2016 Fiscal Year Annual Research Report
Global dispersal and diversification in beetles with flight polymorphisms
| Project/Area Number |
15H02637
|
|---|
| Research Institution | Kyoto University |
|---|
Principal Investigator |
曽田 貞滋 京都大学, 理学研究科, 教授 (00192625)
|
|---|
| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
池田 紘士 弘前大学, 農学生命科学部, 准教授 (00508880)
高見 泰興 神戸大学, 人間発達環境学研究科, 准教授 (60432358)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2015-04-01 – 2020-03-31
|
| Keywords | 甲虫類 / 全球的分散 / 飛翔多型 / 種多様性 / 分子系統 |
|---|
| Outline of Annual Research Achievements |
（１）RNA分析試料のサンプリング
7月にアメリカ，ワシントン州，アリゾナ州においてサンプリングを行い，Carabus, Calosoma, Cychrus, Scaphinotus, Sphaeroderus属のオサムシ亜科，Omus, Amblycheilaなどのハンミョウ亜科，Heterosilphaなどのヒラタシデムシ亜科を得た．11月末～12月初めにニュージーランド，北島においてサンプリングを行い，固有種のオサムシ亜科Maoripamborus fairburni，ハンミョウ亜科Neocicicindela tuberculataを得た．11月および3月に，南アフリカにおいて，ハンミョウ亜科，オサムシ亜科カタビロオサムシ亜族のサンプリングを行った．この他，海外の研究協力者・共同研究者から，分析に用いるRNA抽出用のサンプルを入手した．
（２）RNAシーケンスによる分子系統解析
これまでに得られたサンプルのうち，今年度はオサムシ亜科14種，ハンミョウ亜科25種，ヒラタシデムシ亜科2種，合計41個体について，Illumina HiSeqによるpaired endライブラリーのシーケンスを行った．前年度にシーケンスしたデータもあわせて，Trinityによるアセンブル・contig作成と，Yang & Smithの方法にしたがって，アミノ酸配列に基づくオーソロガスな遺伝子の探索・配列マトリクスの作成を行い，最尤法による系統解析を試みた．その結果，それぞれの亜科について，枝の支持率が高い（ブートストラップ値100％）系統樹が得られた．オサムシ亜科，ヒラタシデムシ亜科については，少数の遺伝子を用いた分子系統解析で得られている系統関係とほぼ同じ結果が得られているが，ハンミョウ亜科については，その中の族，亜族の関係について，一部従来の知見とは異なる結果が得られている．これにはデー分析の手法的な問題も含まれている可能性があり，今後，解析方法を洗練させていく必要がある．
|
| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
分析試料の収集，RNAシーケンスによる系統解析データの取得とも着実に進んでいる．また，RNAシーケンスのオーソロガスな遺伝子の探索，分子系統解析についても，これまでに取得したデータで予備的な解析が成功している．
|
| Strategy for Future Research Activity |
必須的な分類群および外群として利用できるオサムシ科の各亜科のサンプルの収集に努める．分子系統解析を本格的に行い，分岐年代の推定も試みる．飛翔能力の退化と種の多様化に関して，分布と分類に関する文献データから，分析を行い，本計画で得られる系統・分岐年代推定の結果と，種の多様性を結びつける仮説を構築する．
|
