2017 Fiscal Year Annual Research Report
Suppression of hepatocarcinogeneis based on the elucidation of HBV integration and epigenome alterations analyzed by G-NaVI
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15H04304
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| Research Institution | St. Marianna University School of Medicine |
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Principal Investigator |
伊東 文生 聖マリアンナ医科大学, 医学部, 教授 (90223180)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
山本 博幸 聖マリアンナ医科大学, 医学部, 准教授 (40332910)
渡邊 嘉行 聖マリアンナ医科大学, 医学部, 講師 (90329243)
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| Project Period (FY) |
2015-04-01 – 2018-03-31
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| Keywords | エピゲノム / HBV / 肝癌 / DNA組み込み / DNAメチル化 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
B型肝炎ウイルス(HBV)関連肝細胞癌は現在も減少しておらずその発生進展機序の解明は重要な課題である。HBV感染にかかわる主要な発癌機序のひとつにHBV DNAのヒトゲノムへの組み込みがある。今までのHBV組み込み解析法では実現できなかった全組み込み解析を可能とすべく、Genome capture法併用次世代シークエンサーによるウイルスDNA全組み込み解析法(G-NaVI法)を考案した。HBVのヒトゲノムへの全組み込みおよびHBV組み込みに伴うHBVおよび宿主ゲノムのエピジェネティックな変化を明らかにすることを目的とした。
1分子ロングリード次世代シーケンサーによるHBV DNA組み込みおよびDNAメチル化の同時解析法の開発および至適化に成功し、HBV DNA組み込みおよびDNAメチル化動態の多様性を明らかにした。また、HBV関連肝細胞癌の遺伝子異常の次世代統合オミクス解析法の至適化に成功した後、対象を拡げ解析することができた。遺伝子変異解析 (MassARRAYやIon PGMシークエンサーを用いた多サンプルの多領域の同時スクリーニング)、DNAメチル化解析(MCA microarray等による網羅的解析)、エピゲノム異常の解析(MCAシークエンス等)、マイクロRNA異常の解析(TaqMan qPCRの他に、microarray、次世代シーケンサー、ChIP-seq等を用いた網羅的な解析)を行い、さまざまな遺伝子異常の蓄積を明らかにした。
HBV DNAのヒトゲノムへの組み込みとHBVおよび宿主ゲノムのエピジェネティックな変化と次世代統合オミクス解析の結果の統合解析に成功した。HBVゲノムの組み込みによる発癌への影響として、ヒトゲノムの染色体不安定性の惹起、組み込み近傍の遺伝子発現制御、組み込み近傍の遺伝子とHBVの融合蛋白の産生の関連などを明らかにした。
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| Research Progress Status |
29年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
29年度が最終年度であるため、記入しない。
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Research Products
(2 results)
