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2017 Fiscal Year Annual Research Report

A new light energy flow model connecting from sunlight to marine ecosystem

Research Project

Project/Area Number 15H02800
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

吉澤 晋  東京大学, 大気海洋研究所, 准教授 (00553108)

Project Period (FY) 2015-04-01 – 2019-03-31
Keywords海洋細菌 / 微生物生態 / ロドプシン
Outline of Annual Research Achievements

本研究では、近年明らかとなった “太陽光エネルギーを海洋生態系へ結ぶ新しいパスウェイ”である細菌型ロドプシンの地球規模でのエネルギー収支を追求するため、データベース上に爆発的なペースで蓄積し続ける機能未知ロドプシン遺伝子の光エネルギー利用機構および利用効率を、情報科学技術および全遺伝子合成技術を駆使することで多角的に解明し、地球規模エネルギーフローを理解するうえで緊急に必要とされている“ロドプシンを基軸とする新しい光エネルギーフローモデルの構築”を目的とする。
平成29年度は、海洋細菌の光への適応機構を明らかにするため、プロテオロドプシン遺伝子(PR)を持つ細菌と持たない細菌の大規模比較ゲノム解析を実施し、それぞれの特徴を調べた。その結果、PRを持たない海洋表層のフラボバクテリアは、その多くがAPE(aryl polyene)またはFTP(flexirubin-type pigments)という細菌の外膜に局在する色素を合成する遺伝子を持つこと、一方で、PRを持つ細菌でこれらの色素を合成する遺伝子を持つ株は、一株も存在しないことが分かった。APE、FTPはともに生物のDNAにダメージを与える紫外線を吸収する色素であり、外膜において光を遮ることで、そうしたダメージから細胞内部を保護する「日傘」のような役割があることがこれまでの研究によって報告されている。したがってこの発見は、PRによって光エネルギーを利用することにより、逆に光や紫外線によるダメージを受けてしまうというデメリットが生じてしまうこと、そして、海洋表層に生息する細菌には光からエネルギーを得る「太陽電池型」と色素で光を遮る「日傘型」の適応戦略があることを示唆している。

Research Progress Status

29年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

29年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (10 results)

All 2018 2017 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (3 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 2 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 5 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] University of Hawaii(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      University of Hawaii
  • [Journal Article] Solar-panel and parasol strategies shape the proteorhodopsin distribution pattern in marine Flavobacteriia2018

    • Author(s)
      Kumagai Yohei、Yoshizawa Susumu、Nakajima Yu、Watanabe Mai、Fukunaga Tsukasa、Ogura Yoshitoshi、Hayashi Tetsuya、Oshima Kenshiro、Hattori Masahira、Ikeuchi Masahiko、Kogure Kazuhiro、DeLong Edward F.、Iwasaki Wataru
    • Journal Title

      The ISME Journal

      Volume: 12 Pages: 1329-1343

    • DOI

      10.1038/s41396-018-0058-4

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Proteorhodopsin variability and distribution in the North Pacific Subtropical Gyre2018

    • Author(s)
      Olson Daniel K.、Yoshizawa Susumu、Boeuf Dominique、Iwasaki Wataru、DeLong Edward F.
    • Journal Title

      The ISME Journal

      Volume: 12 Pages: 1047-1060

    • DOI

      10.1038/s41396-018-0074-4

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Spectroscopic characteristics of Rubricoccus marinus xenorhodopsin (RmXeR) and a putative model for its inward H+ transport mechanism2018

    • Author(s)
      Inoue Saki、Yoshizawa Susumu、Nakajima Yu、Kojima Keiichi、Tsukamoto Takashi、Kikukawa Takashi、Sudo Yuki
    • Journal Title

      Physical Chemistry Chemical Physics

      Volume: 20 Pages: 3172~3183

    • DOI

      10.1039/c7cp05033j

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] A “photo”heterotrophic lifestyle of rhodopsin-containing bacteria2017

    • Author(s)
      Susumu Yoshizawa
    • Organizer
      Ocean University of China-The University of Tokyo Marine Microbiology Workshop
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Microbial rhodopsin: a photoreceptor protein found in any environment where water exists and light reaches2017

    • Author(s)
      Susumu Yoshizawa
    • Organizer
      Joint Symposium on Ocean, Coastal, and Atmospheric Sciences
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 微生物型ロドプシン:光利用機構の多様性は我々に何を語るのか?2017

    • Author(s)
      吉澤 晋
    • Organizer
      生命科学系学会合同年次大会(ConBio2017)
    • Invited
  • [Presentation] NGSが解き明かす海洋微生物の新しい光エネルギー利用機構2017

    • Author(s)
      吉澤 晋
    • Organizer
      NGS現場の会第五回研究会
    • Invited
  • [Presentation] 海洋微生物のロドプシンを用いた新しい光エネルギー利用機構2017

    • Author(s)
      吉澤 晋
    • Organizer
      第17回東京大学生命科学シンポジウム
    • Invited
  • [Remarks] 光を利用するか、それとも避けるか? ~海洋細菌の二種類の光適応戦略の解明~

    • URL

      http://www.aori.u-tokyo.ac.jp/research/news/2018/20180206.html

URL: 

Published: 2018-12-17  

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