SAGE同定新規胃癌関連遺伝子に対するaptamerによる組織局在と増殖制御

2003 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 15659086
• Research Institution: Hiroshima University
• Principal Investigator: 安井 弥 広島大学, 大学院・医歯薬学総合研究科, 教授 (40191118)
• Keywords: SAGE法 / 胃癌 / aptamer / SELEX法 / REGIV / 網羅的遺伝子発現解析 / 組織局在 / 増殖抑制

Research Abstract

SAGE(serial analysis of gene expression)法により、胃癌について網羅的遺伝子発現を行い、胃癌と非癌部胃粘膜とのSAGEライブラリーの比較から、胃癌で特異的に高発現する様々な遺伝子を同定した。その内、カルシウム依存性レクチンスーパーファミリーに属するregenerating gene type IV(REGIV)は、遺伝子導入系を用いた機能解析から、分泌蛋白をコードすること、アポトーシスを抑制すること等を見い出した。そこで、SELEX(systematic evolution of ligands by exponential enrichment)法により、RNA aptamerの精製を試みた。まず、RT反応およびPCRにより全長cDNAを調整し、これを6xHisタグした後に、発現ベクター(pCE-30UA)に組み込み、大腸菌で大量培養した。得られた6xHisタグ標識蛋白は、金属キレート・アフィニティークロマトグラフィーを用いて精製した。次に、両端にfixed sequenceを持ち中央部に40塩基のランダムsequenceを含むオリゴヌクレオチドライブラリー(1micro-moleスケール当り10^<14>種類程度)をsolid-phase synthesizerにて10^<14>種類程度で作成した。これをstarting poolとし、合成したREGIV蛋白と反応させた後、ニトロセルロースフィルターで結合したオリゴヌクレオチドをfixed sequenceをプライマーとしてPCRで増幅、この結合、分別、増幅のサイクルを10回以上繰り返した。特異的結合は、ゲルシフトアッセイで確認中である。特異的かつ親和性の高いオリゴヌクレオチドが得られ次第、PCRで増幅しaptamerとする予定である。

Research Products

• [Publications] Yasui W: "Histone acetylation and gastrointestinal carcinogenesis"Ann NY Acad Sci. 983. 220-231 (2003)
• [Publications] Ito R: "Expression of integrin-linked kinase is closely correlated with invasion and metastasis of gastric carcinoma"Virchow Arch. 442. 118-123 (2003)
• [Publications] Oue N: "Expression of the TSP-1 gene and its association with promoter hypermethylation in gastric carcinomas"Oncology. 64. 423-429 (2003)
• [Publications] Kitadai Y: "Helicobacter Pylori infection influences expression of genes related to angiogenesis and invasion in human gastric carcinoma cells"Biochem Biophys Res Commun. 311. 809-814 (2003)
• [Publications] Kondo T: "Expression of POT1 is associated with tumor stage and telomere length in gastric carcinoma"Cancer Res. 64. 523-529 (2004)
• [Publications] Oue N: "Gene expression profile of gastric carcinoma : Identification of genes and tags potentially involved in invasion, metastasis and carcinogenesis by serial analysis of gene expression"Cancer Res. (印刷中). (2004)