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2015 Fiscal Year Annual Research Report

人工分子デバイス援用による新世代人工細胞

Research Project

Project/Area Number 15H02774
Research InstitutionTohoku University

Principal Investigator

野村 慎一郎  東北大学, 工学(系)研究科(研究院), 准教授 (50372446)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 齊藤 博英  京都大学, iPS細胞研究所, 教授 (20423014)
Project Period (FY) 2015-04-01 – 2018-03-31
Keywordsバイオテクノロジー / 人工細胞 / 分子ロボティクス
Outline of Annual Research Achievements

本年度は,生きた細胞に導入され機能しうる以下4種の人工分子デバイス群のデザインと評価を行い,これらデバイスを実際に細胞内に導入するための手法の開発を行った.具体的には,1)膜チャネル: デザインされた人工DNAチャネルについて,その構造に依存したチャネル電流のON/OFF挙動が確認された.2)座標制御デバイス:齋藤Gで新規な立体構造を示すRNAナノデバイスの設計と開発を進め,構造の評価を行った.3)膜造形:DNAオリガミ製デバイス単体での改良では変形挙動が予想より小さく,脂質膜の変形効果を得るために強固なデザインへと変更を行った.4) 膜リンカー:リポソームを用いた脂質膜内外からの合体デバイスを構築し,その評価を行った.そして,これら開発中の分子デバイスを一括して生きた細胞内部に導入可能とする手法として,細胞サイズ巨大巨大リポソーム(GUV)-細胞融合法の開発を進めた.GUVに内包させたマイクロメートルサイズにおよぶ人工物質を,生きた細胞内に導入するための条件として,その物理化学的特性と受け手の細胞側の条件を調査した.その結果,人工物のみならず,細胞内小器官をも導入することが可能であることを示す事ができ,現在論文作成中である.DNAナノテクノロジーにより設計された人工分子デバイスのモデルとして,破壊によって蛍光強度の増大を示すDNAデバイス分子を構築し,細胞内に導入し評価を行った.その結果,分解に至る時間を見積もることができた.一方で,分解のメカニズムについては精査が必要であることから,引き続きモデルを用いた評価を行う予定である.

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

評価系は装置含めて確立しており,分子デバイスの設計・改良は順調に進んでいる.肝心の生きた細胞内への分子デバイス導入に関して,GUV-細胞融合法で導入されたデバイスを蛍光ラベルによって細胞内トラッキングした結果,分解されるまでの時間を見積もることが出来た.また,この際の分子修飾によって局在先を規定可能であることが示唆されている.これらの結果より,本課題はおおむね順調に進展していると考えている.

Strategy for Future Research Activity

引き続き,人工分子デバイスセットの設計と評価(1-4):細胞環境での動作が確認されたものから,分子デバイス間の連携をすすめる.本年度の研究の結果,DNAナノ構造の細胞内での安定性が低いため,架橋および機能性分子修飾による安定化を試みる.また,分子デバイス間の連携を進め,効果をより明確化するための大規模集積化を行う. 細胞の特徴的な構造との局所的な相互作用を強化するための設計を調査する.具体的には微小管アプタマーを調査したが,安定して動作しなかったことから,引き続き細胞内局在安定化を実現するための設計を調査する.また生きた細胞内部へ導入する前段階として,細胞モデルとしてGUVを用い,分解を抑えた状態で人工分子デバイスを導入して機能試験を行う.

  • Research Products

    (15 results)

All 2016 2015

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 5 results) Presentation (9 results) (of which Int'l Joint Research: 7 results,  Invited: 6 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Journal Article] Design, assembly, and evaluation of RNA-protein nanostructures.2015

    • Author(s)
      Ohno H, Osada E, Saito H
    • Journal Title

      Methods in molecular biology

      Volume: 1297 Pages: 197-211

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Folding RNA-Protein Complex into Designed Nanostructures.2015

    • Author(s)
      Shibata T, Suzuki Y, Sugiyama H, Endo M, Saito H
    • Journal Title

      Methods in molecular biology

      Volume: 1316 Pages: 169-179

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Efficient Detection and Purification of Cell Populations Using Synthetic MicroRNA Switches.2015

    • Author(s)
      Miki K, Endo K, Takahashi S, Funakoshi S, Takei I, Katayama S, Toyoda T, Kotaka M, Takaki T, Umeda M, Okubo C, Nishikawa M, Oishi A, Narita M, Miyashita I, Asano K, Hayashi K, Osafune K, Yamanaka S, Saito H, Yoshida Y
    • Journal Title

      Cell stem cell

      Volume: 16.6 Pages: 699-711

    • DOI

      10.1016/j.stem.2015.04.005

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Droplet-Shooting and Size-Filtration (DSSF) Method for Synthesis of Cell-Sized Liposomes with Controlled Lipid Compositions.2015

    • Author(s)
      Morita M, Onoe H, Yanagisawa M, Ito H, Ichikawa M, Fujiwara K, Saito H, Takinoue M
    • Journal Title

      Chembiochem : a European journal of chemical biology

      Volume: 16.14 Pages: 2029-2035

    • DOI

      10.1002/cbic.201500354

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Mammalian synthetic circuits with RNA binding proteins for RNA-only delivery.2015

    • Author(s)
      Wroblewska L, Kitada T, Endo K, Siciliano V, Stillo B, Saito H, Weiss R
    • Journal Title

      Nature biotechnology

      Volume: 33 Pages: 839-841

    • DOI

      10.1038/nbt.3301

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] アメーバ型分子ロボットのデザインと構築2016

    • Author(s)
      野村 M. 慎一郎
    • Organizer
      11th Beyond^x Robotics 研究会
    • Place of Presentation
      仙台市,東北大学
    • Year and Date
      2016-03-26
    • Invited
  • [Presentation] Synthetic RNA Switches and Circuits to Detect and Purify Target Live Cells2016

    • Author(s)
      Hirohide Saito
    • Organizer
      UC San Diego Kyoto University joint Sympojium
    • Place of Presentation
      University of Califonia ,San Diego(USA・SanDiego)
    • Year and Date
      2016-03-14 – 2016-03-16
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Synthetic RNA Switches and Nanostructures ti Detect,Purify,and Control Target Mammalian Calls2016

    • Author(s)
      Hirohide Saito
    • Organizer
      SBE's 6th International Conference on Biomolecular Engineerin
    • Place of Presentation
      Grand Hyatt Singapore(Singapore)
    • Year and Date
      2016-01-04 – 2016-01-08
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] RNA membrane vesicle: micro compartment made by designed RNA molecules2015

    • Author(s)
      NOMURA M. Shin-ichiro, SAITO Hirohide, TAKINOUE Masahiro, FUJIWARA Kei, OHNO Hirohisa
    • Organizer
      PacifiChem2015
    • Place of Presentation
      Honolulu, Hawaii, USA
    • Year and Date
      2015-12-16
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] "Synthetic RNA technologies to detect, purify, and control live cell populations"2015

    • Author(s)
      Hirohide Saito
    • Organizer
      Paris Symposium on Integrated Cell-Material Sciences
    • Place of Presentation
      Institut Pierre-Gilles de Gennes pour la Microfluidique(Paris,France)
    • Year and Date
      2015-10-12 – 2015-10-13
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 合成細胞生物学ツールとして活用するGUV人工細胞モデル2015

    • Author(s)
      NOMURA M. Shin-ichiro
    • Organizer
      第53回日本生物物理学会
    • Place of Presentation
      金沢市,金沢大学
    • Year and Date
      2015-09-15
    • Invited
  • [Presentation] Molecular information processing in micro gel beads with entrapped DNAs2015

    • Author(s)
      Satoru Yoshizawa, Ibuki Kawamata, Shin-ichiro M. Nomura, Satoshi Murata
    • Organizer
      DNA21
    • Place of Presentation
      Harvard Univ., Boston, USA
    • Year and Date
      2015-08-17 – 2015-08-21
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Electrofusion of Cell-GUV enables micrometer-sized artificial objects transfer into live cells2015

    • Author(s)
      Akira C. Saito, Toshihiko Ogura, Satoshi Murata, and Shin-ichiro M. Nomura
    • Organizer
      10th European Biophysics Congress
    • Place of Presentation
      Dresden, Germany
    • Year and Date
      2015-07-18 – 2015-07-22
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Designing an Artificial Membrane Channel From DNA origami2015

    • Author(s)
      Kazuki Hirahara, Ibuki Kawamata, Satoshi Murata, NOMURA M. Shin-ichiro
    • Organizer
      FNANO15
    • Place of Presentation
      SNOWBIRD, UT, USA
    • Year and Date
      2015-04-13 – 2015-04-16
    • Int'l Joint Research
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 生きた細胞内へのミトコンドリア導入法2015

    • Inventor(s)
      小椋利彦,野村慎一郎,齋藤明
    • Industrial Property Rights Holder
      国立研究開発法人科学技術振興機構
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      特願2015-185058
    • Filing Date
      2015-09-18

URL: 

Published: 2017-01-06  

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