2017 Fiscal Year Annual Research Report
Expansion of the informational technologies for mutual use of measurement data in biological science
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15H02755
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| Research Institution | Institute of Physical and Chemical Research |
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Principal Investigator |
桝屋 啓志 国立研究開発法人理化学研究所, バイオリソースセンター, ユニットリーダー (40321814)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
古崎 晃司 大阪大学, 産業科学研究所, 准教授 (00362624)
溝口 理一郎 北陸先端科学技術大学院大学, サービスサイエンス研究センター, 特任教授 (20116106)
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| Project Period (FY) |
2015-04-01 – 2018-03-31
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| Keywords | オントロジー / 大規模データ / 視点転換 / ロール概念 / オープンデータ |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究は,生命科学で日々生産される様々な計測・観察データを,生物種,実験観察の方法論や視点,コントロール値の違いなどの壁を 超えて,普遍的に取り扱うための相互利用技術の創出を目指している。H28年度は、計測データを柔軟に構築するためのデータの持たせ方が想定より複雑である問題に直面し、予算の繰越申請を行うとともに、複雑化問題のアルゴリズム検討を行った。
H29年度は、1）H28年度の繰越作業として、H28年度の検討に基づいたデータ支援方法の確立、および提示技術の洗練化を目指し、測定データの構築／可視化ツールの基本設計および、データ基盤アプリケーション開発を行った。この結果、生命科学の計測・観察データの相互利用と言う枠を超えて、視点依存など、高度に構造化されたオープンデータ全体に関して、大規模記述の支援ができる可能性が示唆された。
この成果に基づいて、本研究ではさらに2）生命測定データ構築支援ツールの開発を行った。本ツールは、高度に構造化されたデータ記述において、クラスレベルの修正と洗練化と,インスタンス作成を行き来しながら、大規模データをバルクで編集できる。オントロジーに基づくデータ構造を表型式に落とし込み、その上で、読み出し、データ追加、編集、保存を整合性を持って行うことができる。
本支援ツールは、上位概念で定義されたスロットが整合性を持って下位概念に継承されるように編集を促す洗練化を目で確認しながら編集できた。しかも、表計算ソフトのように複数セルへのコピーペーストが可能なので、継承関係のみならず、各スロットに記入する文言レベルでの整合性を容易にとることが可能であった。オープンデータの大規模化・多様化が進むと考えられるが、本ツールは、異なる視点で作成されたデータを統合し、知識の相互利用をさらに推進するためにの有効なツールの一つとなると期待される。
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| Research Progress Status |
29年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
29年度が最終年度であるため、記入しない。
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