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2015 Fiscal Year Annual Research Report

ヒトと類人猿のゲノムの大きな違い:組換え頻度に関する仮説のゲノム編集を用いた検証

Research Project

Project/Area Number 15H04427
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

古賀 章彦  京都大学, 霊長類研究所, 教授 (80192574)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 平井 啓久  京都大学, 霊長類研究所, 教授 (10128308)
田辺 秀之  総合研究大学院大学, その他の研究科, 准教授 (50261178)
Project Period (FY) 2015-04-01 – 2019-03-31
Keywords霊長類 / 染色体 / ヘテロクロマチン / 組換え / 進化
Outline of Annual Research Achievements

染色体端部の大規模ヘテロクロマチンの有無は、ヒトと類人猿のゲノムの大きな違いである。チンパンジーおよびゴリラにはあって、ヒトにはない。これが染色体端部での組換え頻度に影響を与えているとの仮説を立てた。この仮説を検証することが、本課題の目的である。
この目的ために組換え頻度を測定するが、そのために染色体を加工した細胞を作る必要がある。チンパンジー型ヒト細胞(ヘテロクロマチンを付加したヒト細胞)とヒト型チンパンジー細胞(ヘテロクロマチンを除去したチンパンジー細胞)である。平成27年度はこの作製の作業を行った。いずれも、まずこのヘテロクロマチンを認識する人工ヌクレアーゼを作り、それを培養細胞に作用させるという手順になる。10月に人工ヌクレアーゼが完成し、12月に想定どおり機能することの確認が完了した。それから培養細胞数系統への適用に移った。除去や付加の場所は偶然に影響され様々となるため、適切な場所でこれが起こった細胞を選択する過程が、必要となる。これには細胞分裂10世代分以上の期間を要すると見込んでいる。3月末の時点で、この選択が順調に進行している。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

チンパンジー型ヒト細胞とヒト型チンパンジー細胞の完成は、当初は平成27年度末を目指していた。工程は変わらないものの速度をやや抑え、期間を平成28年度半ばまでに延ばすことにした。ただしこれは、見込み違いが理由ではなく、次に記すように、むしろ発展を見込んでの軌道修正である。
本研究課題の開始後に、ヒトとチンパンジーだけでなく、テナガザルの数種および新世界ザルの数種も、同様のヘテロクロマチンをもっていて本課題の目的のために使えることが、別の課題の成果から判明した。このため、本課題でテナガザルおよび新世界ザルも用いることにした。そして予備的な調査を、11月に開始した。3月末の時点で、ヘテロクロマチンの塩基配列の解読が完了している。

Strategy for Future Research Activity

上に記すように、目的を達成するために対象を広げて、研究をを推進する。とくに新世界ザルのほうで、染色体端部ヘテロクロマチンブロックが表現型に直接影響するとの示唆が、これまでの結果から得られている。むしろこちらを先に解明することで、ヒトとチンパンジーの違いの究明への大きな指標が得られることが、期待できる。数種類の対象を設定して、お互いに補完となる状況で、研究をすすめる。

  • Research Products

    (11 results)

All 2016 2015 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (3 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 3 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (6 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Invited: 2 results) Book (1 results)

  • [Int'l Joint Research] Kasetsart University(タイ)

    • Country Name
      THAILAND
    • Counterpart Institution
      Kasetsart University
  • [Journal Article] CENP-B box, a nucleotide motif involved in centromere formation, occurs in a New World monkey2016

    • Author(s)
      Suntronpong A, Kugou K, Masumoto H, Srikulnath K, Ohshima K, Hirai H, *Koga A
    • Journal Title

      Biology Letters

      Volume: 12 Pages: 20150817

    • DOI

      10.1098/rsbl.2015.0817

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Regulation of functional KCNQ1OT1 lncRNA by β-catenin2016

    • Author(s)
      Sunamura N, Ohira T, Kataoka M, Inaoka D, Tanabe H, Nakayama Y, Oshimura M, *Kugoh H
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 6 Pages: 20690

    • DOI

      10.1038/srep20690

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Higher-order repeat structure in alpha satellite DNA occurs in New World monkeys and is not confined to hominoids2015

    • Author(s)
      Sujiwattanarat P, Thapana W, Srikulnath K, Hirai Y, Hirai H, *Koga A
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 5 Pages: 10315

    • DOI

      10.1038/srep10315

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] ヘルペスウイルスと一体化した巨大DNAトランスポゾンAlbatross2015

    • Author(s)
      井上雄介、佐賀友則、相川拓海、森下真一、成瀬清、島田敦子、古賀章彦、武田洋幸
    • Organizer
      第38回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド(神戸市)
    • Year and Date
      2015-12-01 – 2015-12-04
  • [Presentation] CENP-B box is likely to confer a selective advantage on its host organism2015

    • Author(s)
      Suntrompong A,、久郷和人、舛本寛、平井啓久、古賀章彦
    • Organizer
      第87回日本遺伝学会大会
    • Place of Presentation
      東北大学川内北キャンパス(仙台市)
    • Year and Date
      2015-09-24 – 2015-09-26
  • [Presentation] Transition from diurnal to nocturnal life in the owl monkey may be associated with rapid amplification of constitutive heterochromatin2015

    • Author(s)
      Koga A
    • Organizer
      International Symposium "Non-coding DNA and Chromosomal Integrity"
    • Place of Presentation
      淡路夢舞台国際会議場(兵庫県淡路市)
    • Year and Date
      2015-08-07 – 2015-08-08
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 夜行性への移行に関与したと考えられるヨザルの大規模反復配列2015

    • Author(s)
      古賀章彦、平井啓久
    • Organizer
      第31 回日本霊長類学会大会
    • Place of Presentation
      京都大学百周年時計台記念館(京都市)
    • Year and Date
      2015-07-18 – 2015-07-20
  • [Presentation] Higher-order repeat structure in centromere-region satellite DNA occurs in a wide range of primates2015

    • Author(s)
      Koga A, Hirai Y, Sujiwattanarat P, Thapana W, Baicharoen S, Srikulnath K, Hirai H
    • Organizer
      The 5th Asian Chromosome Colloquium
    • Place of Presentation
      Kasetsart University(タイ王国バンコク市)
    • Year and Date
      2015-04-29 – 2015-05-01
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Role of spatial positioning of chromosome territories: Evolutionary views and characteristics2015

    • Author(s)
      Tanabe H
    • Organizer
      The 5th Asian Chromosome Colloquium
    • Place of Presentation
      Kasetsart University(タイ王国バンコク市)
    • Year and Date
      2015-04-29 – 2015-05-01
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Book] ヒトと類人猿に見られる非コードDNAの大きな違い(小林武彦編「ゲノムを司るインターメア:非コードDNAの新たな展開」の第15章)2015

    • Author(s)
      古賀章彦
    • Total Pages
      12
    • Publisher
      化学同人

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Published: 2017-01-06   Modified: 2022-09-27  

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