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2016 Fiscal Year Annual Research Report

鉄硫黄クラスターの生合成を担うSufBCD複合体の作動機構の解明と阻害剤の開発

Research Project

Project/Area Number 15H04472
Research InstitutionSaitama University

Principal Investigator

高橋 康弘  埼玉大学, 理工学研究科, 教授 (10154874)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 福山 恵一  大阪大学, 工学研究科, 招へい研究員 (80032283)
和田 啓  宮崎大学, テニュアトラック推進機構, 准教授 (80379304)
Project Period (FY) 2015-04-01 – 2019-03-31
Keywords鉄硫黄タンパク質 / 鉄硫黄クラスター / 生合成
Outline of Annual Research Achievements

本年度の進行状況を以下にまとめる。
1)昨年度明らかにしたSufBとSufDのin vivo機能に重要な9残基のそれぞれをアラニンに置換した変異型SufBCD複合体を精製し、生化学的な解析によって、SufEからSufBへの硫黄転移反応に関与するシステイン残基を同定した。昨年度報告したSufBCD複合体の結晶構造によると、このシステインはSufBのβ-ヘリカルコアドメインのN末端側領域に位置しており、その近傍には他に5つの機能残基が集中していることが明らかになった。
2)SufBとSufDとの会合面にはin vivo機能に必須な3残基が集中しているが、二重・三重の変異を導入することによって、重要な3残基をさらに同定することができた。この会合面が鉄硫黄クラスターの新規形成部位として機能すると推定されるが、そのためにはSufB-SufDの会合面が解離する必要がある。今後、この点について検討を深める。
3)グラム陽性細菌のFe-Sクラスター生合成系は、大腸菌のSUFマシナリーとISCマシナリーのキメラタイプと予想され、成分の構成には顕著な違いがある。枯草菌のイソプレノイド生合成系を改変した上で、sufCDSUBオペロンについて遺伝学的な解析を進め、このオペロンにコードされるSUF様マシナリーが枯草菌で唯一のクラスター生合成系であること、オペロン内の5遺伝子はどれもその機能に必須であることを明らかにした。
4)大腸菌の変異株を利用してSUFマシナリーに特異的な阻害剤のin vivoスクリーニングを進めたが、大腸菌細胞内には多くの化合物が入りにくいことが分かった。枯草菌の変異株を用いたスクリーニングにスイッチして検討を進めている。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

昨年度報告したSufBCD複合体の結晶構造に基づいて種々の変異を導入し、in vivoとin vitroにおける解析を有機的に連携して、作動機構に関する理解を深めることができた。したがって、研究計画は概ね順調に進展していると評価した。

Strategy for Future Research Activity

SufBCD複合体の作動機構をより深く理解するためには、生理学的・生化学的な研究をさらに発展させる必要がある。今後は、大腸菌と枯草菌との間の比較についても解析を進め、それぞれの特性と普遍的なメカニズムの解明に努める。

  • Research Products

    (12 results)

All 2017 2016 Other

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (9 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] A substrate-bound structure of cyanobacterial biliverdin reductase identifies stacked substrates as critical for activity2017

    • Author(s)
      Haruna Takao, Kei Hirabayashi, Yuki Nishigaya, Haruna Kouriki, Tetsuko Nakaniwa, Yoshinori Hagiwara, Jiro Harada, Hideaki Sato, Toshimasa Yamazaki, Yoichi Sakakibara, Masahito Suiko, Yujiro Asada, Yasuhiro Takahashi, Ken Yamamoto, Keiichi Fukuyama, Masakazu Sugishima, and Kei Wada
    • Journal Title

      Nat. Commun.

      Volume: 8 Pages: 1-10

    • DOI

      10.1038/ncomms14397.

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] 化学機械エンジン”と呼ばれるタンパク質群---ABC タンパク質がもつ機能性ドメインの多様性2017

    • Author(s)
      和田啓、高橋康弘
    • Journal Title

      化学

      Volume: 72 Pages: 70-71

  • [Presentation] 鉄硫黄クラスター生合成系の多様性:グラム陽性菌に見られるキメラ型生合成系の逆遺伝学的解析2017

    • Author(s)
      横山奈央、丸山ちひろ、野中ちひろ、葛山智久、朝井計、高橋康弘
    • Organizer
      第11回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      慶應義塾大学湘南藤沢キャンパス(神奈川県藤沢市)
    • Year and Date
      2017-03-02 – 2017-03-04
  • [Presentation] 鉄硫黄クラスター生合成系の必須成分の機能をバイパスするサプレッサー変異の解析2016

    • Author(s)
      金澤美秋、田中尚志、松嶋夢叶、高橋康弘
    • Organizer
      第39回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)
    • Year and Date
      2016-11-30 – 2016-12-02
  • [Presentation] グラム陽性細菌のキメラ型鉄硫黄クラスター生合成系:破壊株の構築と異種間相補解析2016

    • Author(s)
      横山奈央、寺畑拓也、丸山ちひろ、葛山智久、朝井計、高橋康弘
    • Organizer
      日本農芸化学会関東支部2016年度大会
    • Place of Presentation
      日本獣医生命科学大学 第一校舎(東京都武蔵野市)
    • Year and Date
      2016-10-15
  • [Presentation] 鉄硫黄クラスター生合成系の中核成分 SufBCD複合体の遺伝生化学的解析2016

    • Author(s)
      湯田瑛樹, 藤城貴史, 田中尚志, 平林佳, 福山恵一, 和田啓, 高橋康弘
    • Organizer
      第89回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      仙台国際センター(宮城県仙台市)、東北大学川内北キャンパス(宮城県仙台市)
    • Year and Date
      2016-09-25 – 2016-09-27
  • [Presentation] グラム陽性細菌に見られるユニークな鉄硫黄クラスター生合成オペロン(sufCDSUB)の遺伝学的解析2016

    • Author(s)
      横山奈央, 丸山ちひろ, 野中ちひろ, 寺畑拓也, 葛山智久, 朝井計, 高橋康弘
    • Organizer
      第89回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      仙台国際センター(宮城県仙台市)、東北大学川内北キャンパス(宮城県仙台市)
    • Year and Date
      2016-09-25 – 2016-09-27
  • [Presentation] 鉄硫黄クラスター生合成系の必須成分の機能をバイパスするサプレッサー変異の遺伝学的解析2016

    • Author(s)
      金澤美秋、田中尚志、松嶋夢叶、高橋康弘
    • Organizer
      日本遺伝学会第88回大会
    • Place of Presentation
      日本大学国際関係学部(静岡県三島市)
    • Year and Date
      2016-09-07 – 2016-09-10
  • [Presentation] 枯草菌のキメラ型鉄硫黄クラスター生合成系の遺伝学的解析2016

    • Author(s)
      横山奈央、寺畑拓也、丸山ちひろ 、野中ちひろ、葛山智久、朝井計、高橋康弘
    • Organizer
      2016年度グラム陽性菌ゲノム機能会議
    • Place of Presentation
      KKR ホテル熱海 (静岡県熱海市)
    • Year and Date
      2016-08-29 – 2016-08-30
  • [Presentation] 枯草菌の鉄硫黄クラスター生合成系:破壊株の構築と異種間相補解析2016

    • Author(s)
      横山奈央、丸山ちひろ、野中ちひろ、葛山智久、朝井計、髙橋康弘
    • Organizer
      平成28年度日本生化学会関東支部例会
    • Place of Presentation
      自治医科大学医学部(栃木県下野市)
    • Year and Date
      2016-06-11
  • [Presentation] 鉄硫黄クラスターの生合成を担うSufBCD複合体の変異導入解析2016

    • Author(s)
      湯田瑛樹、田中尚志、藤城貴史、高橋康弘
    • Organizer
      平成28年度日本生化学会関東支部例会
    • Place of Presentation
      自治医科大学医学部(栃木県下野市)
    • Year and Date
      2016-06-11
  • [Remarks] 埼玉大学大学院 理工学研究科 分子統御研究室

    • URL

      http://park.saitama-u.ac.jp/~tougyo/tougyo_web2/Home.html

URL: 

Published: 2018-01-16  

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