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2016 Fiscal Year Annual Research Report

クラスターDNA損傷に対する細胞内修復動態と損傷の局在化メカニズム

Research Project

Project/Area Number 15H02823
Research InstitutionNational Institutes for Quantum and Radiological Science and Technology

Principal Investigator

横谷 明徳  国立研究開発法人量子科学技術研究開発機構, 高崎量子応用研究所 東海量子ビーム応用研究センター, 上席研究員(定常) (10354987)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 渡辺 立子  国立研究開発法人量子科学技術研究開発機構, 高崎量子応用研究所 東海量子ビーム応用研究センター, 主幹研究員(定常) (10360439)
秋光 信佳  東京大学, アイソトープ総合センター, 教授 (40294962)
岡 壽崇  東北大学, 高度教養教育・学生支援機構, 助教 (70339745)
鵜飼 正敏  東京農工大学, 工学(系)研究科(研究院), 教授 (80192508)
福永 久典  東北大学, 大学病院, 医員(研修医) (50781267) [Withdrawn]
Project Period (FY) 2015-04-01 – 2018-03-31
KeywordsクラスターDNA損傷 / 修復動態 / DNA電子物性 / シンクロトロン放射 / 蛍光タンパク質 / 内殻イオン化 / DNAラジカル / Auger電子
Outline of Annual Research Achievements

mCherry蛍光タンパク質を含むプラスミドDNAに対し100~200GyのX線を照射した後、これをヒト細胞(HeLa)細胞へ導入した。フローサイトメータを利用して形質転換効率を調べたところ、100Gyではほとんど影響を受けず、また200Gyでは60%程度であった。これらの結果から、mCherryを切り出して照射しプラスミドに再結合するこれまで行ってきた操作の必要が無いことが分かった。また、イオンビームやX線を照射したプラスミドDNAに対する塩基除去修復酵素の作用機序から、実際のクラスター損傷部位を構成する個々の損傷間の距離に関する知見を得て、論文として発表した。SPring-8から得られる酸素及び窒素のK殻吸収端近傍の単色シンクロトロン軟X線の照射条件の検討も、現在進めている。DNAの電子物性とDNA周囲の水和水構造がどのように損傷誘発に関わるかを理解するためには、DNAの糖(デオキシリボース)の分解プロセスについて量子化学計算も必要である。フランスのグループとの共同研究によりこれを実施し、計算結果はが実験で得られている分解生成物(フラグメントイオン)のパターンと良く一致する結果を得、現在論文として投稿中である。内殻イオン化の結果生じるオージェ電子の作用についても、モンテカルロシミュレーションを実施し論文として発表した。さらに不安定なDNA塩基ラジカルを、単色軟X線を照射しながらその場測定を行った結果、塩基の持つ官能基に依存してラジカル収率が大幅に変わることを見出した。DNA損傷に至る反応中間体であるラジカル生成メカニズムに関してこれまで知られていない重要な知見であり、論文として投稿する準備を進めている。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

mCherry蛍光タンパク質を含むプラスミドDNAに対し100Gy程度のX線を照射しても、ヒト細胞(HeLa)細胞への形質転換効率がほとんど影響受けないことを見出した。そこでこれまでの方針を転換し、mCherry遺伝子部分の切り出しとプラスミドへの再結合の操作を全てカットすることで、大幅に実験を簡略化することに成功した。プラスミドへの照射とこれをヒト細胞に導入した後のライブセル観察を開始した。またシンクロトロン軟X線の照射条件の検討を進めたが、緩衝液の塩を除くことによる鎖切断頻度が数10%は起こってしまうため、引き続き実験条件の検討を行っている。

Strategy for Future Research Activity

照射用プラスミド試料の作成と照射後の細胞への導入方法が、大幅に簡略化できることが分かり、実験の進捗のスピードが上がった。またDNA中の特定元素の内殻イオン化に特有の損傷過程を調べるためには、DNAを構成する元素と同じ元素(C, N, O, P)を含む緩衝液の塩を試料から除くことが必須であり、これによるDNA分子の不安定化の克服が鍵となる。薄膜を吸着させるための基板を、これまでのガラス以外にもプラスティックなどDNAとの吸着性が低い材料を検討する。、

  • Research Products

    (18 results)

All 2017 2016 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (9 results) (of which Peer Reviewed: 8 results,  Acknowledgement Compliant: 9 results,  Open Access: 1 results) Presentation (8 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 6 results)

  • [Int'l Joint Research] UPMC Univ Paris 06/Universite´ d’Evry val d’Essonne(フランス)

    • Country Name
      FRANCE
    • Counterpart Institution
      UPMC Univ Paris 06/Universite´ d’Evry val d’Essonne
  • [Journal Article] Photon-induced Auger Effect in Biological Systems: A Review2017

    • Author(s)
      Takashi Ito and Akinari Yokoya
    • Journal Title

      Int. J. Radiat. Biol.

      Volume: epub ahead of print Pages: -

    • DOI

      10.1080/09553002.2017.1312670

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] 高エネルギー電子線により水中で生成された2次電子の動的挙動2017

    • Author(s)
      甲斐 健師, 横谷 明徳, 藤井 健太郎, 渡辺 立子
    • Journal Title

      陽電子科学

      Volume: 8 Pages: 11 - 17

    • Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Dynamic Behavior of Secondary Electrons in Liquid Water at the Earliest Stage upon Irradiation: Implications for DNA Damage Localization Mechanism2016

    • Author(s)
      Kai, T., Yokoya, A., Ukai, M., Fujii, K. and Watanabe, R.
    • Journal Title

      J. Phys. Chem. A

      Volume: 120 Pages: 8228-8233

    • DOI

      10.1021/acs.jpca.6b05929

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Efficiency of radiation-induced base lesion excision and the order of enzymatic treatment2016

    • Author(s)
      Shiraishi, I., Shikazono, N., Fujii, K. and Yokoya, A.
    • Journal Title

      Int. J. Radiat. Biol.

      Volume: 93 Pages: 295-302

    • DOI

      10.1080/09553002.2017.1239849

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Deceleration processes of secondary electrons produced by a high-energy Auger electron in a biological context2016

    • Author(s)
      Takeshi Kai, Akinari Yokoya, Masatoshi Ukai, Kentaro Fujii, and Ritsuko Watanabe
    • Journal Title

      Int. J. Radiat. Biol.

      Volume: 92 Pages: 654-659

    • DOI

      10.1080/09553002.2016.1195933

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Cell cycle tracking for irradiated and unirradiated bystander cells in a single colony with exposure to a soft X-ray microbeam2016

    • Author(s)
      Kiichi Kaminaga, Miho Noguchi, Ayumi Narita, Yuya Hattori, Noriko Usami, and Akinari Yokoya
    • Journal Title

      Int. J. Radiat. Biol.

      Volume: 92 Pages: 739-744

    • DOI

      10.1080/09553002.2016.1206237

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Evaluation of DNA damage induced by Auger electrons from Cs-1372016

    • Author(s)
      Ritsuko Watanabe, Yuya Hattori, Takeshi Kai
    • Journal Title

      Int. J. Radiat. Biol.

      Volume: 92 Pages: 660 - 664

    • DOI

      10.3109/09553002.2015.1136853

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] 放射線物理化学過程に関する最近の進展(中編)2016

    • Author(s)
      甲斐 健師、横谷 明徳、藤井 健太郎、渡邊 立子
    • Journal Title

      放射線化学

      Volume: 102 Pages: 49-56

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] 放射線物理化学過程に関する最近の進展(前編)2016

    • Author(s)
      甲斐 健師、横谷 明徳、藤井 健太郎、渡邊 立子
    • Journal Title

      放射線化学

      Volume: 101 Pages: 3-11

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] X線マイクロビーム照射後の細胞運命とミトコンドリア活性変化2017

    • Author(s)
      横谷 明徳、神長喜一、濱田涼、宇佐美徳子、鈴木啓司
    • Organizer
      茨城大学理学部公開シンポジウム「組織や個体の環境から発がん・がん放射線治療を考える」
    • Place of Presentation
      茨城大学理学部(水戸)
    • Year and Date
      2017-02-12 – 2017-02-12
    • Invited
  • [Presentation] DNA損傷・飛跡構造解析に関する研究2016

    • Author(s)
      渡辺 立子
    • Organizer
      日本放射線影響学会第59回大会
    • Place of Presentation
      JMSアステールプラザ(広島)
    • Year and Date
      2016-12-26 – 2016-12-28
    • Invited
  • [Presentation] Roles of Oxygen for Inducing DNA Strand Breakages by Ionizing Radiation2016

    • Author(s)
      藤井健太郎
    • Organizer
      Oxygenalia 2016
    • Place of Presentation
      クラクフ、ポーランド
    • Year and Date
      2016-11-18 – 2016-11-18
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 生体の放射線ストレス応答と生体分子内の電荷輸送2016

    • Author(s)
      横谷明徳
    • Organizer
      新学術領域研究ハイブリッド量子科学・量子生物研究会
    • Place of Presentation
      国立情報学研究所(東京)
    • Year and Date
      2016-10-24 – 2016-10-24
    • Invited
  • [Presentation] 放射線生体影響のメカニズム解明に向けた放射光利用研究2016

    • Author(s)
      横谷 明徳, 神長 輝一, 渡辺 立子, 服部 佑哉, 鈴木 啓司, 泉 雄大, 藤井 健太郎
    • Organizer
      PF研究会・福島環境回復を目指した放射光研究の現状と今後の課題
    • Place of Presentation
      高エネルギー加速器研究機構(つくば)
    • Year and Date
      2016-10-14 – 2016-10-14
  • [Presentation] 電子線トラックエンドの放射線最初期過程の研究2016

    • Author(s)
      甲斐 健師, 横谷 明徳, 鵜飼 正敏, 藤井 健太郎, 渡辺 立子, 米谷 佳晃, 樋川 智洋, 佐藤 達彦
    • Organizer
      第59回放射線化学討論会
    • Place of Presentation
      量子科学技術研究開発機構 高崎量子応用研究所
    • Year and Date
      2016-09-20 – 2016-09-22
  • [Presentation] 低線量放射線影響の初期過程のシミュレーション2016

    • Author(s)
      渡辺立子
    • Organizer
      低線量放射線とその影響に関するシンポジウム
    • Place of Presentation
      自然科学研究機構核融合科学研究所(土岐、岐阜)
    • Year and Date
      2016-09-20 – 2016-09-20
    • Invited
  • [Presentation] シンクロトロン放射光を用いた放射線生物研究2016

    • Author(s)
      藤井健太郎
    • Organizer
      第6回群馬大学Genome Damage Discussion Group公開セミナー
    • Place of Presentation
      群馬大学医学部(前橋)
    • Year and Date
      2016-07-14 – 2016-07-14
    • Invited

URL: 

Published: 2018-01-16  

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