2015 Fiscal Year Annual Research Report
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15H04403
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| Research Institution | The Graduate University for Advanced Studies |
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Principal Investigator |
印南 秀樹 総合研究大学院大学, その他の研究科, 准教授 (90444140)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
八島 亮子 武蔵野大学, 工学部, 助教 (90759573)
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| Project Period (FY) |
2015-04-01 – 2018-03-31
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| Keywords | ゲノム進化 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究は、ゲノムの『脆弱部位』の存在意義に関する固定概念を覆すことを目的とする。脆弱部位は突然変異のホットスポットであるため、基本的には有害な物である。したがって、進化的に一時的に存在するだけで、すぐに淘汰され消滅するものであると考えられている。しかし本申請者は、脆弱部位が進化的に有益に働く局面が多々存在し、その有益性ために脆弱部位は進化的に驚くべき長時間、ゲノムに維持されると仮説を立てた。本申請者は、これを証明するに十分な理論的および実証結果を持っている（次項参照）。申請期間において、これをさらに確実なものとし、さらに発展させる。そして、新しい学説として学界に認識させることをゴールとする。
本年度は初年度であり、ゲノムデータ野収集と解析を行った。現時点で、いもち病菌、マラリア原虫、バクテリアでいい例が見つかりつつある。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
当初の予定通り、本年度は初年度であり、ゲノムデータ野収集と解析を行った。適応進化の強い証拠の見られる遺伝子のデータを収集することは、幅広い文献サーチが必要であり、時間を要するプロセスであるが、その割には順調に進んでいる。現時点で、いもち病菌、マラリア原虫、バクテリアでいい例が見つかりつつある。一方、ゲノムの脆弱部位の特定も行う。あらゆるタイプのゲノムデータから、組換えのホットスポットを見つける作業であるが、順調に進んでいる。
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| Strategy for Future Research Activity |
初年度のデータ解析で得られた知見を反映させたモデル構築、および理論解析を行う。まずはシンプルな１遺伝子座モデルから始め、より現実的なモデルへとつなげる。そして、理論の結果に基づき、仮説の統計検定が出来るような統計フレームワークを構築し、データ解析に生かす。最終年度には、実証結果と理論解析を統合し、結論の一般性を問う形で論文にまとめ発表する。
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