2003 Fiscal Year Annual Research Report
SAGE同定新規胃癌関連遺伝子に対するaptamerによる組織局在と増殖制御
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15659086
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| Research Institution | Hiroshima University |
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Principal Investigator |
安井 弥 広島大学, 大学院・医歯薬学総合研究科, 教授 (40191118)
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| Keywords | SAGE法 / 胃癌 / aptamer / SELEX法 / REGIV / 網羅的遺伝子発現解析 / 組織局在 / 増殖抑制 |
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| Research Abstract |
SAGE(serial analysis of gene expression)法により、胃癌について網羅的遺伝子発現を行い、胃癌と非癌部胃粘膜とのSAGEライブラリーの比較から、胃癌で特異的に高発現する様々な遺伝子を同定した。その内、カルシウム依存性レクチンスーパーファミリーに属するregenerating gene type IV(REGIV)は、遺伝子導入系を用いた機能解析から、分泌蛋白をコードすること、アポトーシスを抑制すること等を見い出した。そこで、SELEX(systematic evolution of ligands by exponential enrichment)法により、RNA aptamerの精製を試みた。まず、RT反応およびPCRにより全長cDNAを調整し、これを6xHisタグした後に、発現ベクター(pCE-30UA)に組み込み、大腸菌で大量培養した。得られた6xHisタグ標識蛋白は、金属キレート・アフィニティークロマトグラフィーを用いて精製した。次に、両端にfixed sequenceを持ち中央部に40塩基のランダムsequenceを含むオリゴヌクレオチドライブラリー(1micro-moleスケール当り10^<14>種類程度)をsolid-phase synthesizerにて10^<14>種類程度で作成した。これをstarting poolとし、合成したREGIV蛋白と反応させた後、ニトロセルロースフィルターで結合したオリゴヌクレオチドをfixed sequenceをプライマーとしてPCRで増幅、この結合、分別、増幅のサイクルを10回以上繰り返した。特異的結合は、ゲルシフトアッセイで確認中である。特異的かつ親和性の高いオリゴヌクレオチドが得られ次第、PCRで増幅しaptamerとする予定である。
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[Publications] Yasui W: "Histone acetylation and gastrointestinal carcinogenesis"Ann NY Acad Sci. 983. 220-231 (2003)
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[Publications] Ito R: "Expression of integrin-linked kinase is closely correlated with invasion and metastasis of gastric carcinoma"Virchow Arch. 442. 118-123 (2003)
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[Publications] Oue N: "Expression of the TSP-1 gene and its association with promoter hypermethylation in gastric carcinomas"Oncology. 64. 423-429 (2003)
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[Publications] Kitadai Y: "Helicobacter Pylori infection influences expression of genes related to angiogenesis and invasion in human gastric carcinoma cells"Biochem Biophys Res Commun. 311. 809-814 (2003)
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[Publications] Kondo T: "Expression of POT1 is associated with tumor stage and telomere length in gastric carcinoma"Cancer Res. 64. 523-529 (2004)
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[Publications] Oue N: "Gene expression profile of gastric carcinoma : Identification of genes and tags potentially involved in invasion, metastasis and carcinogenesis by serial analysis of gene expression"Cancer Res. (印刷中). (2004)
