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2007 Fiscal Year Annual Research Report

概日時計により統合されるシアノバクテリアの細胞システムの時間的統合

Research Project

Project/Area Number 15GS0308
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

近藤 孝男  Nagoya University, 大学院・理学研究科, 教授 (10124223)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 岩崎 秀雄  早稲田大学, 理工学術院, 准教授 (00324393)
小山 時隆  名古屋大学, 理学研究科, 助教 (30324396)
Keywords概日時計 / シアノバクテリア / 時計タンパク質 / ATPace / KaiC
Research Abstract

本研究ではシアノバクテリア(Syneachococcus elongatus PCC 7942)で概日時計を中心としたシステムを解明することを目指している。今年度は2005年発見した試験管内での概日時計再構成系を中心に解析を行い、以下の成果をえた。
KaiCリン酸化リズムの自己同調機構
KaiCリン酸化リズムは10日以上減衰せずに観察される。位相が4時間ずつ異なる再構成系を等量6つ混合してみた混合試料ではリズムは消失するという予想に反し、振動は特定の位相から混合前と全く変わらない明瞭なリズムを示した。これはKaiCリン酸化リズムのシステム内部に同期機構が存在し、位相の異なるKaiCを同位相にそろえる事が可能であることを示している。KaiCを混合し経過を観察した結果、脱リン酸化初期のKaiCは他の位相を自分の位相に引き込むことが明らかとなった。この同期現象により新規のKaiCの合成が予想される細胞内でKaiCリン酸化リズム安定して持続すると考えられる(Nature Struct Mol Biol 2008)。
リン酸化によらないKaiCによる転写制御サイクル
KaiCのリン酸化状態を固定した細胞でも温度補償された自律振動が発生することを見出した。この転写制御サイクルの周期はKaiCにより支配されており、KaiCの未知の機能により、遺伝子発現が制御され、細胞内振動機構が駆動されていることが示された。(Gene & Dev 2008)。
温度サイクルによるKaiCリン酸化リズムの同調
KaiCリン酸化リズムを様々な温度サイクルに置くと位相が温度サイクルに同調することを見出した。同調のメカニズムの詳細な解析から、同調は温度シフトによる位相変位として予想されるもの一致することが明らかになった。すなわち、温度変化はKaiC分子に直接刺激を与えることで、その振動発生機構を調整し、同調を可能としていることが示された。(PNAS 2009)

  • Research Products

    (42 results)

All 2008 2007 Other

All Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 7 results) Presentation (33 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] Dual KaiC-based oscillations constitute the circadian system of cyanobacteria2008

    • Author(s)
      Kitayama Y, Nishiwaki T, Terauchi K, Kondo T
    • Journal Title

      Genes & Development 22

      Pages: 1513-1521

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Functional conservation of clock-related genes in flowering plants: overexpression and RNAi analyses of the circadian rhythm in the monocotyledon Lemna gibba2008

    • Author(s)
      Serikawa M, Miwa K, Kondo T, Oyama T
    • Journal Title

      Plant Physiology 146

      Pages: 1952-1963

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Autonomous synchronization of the circadianKaiC phosphorylation rhythm2007

    • Author(s)
      Ito H, Kageyama H, Mutsuda M, Nakajima M, Oyama T, Kondo T.
    • Journal Title

      Nature Struct Mol Biol 14

      Pages: 1084-1088

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A sequential program of dual phosphorylation of KaiC as a basis for circadian rhythm in cyanobacteria2007

    • Author(s)
      Nishiwaki T, Satomi Y, Kitayama Y, Terauchi K, Kiyohara R, Takao Toshifumi, Kondo T
    • Journal Title

      EMBO J 26

      Pages: 4029-4037

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Regulation of Circadian Clock Gene Expression by Phosphorylation States of KaiC in Cyanobacteria2007

    • Author(s)
      Murayama Y, Oyama T, Kondo T
    • Journal Title

      J. Bacteriol 190

      Pages: 1691-1698

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] ATPase activity of KaiC determines the basic timing for circadian clock of cyanobacteria2007

    • Author(s)
      Terauchi K, Kitayama Y, Nishiwaki T, Miwa K, Murayama Y, Oyama T, Kondo T
    • Journal Title

      Proc. Natl Acad. Sci. USA 104

      Pages: 16377-16381

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] labA: a novel gene required for negative feedback regulation of the cyanobacterial circadian clock protein KaiC2007

    • Author(s)
      Taniguchi Y, Katayama M, Ito R, Takail N, Kondo T, Oyama, T
    • Journal Title

      Genes & Dev 21

      Pages: 60-70

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] The ATPase activity of the cyanobacterial clock protein KaiC2008

    • Author(s)
      寺内一姫、西脇妙子、北山陽子、近藤孝男
    • Organizer
      The 22nd Symposium of the Protein Society
    • Place of Presentation
      USA
    • Year and Date
      20080719-20080723
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Presentation] シアノバクテリアの時計タンパク質KaiCによる概日遺伝子発現制御2008

    • Author(s)
      村山依子、小山時隆、近藤孝男
    • Organizer
      第49回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      札幌
    • Year and Date
      20080320-20080322
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Presentation] ウキクサのCONSTANSホモログの発現と機能の解析2008

    • Author(s)
      三輪久美子, 芹川雅之, 近藤孝男, 小山時隆
    • Organizer
      第49回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      札幌
    • Year and Date
      20080320-20080322
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Presentation] シアノバクテリア時計タンパク質KaiCの生化学的解析による概日時計の分子機構2008

    • Author(s)
      寺内一姫、西脇妙子、北山陽子、近藤孝男
    • Organizer
      第49回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      札幌
    • Year and Date
      20080320-20080322
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Presentation] シアノバクテリア概日時計調節因子DnaAの同定と解析2008

    • Author(s)
      北山陽子、西脇妙子、近藤孝男
    • Organizer
      第49回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      札幌
    • Year and Date
      20080320-20080322
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Presentation] 時計タンパク質KaiCが制御するシアノバクテリアの概日時計システム2008

    • Author(s)
      北山陽子, 近藤孝男
    • Organizer
      日本遺伝学会第80回年会(招待講演)
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      2008-09-04
  • [Presentation] Circadian timing in vitro by clock protein KaiC of cyanobacteria2008

    • Author(s)
      Takao Kondo
    • Organizer
      80th Ann Meeting of Genetic Society of Japan(招待講演)
    • Place of Presentation
      Nagoya, Japan
    • Year and Date
      2008-09-03
  • [Presentation] The Network of Clock-Controlled Genes in Cyanobacteria2008

    • Author(s)
      Hiroshi Ito, Michinori Mutsuda, Yoriko Murayama, Norimune Hosokawa, Chieko Sugita, Mamoru Sugita, Takao Kondo, Hideo Iwasaki
    • Organizer
      Society for Research on Biological Rhythms 11th Biennial Meeting
    • Place of Presentation
      USA
    • Year and Date
      2008-05-19
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Presentation] The Responses of Circadian Gene Expression to Skeleton Photoperiod in a Short-Day Plant Lemna Paucicostata 67462008

    • Author(s)
      Kumiko Ito, Masayuki Serikawa, Tokitaka Oyama, Takao Kondo
    • Organizer
      Society for Research on Biological Rhythms 11th Biennial Meeting
    • Place of Presentation
      USA
    • Year and Date
      2008-05-19
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Presentation] Non-parametric temperature entrainment of in vitro KaiC phosphorylation rhythm2008

    • Author(s)
      Takuya Yoshida, Yoriko Murayama, Hiroshi Ito, Hakuto Kageyama, Takao Kondo
    • Organizer
      Society for Research on Biological Rhythms 11th Biennial Meeting
    • Place of Presentation
      USA
    • Year and Date
      2008-05-19
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Presentation] 単子葉植物ウキクサを用いた植物における概日時計遺伝子機能の保存性の解析2008

    • Author(s)
      芹川雅之、三輪久美子、近藤孝男、小山時隆
    • Organizer
      第49回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      札幌
    • Year and Date
      2008-03-20
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Presentation] Lemna属ウキクサを材料にした分子生物学・遺伝学的実験系の確立に向けた取り組み2008

    • Author(s)
      小山時隆, 佐藤みどり, 鈴木咲弥香, 芹川雅之, 三輪久美子, 今井圭子, 近藤孝男
    • Organizer
      第49回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      札幌
    • Year and Date
      2008-03-20
  • [Presentation] Origine of the Resilience of Cyanobacterial Circadian Clock2008

    • Author(s)
      伊藤浩史
    • Organizer
      Japan-Taiwan Young Researchers Conference on Computational and Systems Biology
    • Place of Presentation
      Taiwan
    • Year and Date
      2008-03-10
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Presentation] シアノバクテリア概日時計安定性の起源2008

    • Author(s)
      伊藤浩史, 陸田径典, 影山伯春, 小山時隆, 近藤孝男
    • Organizer
      生物の理論研究会生物理論の前後左右
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2008-03-07
  • [Presentation] 概日時計タンパク質のリン酸化2008

    • Author(s)
      大川妙子、近藤孝男
    • Organizer
      大阪大学蛋白質研究所セミナー「タンパク質翻訳後修飾」
    • Place of Presentation
      大阪
    • Year and Date
      2008-01-11
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Presentation] Regulation of circadian gene expression by KaiC in cyanobacteria2007

    • Author(s)
      村山依子, 小山時隆, 近藤孝男
    • Organizer
      2nd World Congress of Chronobiology
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      20071104-20071106
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Presentation] The responses of circadian gene expression to skeleton photoperiod in a short-day plant Lemna paucicostata 67462007

    • Author(s)
      三輪久美子, 芹川雅之, 小山時隆, 近藤孝男
    • Organizer
      2nd World Congress of Chronobiology
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      20071104-20071106
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Presentation] The fluorescent reporter system that enables automatic real-time monitoring of dynamic interactions of cyanobacterial Kai proteins in vitro2007

    • Author(s)
      合田和史、小山時隆、近藤孝男
    • Organizer
      2nd World Congress of Chronobiology
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      20071104-20071106
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Presentation] Synchronization of a circadian clock in vitro2007

    • Author(s)
      伊藤浩史, 景山伯春, 陸田径典, 小山時隆, 近藤孝男
    • Organizer
      The Joint Annual Meetings of the Society for Mathematical Biology and the Japanese Society for Mathematical Biology
    • Place of Presentation
      San Jose, USA
    • Year and Date
      20070731-20070803
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Presentation] CIRCADIAN CLOCK OF CYANOBACTERIA WITH Kai-OSCILLATOR2007

    • Author(s)
      近藤孝男
    • Organizer
      72nd CSHL SYMPOSIUM: CLOCKS & RHYTHMS
    • Place of Presentation
      USA
    • Year and Date
      20070530-20070604
  • [Presentation] The resilience of the cyanobacterial circadian clock embeded in the Kai-protein oscillatory system in vitro2007

    • Author(s)
      Tokitaka Oyama, Hiroshi Ito, Hakuto Kageyama, Michinori Mutsuda, Takao Kondo
    • Organizer
      Cold Spring Harbor 72nd Symposium: Clocks & Rhythms, Cold Spring Harbor laboratory
    • Place of Presentation
      NY, USA
    • Year and Date
      20070530-20070604
  • [Presentation] The ATPase activity of KaiC as the circadian timer in cyanobacteria2007

    • Author(s)
      Kazuki Terauchi, Yohko Kitayama, Taeko Nishiwaki, Takao Kondo
    • Organizer
      Cold Spring Harbor 72nd Symposium: Clocks & Rhythms, Cold Spring Harbor laboratory
    • Place of Presentation
      Cold Spring harbor, NY, USA
    • Year and Date
      20070530-20070604
  • [Presentation] A sequential program of dual phosphorylations of KaiC as a basis for circadian oscillation in cyanobacteria2007

    • Author(s)
      Nishiwaki T, Satomi Y, Kitayama Y, Terauchi K, Kiyohara R, Oyama T, Takao T, Kondo T
    • Organizer
      Cold Spring Harbor 72nd Symposium: Clocks & Rhythms, Cold Spring Harbor laboratory
    • Place of Presentation
      Cold Spring harbor, NY, USA
    • Year and Date
      20070530-20070604
  • [Presentation] KaiC as the Circadian Time Base of Cyanobacterial Clock2007

    • Author(s)
      近藤孝男
    • Organizer
      Gordon Research conference; CHRONOBIOLOGY
    • Place of Presentation
      Aussois, France
    • Year and Date
      20070506-20070511
  • [Presentation] 概日時計試験管内再構成系の同期と特異点2007

    • Author(s)
      伊藤浩史, 宮崎真帆, 影山伯春, 陸田径典, 小山時隆, 近藤孝男
    • Organizer
      日本生物物理学会第45回年会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2007-12-21
  • [Presentation] KaiCリン酸化リズム再構成系の安定性2007

    • Author(s)
      伊藤浩史、陸田径典、影山伯春、小山時隆、近藤孝男
    • Organizer
      「細胞を創る」研究会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2007-11-26
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Presentation] シアノバクテリア時計タンパク質の突然変異に対する周期安定性の評価2007

    • Author(s)
      西岡有希乃、小山時隆、近藤孝男
    • Organizer
      第14回日本時間生物学会学術大会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2007-11-07
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Presentation] Origin of the resilience of the cyanobacterial circadian clock2007

    • Author(s)
      伊藤浩史
    • Organizer
      第14回日本時間生物学会学術大会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2007-11-07
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Presentation] シアノバクテリアの概日時計周期決定機構の遺伝的安定性の評価2007

    • Author(s)
      小山時隆, 西岡有希乃, 近藤孝男
    • Organizer
      日本進化学会年会第9回
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      2007-09-01
  • [Presentation] The cyanobacterial circadian clockwork made of three Kai proteins2007

    • Author(s)
      小山時隆、近藤孝男
    • Organizer
      The Joint Annual Meetings of the Society for Mathematical Biology and the Japanese Society for Mathematical Biology
    • Place of Presentation
      San Jose, USA
    • Year and Date
      2007-08-03
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Presentation] KaiCの二箇所のリン酸化部位によるシアノバクテリア概日リズム発生制御機構2007

    • Author(s)
      北山陽子、西脇妙子、里見佳典、寺内一姫、清原玲子、高尾敏文、近藤孝男
    • Organizer
      日本生化学学会中部支部大会
    • Place of Presentation
      名古屋市
    • Year and Date
      2007-05-19
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Presentation] 概日時計の周期と温度補償性を決めるKaiCのATPase活性2007

    • Author(s)
      寺内一姫、北山陽子、西脇妙子、近藤孝男
    • Organizer
      第71回日本生化学会中部支部例会
    • Place of Presentation
      名古屋市
    • Year and Date
      2007-05-19
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Presentation] KaiCリン酸化振動再構成系の安定性2007

    • Author(s)
      伊藤浩史、陸田径典、景山伯春、小山時隆、近藤孝男
    • Organizer
      第71回日本生化学会中部支部例会
    • Place of Presentation
      名古屋市
    • Year and Date
      2007-05-19
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.brh.co.jp/s_library/j_site/scientistweb/no55/

  • [Remarks]

    • URL

      http://clock.bio.nagoya-u.ac.jp/web/

URL: 

Published: 2010-06-11   Modified: 2016-04-21  

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