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2017 Fiscal Year Annual Research Report

Species-dependent neural function organized by non-coding RNAs

Research Project

Project/Area Number 15H04603
Research InstitutionKyushu University

Principal Investigator

今村 拓也  九州大学, 医学研究院, 准教授 (90390682)

Project Period (FY) 2015-04-01 – 2018-03-31
Keywords種特異的 / 転写因子 / ノンコーディングRNA / DNA脱メチル化 / 神経幹細胞
Outline of Annual Research Achievements

本課題は、種特異的ノンコーディングRNA(ncRNA)獲得と機能化が、既存のタンパク質をコードする遺伝子の発現スイッチを多様化しうるのか検定するものである。平成29年度は、先ず、1)げっ歯類と霊長類の多能性幹細胞から神経幹細胞に分化する過程におけるトランスクリプトーム変化の同定に成功した。また、げっ歯類においては、2)神経幹細胞が発達に伴い変化するメカニズムに関与する重要転写因子群を同定した。さらに、この成果を基礎として、3)神経幹細胞における機能転写因子の発現を制御しうる霊長類特異的ncRNAを同定し、機能解析を進行した。
1)2)については、新学術領域研究「先進ゲノム支援」のサポートを得て、マウス・チンパンジーに共通して存在し、且つ、時間経過とともに発現変化する重要転写因子群に着目することで、神経幹細胞を基点とした神経回路形成のためのゲノム修飾プロセスが、以下の3 つのステップから成り立っていることを明らかにした:I. 多能性幹細胞から誘導された神経幹細胞からは、先ずニューロンのみが優先的に産生されるが、このとき、ゲノム DNA における Sox2・Sox21・Ascl1の結合とDNA 脱メチル化が強く結びついて起こる。II. 次に、神経幹細胞は、Nuclear factor I(NFI)による DNA 脱メチル化の誘導により、ゲノム全体にわたる制御を一新し、神経幹細胞が産み出す細胞を、アストロサイトやオリゴデンドロサイトを生み出せる状態に移行させる。III. 一旦アストロサイトやオリゴデンドロサイトへと分化した細胞では、ニューロンで機能する遺伝子発現制御領域を再メチル化し強制的に OFF にすることで、アストロサイトやオリゴデンドロサイトから別の細胞、すなわちニューロンへと再分化されないように固定される。
1)2)の一部については責任著者として論文に採択され(Sanosaka et al., Cell Reports, 2017)、3)についても一部投稿準備中である。

Research Progress Status

29年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

29年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (13 results)

All 2018 2017 Other

All Journal Article (3 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 1 results) Presentation (9 results) (of which Int'l Joint Research: 6 results,  Invited: 2 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Epigenetic regulation of neural stem cell differentiation towards spinal cord regeneration2018

    • Author(s)
      Kameda Tomonori、Imamura Takuya、Nakashima Kinichi
    • Journal Title

      Cell and Tissue Research

      Volume: 371 Pages: 189~199

    • DOI

      10.1007/s00441-017-2656-2

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] DNA Methylome Analysis Identifies Transcription Factor-Based Epigenomic Signatures of Multilineage Competence in Neural Stem/Progenitor Cells2017

    • Author(s)
      Sanosaka Tsukasa、Imamura Takuya、Hamazaki Nobuhiko、Chai MuhChyi、Igarashi Katsuhide、Ideta-Otsuka Maky、Miura Fumihito、Ito Takashi、Fujii Nobuyuki、Ikeo Kazuho、Nakashima Kinichi
    • Journal Title

      Cell Reports

      Volume: 20 Pages: 2992~3003

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2017.08.086

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Detection of Bidirectional Promoter-Derived lncRNAs from Small-Scale Samples Using Pre-Amplification-Free Directional RNA-seq Method2017

    • Author(s)
      Hamazaki Nobuhiko、Nakashima Kinichi、Hayashi Katsuhiko、Imamura Takuya
    • Journal Title

      Methods in Molecular Biology

      Volume: 1605 Pages: 83~103

    • DOI

      10.1007/978-1-4939-6988-3_6

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 長鎖ncRNAによるほ乳類エピゲノム制御2017

    • Author(s)
      今村拓也
    • Organizer
      ConBio2017
    • Invited
  • [Presentation] Regulation of non-coding RNA contributes to the complete cessation of cell proliferation of neuron-like cells2017

    • Author(s)
      Takuya IMAMURA
    • Organizer
      France Japan Epigenetics Workshop 2017
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] ニューロンにおけるエピゲノム制御とその破綻2017

    • Author(s)
      今村拓也
    • Organizer
      第44回日本毒性学会学術大会
    • Invited
  • [Presentation] DNA methylomes identifiy transcription factor-based epigenomic signatures for timed acquisition of differentiation competence in neural stem/progenitor cells towards neuronal and glia lineages2017

    • Author(s)
      今村拓也、佐野坂司、浜崎伸彦、Chai Muh Chyi、五十嵐勝秀、大塚まき、三浦史仁、伊藤隆司、藤井信之、池尾一穂、中島欽一
    • Organizer
      4th World Congress of Reproductive Biology
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] DNA methylome analysis identifies transcription factor-based epigenomic signatures of multi-lineage competence in neural stem/progenitor cells2017

    • Author(s)
      今村拓也、佐野坂司、浜崎伸彦、Chai Muh Chyi、五十嵐勝秀、大塚まき、三浦史仁、伊藤隆司、藤井信之、池尾一穂、中島欽一
    • Organizer
      The 72nd Fujihara Seminar Molecular Mechanism of Molding and Disruption of the Epigenomes Underlying Cellular Community
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Mechanism underlying developmental stage dependent changes in neural stem cells responsiveness to Bone Morphogenetic Proteins2017

    • Author(s)
      本田瑞季、堅田明子、大塚まき、山本直樹、五十嵐勝秀、今村拓也、中島欽一
    • Organizer
      The 72nd Fujihara Seminar Molecular Mechanism of Molding and Disruption of the Epigenomes Underlying Cellular Community
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Neuronal activity-dependent DNA methylation changes in the naive hippocampal neurons accelerate gene expression responses to the following stimuli2017

    • Author(s)
      亀田朋典、今村拓也、滝沢琢己、三浦史仁、伊藤隆司、中島欽一
    • Organizer
      The 72nd Fujihara Seminar Molecular Mechanism of Molding and Disruption of the Epigenomes Underlying Cellular Community
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Regulation of non-coding RNA contributes to the complete cessation of cell proliferation of neuron-like cells2017

    • Author(s)
      今村拓也、山本直樹、阿形清和、中島欽一
    • Organizer
      第43回内藤コンファレンス
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] マウス海馬ニューロンは神経活動依存的にDNAメチロームを変動し、脱メチル化を介して遺伝子発現応答を高速化する2017

    • Author(s)
      亀田朋典、今村拓也、滝沢琢己、三浦史仁、伊藤隆司、中島欽一
    • Organizer
      第11回日本エピジェネティクス研究会年会
  • [Remarks] ほ乳類神経幹細胞が変化するメカニズムを明らかに(九州大学プレスリリース)

    • URL

      https://www.kyushu-u.ac.jp/ja/researches/view/171

URL: 

Published: 2018-12-17  

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