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2016 Fiscal Year Annual Research Report

Molecule selection and optimization of highly active antisense DNA and determination of absolute configuration of phosphorus atoms

Research Project

Project/Area Number 15H03839
Research InstitutionTokyo University of Science

Principal Investigator

和田 猛  東京理科大学, 薬学部生命創薬科学科, 教授 (90240548)

Project Period (FY) 2015-04-01 – 2019-03-31
Keywords核酸医薬 / アンチセンス核酸 / ホスホロチオエートDNA / 立体制御 / 不斉合成 / リン原子修飾核酸
Outline of Annual Research Achievements

本研究の目的は、立体異性体の混合物として存在するホスホロチオエートアンチセンスDNA分子群の中で、生体内で医薬として最も有効に働く分子を選択し、そのリン原子の絶対立体配置を決定する手法を確立し、得られた立体化学情報に基づき、個々のインターヌクレオチド結合に最適なリン原子の絶対立体配置を有する高活性なホスホロチオエートアンチセンスDNAを独自の核酸分子合成手法を用いて創製することである。平成28年度は、前年度に2量体を合成することによって確立した条件を立体制御されたホスホロチオエート結合を含むアンチセンスDNA(13量体)の自動固相合成に適用した。種々、合成条件を検討した結果、高収率で目的物を得る条件を確立した。これと並行して、安定同位体標識を含む種々のモノマーの合成検討を行ない、立体化学的に純粋なモノマーを合成することに成功した。一方、予備的な実験として、同位体標識を含まないアンチセンスDNAの精密質量分析を行い、分析条件の検討を行なった。解析の結果、オリゴマーの同定を行なうのに十分な精度でフラグメントの解析を行うことができた。また、RNase HとアンチセンスDNAの親和性評価(プルダウンアッセイ実験)のために用いる、RNA切断活性のないRNase H変異体の作成に成功した。今後は、安定同位体を含むアンチセンスDNAの立体選択的な自動固相合成を行ない、種々の分子選択および構造決定の実験を行う予定である。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

当初の計画通り、同位体標識モノマーの合成を達成した。また、自動合成機を用いるオリゴマーの立体選択的合成条件を確立することができた。

Strategy for Future Research Activity

安定同位体標識を含むモノマーおよびオリゴマーは極めて高価で貴重なため、まず同位体標識を含まない化合物で条件検討を十分に行い、条件を確立した上で同位体標識化合物を用いた反応を行う予定である。

  • Research Products

    (11 results)

All 2017 2016

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 5 results,  Acknowledgement Compliant: 4 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 5 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Journal Article] Double-stranded RNA-binding artificial cationic oligosaccharides stabilizing siRNAs with a low N/P ratio2017

    • Author(s)
      Hara, R. I., Maeda, Y., Sakamoto, T., Wada, T.
    • Journal Title

      ORGANIC & BIOMOLECULAR CHEMISTRY

      Volume: 15 Pages: 1710 - 1717

    • DOI

      10.1039/c6Ob02690g

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] One-pot conversion reactions of glycosyl boranophosphates into glycosyl phosphate derivatives via acyl phosphite intermediates2016

    • Author(s)
      Sato, K., Wada. T
    • Journal Title

      ORGANIC & BIOMOLECULAR CHEMISTRY

      Volume: 14 Pages: 11092 - 11095

    • DOI

      10.1039/c6ob02309f

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Stereocontrolled Solid-Phase Synthesis of Phosphate/ Phosphorothioate (PO/PS) Chimeric Oligodeoxyribonucleotides on an Automated Synthesizer Using an Oxazaphospholidine- Phosphoramidite Method2016

    • Author(s)
      Nukaga, Y., Oka, N., Wada, T.
    • Journal Title

      JOURNAL OF ORGANIC CHEMISTRY

      Volume: 81 Pages: 2753 - 2762

    • DOI

      10.1021/acs.joc.5b02793

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] 核酸医薬への化学的アプローチ2016

    • Author(s)
      和田猛
    • Journal Title

      MEDCHEM NEWS

      Volume: 26 Pages: 18 - 21

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] リン原子修飾オリゴ核酸の立体選択的合成2016

    • Author(s)
      和田猛、岡夏央
    • Journal Title

      有機合成化学協会誌

      Volume: 74 Pages: 31 - 44

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] Artificial cationic oligopeptides that stabilize and activate nucleic acid therapeutics2017

    • Author(s)
      和田猛
    • Organizer
      International symposium for the drug-discovery of the pyrrole-imidazole polyamides as novel biomedicines
    • Place of Presentation
      日本大学桜門会館(東京)
    • Year and Date
      2017-02-24
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 核酸医薬の安定化と薬理活性の向上を実現する分子技術2016

    • Author(s)
      和田猛
    • Organizer
      技術情報協会セミナー(No.611119)
    • Place of Presentation
      技術情報協会(東京)
    • Year and Date
      2016-11-25
    • Invited
  • [Presentation] 核酸医薬の安定化と高活性化に向けた新規分子技術の開発2016

    • Author(s)
      和田猛
    • Organizer
      BioJapan 2016
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川)
    • Year and Date
      2016-10-12
    • Invited
  • [Presentation] New molecular technologies for stabilization and activation of oligonucleotide therapeutics2016

    • Author(s)
      和田猛
    • Organizer
      The First Roundtable Meeting on Chemical Probe Research Hub
    • Place of Presentation
      ホテルレオパレス博多(福岡)
    • Year and Date
      2016-09-22
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] RNA医薬の安定化と活性化に向けた新分子技術の開発2016

    • Author(s)
      和田猛
    • Organizer
      第8会日本RNAi研究会・第3回日本細胞外小胞学会
    • Place of Presentation
      グランドプリンスホテル広島(広島)
    • Year and Date
      2016-09-01
    • Invited
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 重合性化合物、化合物、及び、ボラノホスフェートオリゴマーの製造方法2016

    • Inventor(s)
      和田猛、齋藤竜也、石井友香、額賀陽平
    • Industrial Property Rights Holder
      和田猛、齋藤竜也、石井友香、額賀陽平
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      特願2016-221656
    • Filing Date
      2016-11-14

URL: 

Published: 2021-01-27  

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