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2016 Fiscal Year Annual Research Report

前駆体tRNAプロセシング酵素の構造と機能の解明とその有効利用

Research Project

Project/Area Number 15H04487
Research InstitutionKyushu University

Principal Investigator

木村 誠  九州大学, 農学研究院, 教授 (10204992)

Project Period (FY) 2015-04-01 – 2018-03-31
KeywordsリボヌクレアーゼP / RNA結合タンパク質
Outline of Annual Research Achievements

超好熱性アーキア(Pyrococcus horikosii OT3)RNasePは、1分子のRNA(PhopRNA)と5種のタンパク質(PhoPop5、PhoRpp21、PhoRpp29、PhoRpp30、PhoRpp38)から構成され、PhopRNA単独では触媒活性を示さず、タンパク質との相互作用により活性化される。本年度は、構成タンパク質PhoRpp21とPhoRpp29のPhopRNAに対する結合能を検討した。その結果、PhoRpp21は単独でPhopRNAと結合できるのに対し、PhoRpp29はPhoRpp21の非存在下ではPhopRNAに対する結合能が弱いことが分かった。次に、PhoRpp21-PhoRpp29のPhopRNA活性化に関与するアミノ酸をPhoRpp21 N 末端ヘリックスに位置するLys53、Lys54、Lys56とArg82、Arg84、Arg86、およびPhoRpp29のC末端10アミノ酸残基と特定した。次に、PhoRpp21-PhoRpp29複合体のPhopRNAにおける結合部位の特定を試みた。その結果、複合体はCRIIIを含む一本鎖領域に結合することが分かった。
以上の結果を総合して、PhoRpp21-PhoRpp29複合体はPhoRpp21のC末端領域のArg残基を介してPhopRNAのP11とP12へリックス(二本鎖構造)を繋ぐループ近傍(A198-U214)に結合し、PhoRpp21 N 末端ヘリックスに位置するLys53、Lys54、Lys56とPhoRpp29のC末端10アミノ酸残基が、PhopRNAのCドメインの構造形成を促進するとともに、pre-tRNA結合領域の構造形成にも関与していることが示唆された。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

今回の研究成果とこれまでの研究成果を総合して、超好熱性アーキアリボヌクレアーゼPの高次構造モデルを作成することができた。

Strategy for Future Research Activity

今年度は、上記の高次構造モデルを実験的に検証する予定である。

  • Research Products

    (2 results)

All 2017 2016

All Journal Article (2 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 2 results,  Acknowledgement Compliant: 2 results)

  • [Journal Article] Functional characterization of archaeal homologues of a human nuclear RNase P proteins Rpp21 and Rpp29 provides insights into the molecular basis of their cooperativity in catalysis2017

    • Author(s)
      180.D. Jiang, K. Izumi, T. Ueda, K. Oshima, T. Nakashima, and M. Kimura
    • Journal Title

      Biochem. Biophys. Res. Commun

      Volume: 482 Pages: 68-74

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2016.10.142

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Structural basis for recognition of a kink-turn motif by an archaeal homologue of human RNase P protein Rpp382016

    • Author(s)
      179.K. Oshima, Y. Kakiuchi, Y. Tanaka, T. Ueda, T. Nakashima, M. Kimura, and M. Yao
    • Journal Title

      Biochem. Biophys. Res. Commun

      Volume: 474 Pages: 541-546

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2016.04.118

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant

URL: 

Published: 2018-01-16  

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