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2015 Fiscal Year Annual Research Report

鉄硫黄クラスターの生合成を担うSufBCD複合体の作動機構の解明と阻害剤の開発

Research Project

Project/Area Number 15H04472
Research InstitutionSaitama University

Principal Investigator

高橋 康弘  埼玉大学, 理工学研究科, 教授 (10154874)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 和田 啓  宮崎大学, テニュアトラック推進機構, 准教授 (80379304)
福山 恵一  大阪大学, 工学研究科, 招へい研究員 (80032283)
Project Period (FY) 2015-04-01 – 2019-03-31
Keywords鉄硫黄タンパク質 / 鉄硫黄クラスター / 生合成
Outline of Annual Research Achievements

本研究課題の進行状況を以下にまとめる。
1)SufBCD複合体の結晶構造を世界に先駆けて決定した。SufBとSufDの立体構造は相同で、どちらもN末端ヘリカルドメインとC末端ヘリカルドメインの間に、20本のストランドが扁平ならせん状に巻き付いたユニークなβ-ヘリカルコアドメインを持つことが明らかになった。この構造からは、ATPの存在下でSufC2分子が会合しSufBとSufDのβ-ヘリカルコアドメインに大きな構造変化が生じるという可能性が推定され、これについて生化学的に検証した。
2)イソプレノイドの生合成系を改変することによってFe-Sクラスター生合成系の必須性を回避し、“Fe-Sクラスターがなくても生きられる大腸菌変異株”をはじめて構築した。この変異株の特性を明らかにするとともに、関連する遺伝子群を自在に操作することのできる実験系を開発した。
3)SufBとSufDに系統的な変異を導入し、in vivo 機能に重要な9残基を同定した。そのうち6残基はSufBのβ-ヘリカルコアドメインのN末端側領域に集中しており、残りの3残基はSufBとSufDとの会合面とその近傍に位置していた。これら二つの領域にはシステインが1残基ずつ含まれており、その2残基は他の19種類のアミノ酸では代替できない必須残基であることを明らかにした。
4)SufBCD複合体の阻害剤のスクリーニングに着手した。本年度は、理化学研究所の化合物バンク(NPDepo)のうち、化合物アレイを用いて約30,000種の化合物の中からSufBCD複合体に結合する化合物1072種を同定した。今後、in vivoにおける阻害効果を検討する。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

SufBCD複合体の構造解析ならびに変異導入解析によって、作動機構に関する重要な手掛かりが得られた。研究成果を論文として公表するとともに、進行中のものは学会で発表しており、研究計画が概ね順調に進展していると判断できる。

Strategy for Future Research Activity

SufBCD複合体の作動機構を包括的に理解するためには、結晶構造に基づいて生理学的・生化学的な研究をさらに発展させる必要がある。加えて、構造機能相関や構造変化の実体を捉えるためにも、SufBCD複合体に強固に結合する阻害剤のスクリーニングを進める。

  • Research Products

    (9 results)

All 2016 2015 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (2 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 2 results,  Acknowledgement Compliant: 2 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 1 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] University of South Carolina(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      University of South Carolina
  • [Journal Article] Novel features of the ISC machinery revealed by characterization of Escherichia coli mutants that survive without iron-sulfur clusters.2016

    • Author(s)
      Naoyuki Tanaka, Miaki Kanazawa, Keitaro Tonosaki, Nao Yokoyama, Tomohisa Kuzuyama and Yasuhiro Takahashi
    • Journal Title

      Mol. Microbiol.

      Volume: 99 Pages: 835-848

    • DOI

      10.1111/mmi.13271.

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Functional Dynamics Revealed by the Structure of the SufBCD Complex, a Novel ATP-binding Cassette (ABC) Protein That Serves as a Scaffold for Iron-Sulfur Cluster Biogenesis.2015

    • Author(s)
      Kei Hirabayashi, Eiki Yuda, Naoyuki Tanaka, Sumie Katayama, Kenji Iwasaki, Takashi Matsumoto, Genji Kurisu, F. Wayne Outten, Keiichi Fukuyama, Yasuhiro Takahashi, and Kei Wada
    • Journal Title

      J. Biol. Chem.

      Volume: 290 Pages: 29717-29731

    • DOI

      10.1074/jbc.M115.680934.

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] 広がりゆく鉄硫黄タンパク質の世界2015

    • Author(s)
      高橋康弘
    • Organizer
      BMB2015(第38回分子生物学会年会・第88回生化学会大会合同大会)
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド(兵庫県・神戸市)
    • Year and Date
      2015-12-01 – 2015-12-04
    • Invited
  • [Presentation] 枯草菌の鉄硫黄クラスター生合成関連遺伝子群の多重破壊株の性質2015

    • Author(s)
      飴野佑美子、横山奈央、朝井計、高橋康弘
    • Organizer
      BMB2015(第38回分子生物学会年会・第88回生化学会大会合同大会)
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド(兵庫県・神戸市)
    • Year and Date
      2015-12-01 – 2015-12-04
  • [Presentation] 大腸菌の鉄硫黄クラスター生合成系(SUFマシナリー)の中核を担うSufBタンパク質の機能解析2015

    • Author(s)
      湯田瑛樹、田中尚志、高橋康弘
    • Organizer
      第14 回微生物研究会
    • Place of Presentation
      明治大学 生田キャンパス(神奈川県川崎市)
    • Year and Date
      2015-10-31
  • [Presentation] Identification and Analysis of Functional Residues of the SufB Fe-S Cluster Biosynthesis Scaffold Protein.2015

    • Author(s)
      Eiki Yuda, Takayuki Sato, Naoyuki Tanaka, Kei Hirabayashi, Kei Wada, and Yasuhiro Takahashi
    • Organizer
      RIKEN Symposium, “Metals in Biology” in Wako
    • Place of Presentation
      理化学研究所(埼玉県和光市)
    • Year and Date
      2015-06-16 – 2015-06-17
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 大腸菌の鉄硫黄クラスター生合成におけるSufBの機能残基の同定とその役割2015

    • Author(s)
      湯田瑛樹、佐藤喬之、田中尚志、平林佳、和田啓、高橋康弘
    • Organizer
      第12回21世紀大腸菌研究会
    • Place of Presentation
      琵琶湖グランドホテル・京近江(滋賀県大津市)
    • Year and Date
      2015-06-04 – 2015-06-05
  • [Remarks] 埼玉大学理学部 分子統御研究室

    • URL

      http://park.saitama-u.ac.jp/~tougyo/tougyo_web2/Home.html

URL: 

Published: 2018-01-16   Modified: 2022-10-07  

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