2017 Fiscal Year Annual Research Report
Creation of new genome science using chemical tools to precisely detect modification and damage of human genome
| Project/Area Number |
15H02189
|
|---|
| Research Institution | National Institute for Materials Science |
|---|
Principal Investigator |
小宮山 眞 国立研究開発法人物質・材料研究機構, 国際ナノアーキテクトニクス研究拠点, NIMS招聘研究員 (50133096)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2015-04-01 – 2018-03-31
|
| Keywords | ゲノム / PNA / インベージョン / ゲノム断片分離 / DNA結合タンパク質 |
|---|
| Outline of Annual Research Achievements |
本研究で開発した、PNAをプローブとして、ヒトゲノムから所定断片を効率的かつ高純度に抽出するアフィニティー分離系の改良に取り組んだ。昨年度に得られたPNA/DNA複合体形成、安定性の基礎的データをもとに様々な条件を検討したが、残念ながら従来系を超える系の構築には至らなかった。一方で、昨年度の解析では、通常は2本のPNAを使用してPNA/DNA複合体を形成させるが、配列に依存するものの、1本のPNAのみでも分離可能なことが見いだされていた。そこで、1本のPNAのみ使用した複合体形成について解析を行ったところ、PNA中に修飾塩基を導入することが必須であることが明らかとなった。これをアフィニティー分離系に応用できれば、系の低コスト化、簡便化につながると期待される。
本研究の目的である”分子情報に基づくニュー・ゲノム科学”の構築を目指し、開発したアフィニティー分離系を用いて抽出した分離断片の分子情報の解析も行った。ヒトゲノムから所定断片をアフィニティー分離し、溶出させずビーズに固定化した状態のまま核抽出液と反応させることで、所定断片に結合するタンパク質画分を得た。得られたタンパク質画分をウエスタン解析や質量分析することにより、今後精査する必要はあるが、結合タンパク質の一部を同定することができた。本系の構築は、ゲノムの所定の領域に結合するタンパク質因子を明らかにし、ゲノム機能の全容解明に寄与するものである。
|
| Research Progress Status |
29年度が最終年度であるため、記入しない。
|
| Strategy for Future Research Activity |
29年度が最終年度であるため、記入しない。
|
