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2015 Fiscal Year Annual Research Report

三次元多様性を分子設計上の鍵概念とする論理的創薬方法論の確立

Research Project

Project/Area Number 15H02495
Research InstitutionHokkaido University

Principal Investigator

周東 智  北海道大学, 薬学研究科(研究院), 教授 (70241346)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 福田 隼  北海道大学, 薬学研究科(研究院), 助教 (30434450)
一ノ瀬 亘  北海道大学, 薬学研究科(研究院), 特別研究員 (00636409)
有澤 光弘  大阪大学, 薬学研究科, 准教授 (40312962)
山口 浩明  東北大学, 大学病院, 准教授 (80400373)
小松 康雄  国立研究開発法人産業技術総合研究所, 生物プロセス研究部門, 研究グループ長 (30271670)
Project Period (FY) 2015-04-01 – 2020-03-31
Keywordsシクロプロパン / 三次元多様性 / レゾルビン / ヌクレオシド / ペプチドミメティクス / ライブラリー
Outline of Annual Research Achievements

本課題では、シクロプロパンの構造特性に基づく三次元的多様性を鍵とする独自の分子設計を基盤として、困難かつ挑戦的な創薬化学研究を展開している。具体的には計画した4つの課題に取り組んだ。その成果を以下に述べる。
1.レゾルビン創薬化学: RvE2の11,12-位をオレフィン等価構造であるcis-シクロプロパンで置換したCPRvE2の効率的合成法を確立し、CPRvE2が予想通りRvE2安定等価体であること示した。さらに、RvE2の5位及び19位デオキシ体を合成した。RvE1については、全合成を達成した。βCPRvE2またはαCPRvE2を今後の研究におけるリード構造として有用であることが明らかとなった。
2.プロレニン受容体リガンド:当初の目的であるプロレニン基本ミメティックII (中央部残基X/Y = leu/Leu, Phe/Lys, Leu/Arg) の合成法を確立した。連続する3つの不斉点の構築が課題であったが、Ellman不斉補助基を用いるGrignard反応を鍵としてその構築に成功した。
3.核酸創薬:塩基部とシクロプロパン水酸基とを三次元的多様に制御した3種類のシクロプロパンヌクレオシド (CPNs) 骨格の合成法確立に成功した。
4.低分子ライブラリー:Pd触媒C-H活性化を経るアリールシクロプロパン類の収束的構築に成功した。本反応を鍵として、1,2,3-三置換アリールシクロプロパン及び1,1,2-トリアルキル置換シクロプロパンの効率的合成法を確立した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

以下に述べるように、各課題についておおむね順調に研究が進展している。
1.レゾルビン創薬化学: RvE2の11,12-位オレフィンをcis-シクロプロパンで置換したCPRvE2の効率的合成法を確立したのみならず、CPRcE2がRvE2の安定等価体として機能するという作業仮説を証明する成果を得た。さらに、RvE1については全合成を達成した。当初の計画通り、順調に研究が進展した。
2.プロレニン受容体リガンド:本課題の根幹となるプロレニン基本ミメティックII (中央部残基X/Y = leu/Leu, Phe/Lys, Leu/Arg) の合成法を確立できたことは大きな成果である。本法を用いて、様々なミメティクスの合成が可能であり、今後のプロレニン受容体リガンド構造活性相関研究の効果的な展開が期待出来る。
3.核酸創薬:塩基部とシクロプロパン水酸基とを三次元的多様に制御した3種類のシクロプロパンヌクレオシド (CPNs) 骨格の合成法の確立に成功した。本法を用いて、様々な新規CPNsの合成が可能であり、抗ウイルス構造活性相関研究、さらに核酸創薬研究の効果的な展開が期待出来る。
4.低分子ライブラリー:Pd触媒C-H活性化を経る1,2,3-三置換アリールシクロプロパン及び1,1,2-トリアルキル置換シクロプロパンの収束的かつ効率的構築法を確立した。ライブラリーを構築への展開へと活用出来る成果である。

Strategy for Future Research Activity

以下の通り、基本的には当初の計画に基づき研究を推進する。
1.レゾルビン創薬化学: リゾルビン (Rv)の構造活性相関研究の進展を図る。リードとして選択したCPLvE2対して、シクロプロパン歪みによる側鎖部配座制御を実施し、活性配座解明と高活性化を目指す。具体的には、シクロプロパン隣接位である10位及び13位にメチル基を導入した4種の立体・位置異性体 (10R-Me体, 10S-Me体, 13R-Me体, 13S-Me体) を合成する。LvE1に関しては、誘導体合成するためにより効率的な合成法を確立した後、シクロプロパン配座制御体を種々合成する。合成した化合物を用いて、光及び酸素に対する安定性、in vivo抗炎症活性を評価する。
2.プロレニン受容体リガンド:確立したプロレニン基本ミメティックII (中央部2残基 = leu/Leu, Phe/Lys, Leu/Arg) の合成法に基づき、予定通り構造活性相関研究を展開し、非ペプチド阻害剤リードを獲得する。
3.核酸創薬:確立したシクロプロパンヌクレオシド (CPNs) 骨格の構築法を用いて15化合物程度のCPNを合成し抗ウイルス活性を評価に供する。当初、CPNの合成法が確立後、直ちに核酸創薬へと研究展開する予定であった。しかし、CPNに抗ウイスルが期待されることに鑑み、その評価を優先した。次年度以降にオリゴヌクレオチドへと導入し、核酸創薬への展開を図る予定である。
4.低分子ライブラリー:Pd触媒C-H活性化を経る1,2,3-三置換アリールシクロプロパン及び1,1,2-トリアルキル置換シクロプロパンの効率的構築法を確立した。次課題として、1,1,2,3-四置換アリールシクロプロパンの合成法の開発に取り組む予定である。その後、多化合物を合成するライブラリー化反応としての応用が課題となる。

  • Research Products

    (21 results)

All 2016 2015

All Journal Article (17 results) (of which Peer Reviewed: 17 results,  Open Access: 3 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (2 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 2 results) Patent(Industrial Property Rights) (2 results)

  • [Journal Article] Pd(II)-Catalyzed Alkylation of Tertiary Carbon via Directing Group-Mediated C(sp3)-H Activation: Synthesis of Chiral 1,1,2-Trialkylsubstituted Cyclopropane.2016

    • Author(s)
      N. Hoshiya, K. Takenaka, S. Shuto, J. Uenishi
    • Journal Title

      Org. Lett

      Volume: 18 Pages: 48-51

    • DOI

      10.1021/acs.orglett.5b03229. Epub 2015 Dec 14.

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Novel Characteristics of Guanosine 5’-monophosphate 1 Reductase in Pathogenic2 Protozoa Trypanosoma brucei Distinct from Host Animal.2016

    • Author(s)
      T. Bessho, T. Okada, C. Kimura, T. Shinohara, A. Tomiyama, A. Imamura, M. Kuwamura, K. Nishimura, K. Fujimori, .S. Shuto, O. Ishibashi, B. K. Kubata, T. Inui
    • Journal Title

      PLoS Negl. Trop. Dis

      Volume: 10 Pages: e0004339

    • DOI

      10.1371/journal.pntd.0004339. eCollection 2016.

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Identification of a Potent and Selective GPR4 Antagonist as a Drug Lead for the Treatment of Myocardial Infarction.2016

    • Author(s)
      H. Fukuda, S. Ito, K. Watari, C. Mogi, M. Arisawa, F. Okajima, H. Kurose, S. Shuto
    • Journal Title

      ACS Med. Chem. Lett

      Volume: 7 Pages: 印刷中

    • DOI

      10.1021/acsmedchemlett.6b00014

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Identification of Adenine and Benzimidazole Nucleosides as Potent Human Concentrative Nucleoside Transporter 2 Inhibitors: Potential Treatment for Hyperuricemia and Gout.2016

    • Author(s)
      K. Tatani, M. Hiratochi, N. Kikuchi, Y. Kuramochi, S. Watanabe, Y. Yamauchi, M. Isaji, S, Shuto
    • Journal Title

      J. Med. Chem

      Volume: 59 Pages: 印刷中

    • DOI

      10.1021/acs.jmedchem.5b01884

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Non-metathesis Heterocycle Formation by Ruthenium-Catalyzed Intramolecular [2+2] Cycloaddition of Allenamide-enes to Azabicyclo[3.1.1]heptanes.2016

    • Author(s)
      T. Nada, Y. Yoneshige, Y. Ii, T. Matsumoto, H. Fujioka, S. Shuto, M. Arisawa
    • Journal Title

      ACS Catl.

      Volume: 6 Pages: 3168-3171

    • DOI

      10.1021/acscatal.6b00628

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Lipo-oxytocin-1, A Novel Oxytocin Analog Conjugated with Two Palmitoyl Groups, Has Long-lasting Effects on Anxiety-related Behavior and Social Avoidance in CD157 Knockout Mice.2015

    • Author(s)
      A. Mizuno, S. M. Cherepanov, Y. Kikuchi, A. Fakhrul, S. Akther, K. Deguchi, T. Yoshihara, K. Ishihara, S. Shuto , H. Higashida
    • Journal Title

      Brain Sci

      Volume: 5 Pages: 3-13

    • DOI

      10.3390/brainsci5010003

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Determination of ω-6 and ω-3 PUFA metabolites in human urine samples using UPLC/MS/MS.2015

    • Author(s)
      A. Sasaki, H. Fukuda, N. Shiida, N. Tanaka, A. Furugen, J. Ogura, S. Shuto, N. Mano, H. Yamaguchi
    • Journal Title

      Anal. Bioanal. Chem

      Volume: 407 Pages: 1625-1639

    • DOI

      10.1007/s00216-014-8412-5. Epub 2015 Jan 11.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Identification of 8-Aminoadenosine Derivatives as a New Class of Human Concentrative Nucleoside Transporter 2 Inhibitors.2015

    • Author(s)
      K. Tatani, M. Hiratochi, Y. Nonaka, M. Isaji, S. Shuto
    • Journal Title

      ACS Med. Chem. Lett

      Volume: 6 Pages: 244-248

    • DOI

      10.1021/ml500343r. eCollection 2015.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Nickel-Catalyzed Suzuki-Miyaura Coupling of a Tertiary Iodocyclopropane with Wide Boronic Acid Substrate Scope: Coupling Reaction Outcome Depends on Radical Species Stability.2015

    • Author(s)
      K. Yotsuji, N. Hoshiya, T. Kobayashi, H. Fukuda, H. Abe, M. Arisawa, S. Shuto
    • Journal Title

      Adv. Synth. Cat

      Volume: 357 Pages: 1022-1028

    • DOI

      10.1002/adsc.201401000

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Double carbonylation of aryl iodides with amines under an atmospheric pressure of carbon monoxide using sulfur-modified Au-supported palladium.2015

    • Author(s)
      N. Saito,T. Taniguchi,N. Hoshiya, S. Shuto, M. Arisawa, Y. Sato
    • Journal Title

      Green Chem

      Volume: 17 Pages: 2358-2361

    • DOI

      10.1039/C4GC02469A

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Characterization of imidazopyridine compounds as negative allosteric modulators of proton-sensing GPR4 in extracellular acidification-induced responses.2015

    • Author(s)
      A. Tobo, M. Tobo, T. Nakakura, M. Ebara, H. Tomura, C. Mogi, D.-S. Im, N. Murata, A. Kuwabara, S. Ito, H. Fukuda, M. Arisawa, S. Shuto, M. Nakaya, H. Kurose, K. Sato, F. Okajima
    • Journal Title

      Plos One

      Volume: 10 Pages: e0129334

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0129334 June 12, 2015

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Construction of a chiral quaternary carbon center by a radical cyclization/ring-enlargement reaction: synthesis of 4α-azidoethyl carbocyclic ribose, a key unit for the synthesis of cyclic ADP-ribose derivatives of biological importance.2015

    • Author(s)
      T. Sato, T. Tsuzuki, S. Takano, K. Kato, H. Fukuda, M. Arisawa, S. Shuto
    • Journal Title

      Tetrahedron

      Volume: 71 Pages: 5403-5413

    • DOI

      10.1016/j.tet.2015.05.084

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Synthesis of 7-Deaza-Cyclic Adenosine-5’-Diphosphate-Carbocyclic-Ribose and its 7-Bromo Derivative as Intracellular Ca2+-Mobilizing Agents.2015

    • Author(s)
      S. Takano, T. Tsuzuki, T. Murayama, T. Sakurai, H. Fukuda, M. Arisawa, S. Shuto
    • Journal Title

      J. Org. Chem

      Volume: 80 Pages: 6619-6627

    • DOI

      10.1021/acs.joc.5b00723. Epub 2015 Jun 23.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Discovery of Novel Indazole Derivatives as Highly Potent and Selective Human β3-Adrenergic Receptor Agonists without Cardiovascular Side Effects.2015

    • Author(s)
      Y. Wada, H. Shirahashi, T. Iwanami, M. Ogawa, S. Nakano, A. Morimoto, K. Kasahara, E. Tanaka, Y. Takada, S. Ohashi, M. Mori, S. Shuto
    • Journal Title

      J. Med. Chem

      Volume: 58 Pages: 6048-6057

    • DOI

      10.1021/acs.jmedchem.5b00638. Epub 2015 Jul 15.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Safe Removal of the Allyl Protecting Groups of Allyl Esters using a Recyclable, Low-leaching and Ligand-free Palladium Nanoparticle Catalyst.2015

    • Author(s)
      K. Takagi, H. Fukuda, S. Shuto, A. Otaka, M. Arisawa
    • Journal Title

      Adv. Synth. Catal

      Volume: 357 Pages: 2129-2124

    • DOI

      10.1002/adsc.201500055

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Rolling Circle Translation of Circular RNA in Living Human Cells.2015

    • Author(s)
      N. Abe, K. Matsumoto, M. Nishihara, Y. Nakano, A. Shibata, H. Maruyama, S. Shuto, A. Matsuda, M. Yoshida, Y. Ito, H. Abe
    • Journal Title

      Scientific Rep

      Volume: 15 Pages: 16435

    • DOI

      10.1038/srep16435

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] One-pot Olefin Isomerization/ Aliphatic Enamine Ring-closing Metathesis/ Oxidation/ 1,3-Dipolar Cycloaddition for the Synthesis of Isoindolo[1,2-a]isoquinolines.2015

    • Author(s)
      Y. Fujii, T. Takehara, T. Suzuki, H. Fujioka, S. Shuto, M. Arisawa
    • Journal Title

      Adv. Synth. Catal

      Volume: 18 Pages: 4055-4062

    • DOI

      10.1002/adsc.201500680.

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Design and Synthesis of Biologically Active Compounds Based on the Structural Features of Cyclopropane2016

    • Author(s)
      Satoshi Shuto
    • Organizer
      The 8th Takeda Science Foundation Symposium on Pharmasciences. Biomolecule-Based Medicinal Science: Featuring Mid-Size Drugs
    • Place of Presentation
      武田薬品工業研究所(大阪府吹田市)
    • Year and Date
      2016-01-21 – 2016-01-22
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Medicinal chemical study on cyclic ADP‐ribose for developing the stable and potent agonists and antagonists2015

    • Author(s)
      Satoshi Shuto
    • Organizer
      FASEB Science Research Conference on NAD Metabolism and Signaling
    • Place of Presentation
      Timmendorfer Strand, Germany
    • Year and Date
      2015-08-09 – 2015-08-14
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Patent(Industrial Property Rights)] プロレニン受容体リガンド及びアンタゴニスト2016

    • Inventor(s)
      周東 智、石田 晋、神田敦宏、桑原智希
    • Industrial Property Rights Holder
      周東 智、石田 晋、神田敦宏、桑原智希
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      特願2016-023315
    • Filing Date
      2016-02-10
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 環状ペプチドの膜透過性および/または代謝安定性を改善するシクロプロパンアミノ酸ユニット2015

    • Inventor(s)
      松井耕平、周東 智
    • Industrial Property Rights Holder
      松井耕平、周東 智
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      特願2015-167408
    • Filing Date
      2015-08-27

URL: 

Published: 2017-01-06  

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