2003 Fiscal Year Annual Research Report
遺伝子発現プロファイルを用いた生薬のフィンガープリント作成とターゲット分子の同定
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15590598
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| Research Institution | Yamaguchi University |
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Principal Investigator |
飯塚 徳男 山口大学, 医学部, 寄附講座教員 (80332807)
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| Keywords | DNAマイクロアレイ / 生薬 / フィンガープリント / アルカロイド / 膵臓癌 |
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| Research Abstract |
本研究では近年登場したDNAマイクロアレイ技術により、天然生薬構成成分のターゲット遺伝子を同定し、の生物学的作用をプロファイリングすることにより、「whole drugとしての生薬とpurifyされた各成分の作用がどのように違うのか?」といった問題の解決をin silico studyで行うことである。
1.我々は、まず、ヒト肝癌におけるDNAマイクロアレイ解析にて、アルゴリズムの開発・整備を行い多くの論文でその有用性を報告した(Lancet 2003, 0ncogene 2003, FEBS lett.2003, Int J Oncol 2004)。
2.膵臓癌細胞8株において、huU95A^<【○!R】>(Affymetrix, Santa Clara, CA)を用いた12600遺伝子のDNAマイクロアレイ解析を行い、遺伝子発現プロファイルを作成した。
この8株に対し、生薬黄連と主成分berberineのターゲット遺伝子のスペクトルを検討した。
すなわち、感受性(ID50)とその発現が相関する遺伝子の同定を行ったところ、一部の遺伝子は生薬黄連と主成分berberineの共通のターゲットであることが判明し、Int J Cancer(2003)にて報告した。
3.現在、黄連構成成分である(berberine, palmatin, groenlandicine, epiberberine, coptisine, berberrubine, columbamine, tetrahydroberberine)の分離作業は終了しており、その増殖抑制効果をMTT assayにて検討し、各ID50と発現量の相関する遺伝子をリストしていく作業が進行中である。
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[Publications] Iizuka N, et al.: "Oligonucleotide microarray for prediction of early intrahepatic recurrence of hepatocellular carcinoma after curative resection"Lancet. 361. 923-929 (2003)
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[Publications] Iizuka N, et al.: "Telomerase activity and Nm23-H2 protein expression in hepatocellular carcinoma"Anticancer Resarch. 23. 43-47 (2003)
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[Publications] Iizuka N, et al.: "Differential gene expression in distinct virologic types of hepatocellular carcinoma : association with liver cirrhosis"Oncogene. 22. 3007-3014 (2003)
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[Publications] Iizuka N, et al.: "Identification of common or distinct genes related to antitumor activities of a medicinal herb and its major component"International Journal of Cancer. 107. 666-672 (2003)
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[Publications] Okada T, Iizuka N, et al.: "Gene expression profile linked to p53 status in hepatitis C virus-related hepatocellular carcinoma"FEBS Letters. 555. 583-590 (2003)
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[Publications] Iizuka N, et al.: "Molecular signature in three types of hepatocellular carcinoma with different viral origin by oligonucleotide microarray"International Journal of Oncology. 24. 565-574 (2004)
