2019 Fiscal Year Annual Research Report
Global dispersal and diversification in beetles with flight polymorphisms
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15H02637
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| Research Institution | Kyoto University |
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Principal Investigator |
曽田 貞滋 京都大学, 理学研究科, 教授 (00192625)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
池田 紘士 弘前大学, 農学生命科学部, 准教授 (00508880)
高見 泰興 神戸大学, 人間発達環境学研究科, 准教授 (60432358)
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| Project Period (FY) |
2015-04-01 – 2020-03-31
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| Keywords | 甲虫類 / 全球的分散 / 飛翔多型 / 種多様性 / 分子系統 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
（１）RNAシーケンスによる分子系統解析：オサムシ亜科，ハンミョウ科，ヒラタシデムシ亜科について，今年度取得したデータを含め，タンパク質コード領域のシーケンスをOrthofinderで解析し，オーソロガス遺伝子の配列を抽出して系統解析，分岐年代推定を行った．今後，オーソロガス遺伝子の抽出方法の改良，分岐年代推定の改良を行い，分散・種多様化に関する系統地理解析を行って，投稿論文を作成する．
（２）UCEシーケンスによるオサムシ亜科の分子系統解析：近年開発されたゲノム上の保存的な領域UCE (Ultra-Conserved Element)を対象とした系統解析を行うため，オサムシ亜科，とくにオサムシ族の種を対象として，UCEをエンリッチメントしたショットガンシーケンスライブラリーを作成し（約100個体分），シーケンスデータを取得した．UCEシーケンスのアラインメントデータで系統解析を行い，亜科内の族，亜族の分岐関係，オサムシ亜族・カタビロオサムシ亜族内の亜属の分岐関係を明らかにした．今後，分岐年代推定などを行って，投稿論文を作成する．
（３）ミトゲノム解析によるセントヘレナ島固有種の系統解析
セントヘレナ島産の絶滅したと考えられる固有種Aplothorax burchelliについて，52年前の標本からDNA抽出を行い，ショットガンシーケンスデータを得た．同様にオサムシ亜科の全グループおよび外群１種についてもデータを取得し，ミトコンドリアの13遺伝子の系統解析を行い，さらにミトコンドリアND5遺伝子の多数のシーケンスデータを用いて，同種がカタビロオサムシ属のCtenosta亜属に近いことを確認した．この結果に関する論文を投稿した．
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| Research Progress Status |
令和元年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
令和元年度が最終年度であるため、記入しない。
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