• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2017 Fiscal Year Annual Research Report

Variety and regulation of lanthanide-dependent methanol dehydrogenases

Research Project

Project/Area Number 15H04476
Research InstitutionOkayama University

Principal Investigator

谷 明生  岡山大学, 資源植物科学研究所, 准教授 (00335621)

Project Period (FY) 2015-04-01 – 2018-03-31
KeywordsMethylotroph / methanol / lanthanide
Outline of Annual Research Achievements

Methylobacterium属細菌は植物葉上の主要な共生細菌であり、植物が放出するメタノールを利用して優占化している。本属細菌が持つ複数のメタノール脱水素酵素(MDH)のうち、MxaFはカルシウム依存型MDHであり、XoxFはランタノイド(Ln)型MDHであることことが最近分かってきた。ランタノイドに依存する酵素として初めて知られた例である。本属細菌におけるこれらの発現調節や、これら遺伝子のホモログの機能の多くが理解されていない。
本研究では、Methylobacterium属細菌において、これら二つがメタノール、エタノールでの生育に必須であること、他のADHがプロパノールなどのアルコールへの生育に関与することを遺伝学的に明らかにした。
またXoxF1欠失株はMxaFの発現が起こらなくなりメタノールへの生育能を失うが、自然突然抑制変異株のゲノム解析から、MxaF, XoxFの発現切り替え機構に関わるMxbD遺伝子に変異が見つかった。MxbD遺伝子について遺伝学的解析を行い、MxbDがMxaFの発現に必要であること、XoxFの発現には必要無いこと、またMxbDのHAMPドメインにおける自然突然変異がMxaF発現のXoxF発現依存性を解除することを明らかにした。
一方でXoxFが多くの微生物ゲノムに見つかることから、ランタノイドに依存したメチロトロフの存在が示唆された。そこでランタノイド存在下でメタンに生育する細菌のスクリーニングを行ったところ、ランタノイドに依存したメタノトロフは得られなかったが、ランタノイドに依存または生育が促進される新属のメタノール資化性細菌を分離し、これらをOharaeibacter diazotrophicus及びNovimethylophilus kurashikiensis と名付けた。これらの株のゲノム解析及びMDH遺伝子の発現等を調べ、ランタノイド依存的生育を示す後者の株はMxaFを持たないことを確認した。

Research Progress Status

29年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

29年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (15 results)

All 2018 2017 Other

All Int'l Joint Research (3 results) Journal Article (5 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results,  Peer Reviewed: 5 results,  Open Access: 5 results) Presentation (7 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 1 results)

  • [Int'l Joint Research] ムグラ大学(トルコ)

    • Country Name
      TURKEY
    • Counterpart Institution
      ムグラ大学
  • [Int'l Joint Research] ジョモケニアッタ農工大学(ケニア)

    • Country Name
      KENYA
    • Counterpart Institution
      ジョモケニアッタ農工大学
  • [Int'l Joint Research] ブラパー大学(タイ)

    • Country Name
      THAILAND
    • Counterpart Institution
      ブラパー大学
  • [Journal Article] Distribution of 1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase and D-cysteine desulfhydrase genes among type species of the genus Methylobacterium.2018

    • Author(s)
      Ekimova GA, Fedorov DN, Tani A, Doronina NV, Trotsenko YA.
    • Journal Title

      Antonie Van Leeuwenhoek

      Volume: - Pages: 1-12

    • DOI

      10.1007/s10482-018-1061-5.

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Isolation and genomic characterization of Novimethylophilus kurashikiensis gen. nov. sp. nov., a new lanthanide-dependent methylotrophic species of Methylophilaceae.2018

    • Author(s)
      Lv H, Sahin N, Tani A
    • Journal Title

      Environ Microbiol

      Volume: 20 Pages: 1204-1223

    • DOI

      doi:10.1111/1462-2920.14062

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Lanthanide-dependent regulation of methylotrophy in Methylobacterium aquaticum strain 22A2018

    • Author(s)
      Masuda S, Suzuki Y, Fujitani Y, Mitsui R, Nakagawa T, Shintani M, Tani A
    • Journal Title

      mSphere

      Volume: 3 Pages: e00462-17

    • DOI

      10.1128/mSphere.00462-17

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Cultivable Methylobacterium species diversity in rice seeds identified with whole-cell matrix-assisted laser desorption / ionization time-of-flight mass spectrometric analysis2018

    • Author(s)
      Okumura M, Fujitani Y, Maekawa M, Charoenpanich J, Murage H, Kimbara K, Sahin N, Tani A
    • Journal Title

      J. Biosci. Bioeng

      Volume: 123 Pages: 190-196

    • DOI

      10.1016/j.jbiosc.2016.09.001

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Oharaeibacter diazotrophicus gen. nov., sp. nov., a diazotrophic and facultatively methylotrophic bacterium, isolated from rice rhizosphere2017

    • Author(s)
      Lv HX, Masuda S, Fujitani Y, Sahin N, Tani A
    • Journal Title

      Int J Syst Evol Microbiol

      Volume: 67 Pages: 576-582

    • DOI

      10.1099/ijsem.0.001660

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] Methylobacterium 属細菌におけるメタノール走化性センサーの機能解析2018

    • Author(s)
      春名優希、加藤純一、谷 明生
    • Organizer
      日本農芸化学 会 名古屋 名城大学
  • [Presentation] Methylobacterium aquaticum strain 22A に おけるメタノール脱水素酵素遺伝子のラン タノイド依存的制御2018

    • Author(s)
      平賀翔大、藤谷良子、谷 明生
    • Organizer
      日本農芸化学 会 名古屋 名城大学
  • [Presentation] Draft genome and description of Novimethylophilus kurashikiensis gen. nov. sp. nov., a new lanthanide-dependent methylotrophic species of Methylophilaceae2018

    • Author(s)
      Haoxin Lyu and Akio Tani
    • Organizer
      日本農芸化学 会 名古屋 名城大学
  • [Presentation] Methylobacterium 属細菌におけるメタノー ル走化性センサーの同定2017

    • Author(s)
      伊賀俊貴、加藤純一、谷 明生
    • Organizer
      日本農芸化学会 2017 年度大会 京都 京都女子大
  • [Presentation] Genomic characterization of a new methylotroph, Oharaeibacter diazotrophicus SM302017

    • Author(s)
      H. Lv, A. Tani
    • Organizer
      日本農芸化学会 2017 年度大会 京都 京都女子大
  • [Presentation] 植物共生メタノール資化性細菌 Methylobacterium 属細菌におけるエルゴチオネイン生産と役割2017

    • Author(s)
      谷 明生
    • Organizer
      環境微生物系合同大会 公募シンポ6
    • Invited
  • [Presentation] Methylophilus sp. La2-4, a lanthanide-dependent methanol-utilizing bacterium isolated from rice rhizosphere soil2017

    • Author(s)
      Lv HX, Sahin N, Tani A
    • Organizer
      IUMS2017, Singapore
    • Int'l Joint Research

URL: 

Published: 2018-12-17  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi