伝達
  • [Patent(Industrial Property Rights)] エタノール耐性遺伝子を用いる形質転換植物の選抜方法及びそのための形質転換ベクタ2004

    • Inventor(s)
      平山隆志, 篠崎一雄
    • Industrial Property Rights Holder
      (独)理化学研究所
    • Industrial Property Number
      特願2004-183854号
    • Filing Date
      2004-06-22

URL: 

Published: 2006-07-12   Modified: 2016-04-21  

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