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2016 Fiscal Year Annual Research Report

エピゲノムとミトコンドリアを機能的に連結する分子機序と病態関連性

Research Project

Project/Area Number 15H04707
Research InstitutionKumamoto University

Principal Investigator

中尾 光善  熊本大学, 発生医学研究所, 教授 (00217663)

Project Period (FY) 2015-04-01 – 2018-03-31
Keywordsエピゲノム / ミトコンドリア / 遺伝子 / クロマチン / 代謝
Outline of Annual Research Achievements

遺伝子の発現を調節するエピゲノム(印付けられたゲノム)が、どのように形成されて、また変換されるのか、その根本的な制御については不明な点が多い。ミトコンドリアに由来する代謝物が、エピゲノムの修飾基やその修飾酵素の補酵素として使われており、クロマチンリモデリングなどの核内事象がエネルギー(ATP)依存性であることから、エピゲノムとミトコンドリアが連動する未知の仕組みがあると考えられる。
本研究では、エピゲノムとミトコンドリアの共同性に着目し、新規の制御機構を明らかにすることを目的とした。具体的には、エピゲノムとミトコンドリアに関連性をもつ約80の候補を選出した。特異的なsiRNAライブラリーと各種細胞株(がん細胞株、線維芽細胞)を用いて、有力な15分子を絞り込み、その機能解析、相互作用(複合体)の解析、ChIP-Seqによる標的遺伝子の網羅的解析を実施した。とくに、ヒストンH4K20モノメチル化酵素(SETD8/PR-Set7)が老化細胞でタンパク質量が著減すること、SETD8を阻害すると細胞老化が誘導されて、核小体とミトコンドリアに関わる遺伝子群の発現が増加することから、SETD8が細胞老化の代謝リモデリングを抑制する新知見を見出した。細胞老化のエピジェネティックな新機序について報告した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

エピゲノムとミトコンドリアを機能的に連結する因子について、新知見を得ている。また、ヒストンH4K20メチル化酵素(SETD8)が細胞老化を防御して、核小体とミトコンドリアに関わる遺伝子群の発現を抑制する機序に関する最先端の研究成果が出ているため。

Strategy for Future Research Activity

本研究は、当初の計画以上に進展してきたため、今後も引き続き研究を推進する。

  • Research Products

    (22 results)

All 2017 2016 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Journal Article (11 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 11 results,  Open Access: 4 results,  Acknowledgement Compliant: 4 results) Presentation (6 results) (of which Invited: 6 results) Book (2 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] 国立衛生学研究所NIH(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      国立衛生学研究所NIH
  • [Int'l Joint Research] Ningbo大学/Harbin医科大学(中国)

    • Country Name
      CHINA
    • Counterpart Institution
      Ningbo大学/Harbin医科大学
  • [Journal Article] Correlation between histone acetylation and expression of Notch1 gene in human lung carcinoma and its role in the origin of combined small cell lung carcinoma2017

    • Author(s)
      W.A. Hassan, S. Takebayashi, M.O.A. Abdalla, K. Fujino, S. Kudoh, Y. Motooka, Y. Sato, Y. Naito, K. Higaki, J. Wakimoto, S. Okada, M. Nakao, Y. Ishikawa, and T. Ito
    • Journal Title

      Lab. Invest.

      Volume: 97 Pages: 913-921

    • DOI

      10.1038/labinvest.2017.36

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] The SETD8/PR-Set7 methyltransferase functions as a barrier to prevent senescence-associated metabolic remodeling2017

    • Author(s)
      H. Tanaka, S. Takebayashi, A. Sakamoto, T. Igata, Y. Nakatsu, N. Saitoh, S. Hino, and M. Nakao.
    • Journal Title

      Cell Rep.

      Volume: 18 Pages: 2148-2161

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2017.02.021

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] The glucocorticoid receptor regulates the ANGPTL4 gene in a CTCF-mediated chromatin context in human hepatic cells2017

    • Author(s)
      M. Nakamoto, K. Ishihara, T. Watanabe, A. Hirosue, S. Hino, M. Shinohara, H. Nakayama, and M. Nakao.
    • Journal Title

      PLoS One

      Volume: 12 Pages: e0169225

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0169225

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Analysis of estrogen receptor-beta gene methylation in autistic males in a Chinese Han population2017

    • Author(s)
      X. Wang, S. Liang, Y. Sun, H. Li, F. Endo, M. Nakao, N. Saitoh, and L. Wu.
    • Journal Title

      Metab. Brain Dis.

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      10.1007/s11011-017-9990-7

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] DNA methylation-independent removable insulator controls chromatin remodeling at the HOXA gene locus via retinoic acid signaling2016

    • Author(s)
      K. Ishihara, M. Nakamoto, and M. Nakao.
    • Journal Title

      Hum. Mol. Genet.

      Volume: 25 Pages: 5383-5394

    • DOI

      10.1093/hmg/ddw354

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Potential neuroprotective effects of an LSD1 inhibitor in retinal ganglion cells via p38 MAPK-gamma activity2016

    • Author(s)
      T. Tsutsumi, K. Iwao, H. Hayashi, T. Kawaji, T. Inoue, S. Hino, M. Nakao, and H. Tanihara.
    • Journal Title

      Invest. Ophthalmol. Vis. Sci.

      Volume: 57 Pages: 6461-6473

    • DOI

      10.1167/iovs.16-19494

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] UHRF1 regulates global DNA hypomethylation and is associated with poor prognosis in esophageal squamous cell carcinoma2016

    • Author(s)
      K. Nakamura, Y. Baba, K. Kosumi, K. Harada, H. Shigaki, K. Miyake, Y. Kiyozumi, M. Ohuchi, J. Kurashige, T. Ishimoto, M. Iwatsuki, Y. Sakamoto, N. Yoshida, M. Watanabe, M. Nakao, and H. Baba.
    • Journal Title

      Oncotarget

      Volume: 7 Pages: 57821-57831

    • DOI

      10.18632/oncotarget.11067

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Application of targeted enrichment to next-generation sequencing of retroviruses integrated into the host human genome2016

    • Author(s)
      P. Miyazato, H. Katsuya, A. Fukuda, Y. Uchiyama, M. Matsuo, M. Tokunaga, S. Hino, M. Nakao, and Y. Satou.
    • Journal Title

      Sci. Rep.

      Volume: 6 Pages: 28324

    • DOI

      10.1002/ijc.29714

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Loss of the integral nuclear envelope protein SUN1 induces alteration of nucleoli2016

    • Author(s)
      A. Matsumoto, C. Sakamoto, H. Matsumori, J. Katahira, Y. Yasuda, K. Yoshidome, M. Tsujimoto, I.G. Goldberg, N. Matsuura, M. Nakao, N. Saitoh, and M. Hieda.
    • Journal Title

      Nucleus

      Volume: 7 Pages: 68-83

    • DOI

      10.1080/19491034.2016.1149664

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Nuclear extrusion precedes discharge of genomic DNA fibers during tunicamycin-induced neutrophil extracellular trap-osis (NETosis)-like cell death in cultured human leukemia cells2016

    • Author(s)
      T. Nakayama, N. Saitoh, K. Morotomi-Yano, KI. Yano, M. Nakao, and H. Saitoh.
    • Journal Title

      Cell Biol. Int.

      Volume: 40 Pages: 597-602

    • DOI

      10.1002/cbin.10594

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] HMGA2 promotes adipogenesis by activating C/EBP beta-mediated expression of PPAR-gamma2016

    • Author(s)
      Y. Xi, W. Shen, L. Ma, M. Zhao, J. Zheng, S. Bu, S. Hino, and M. Nakao.
    • Journal Title

      Biochem. Biophys. Res. Commun.

      Volume: 472 Pages: 617-623

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2016.03.015

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] エピジェネティクスとエネルギー代謝2016

    • Author(s)
      中尾光善、日野信次朗
    • Organizer
      第39回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜、横浜市
    • Year and Date
      2016-12-01 – 2016-12-01
    • Invited
  • [Presentation] エピジェネティクスと現代人の体質学2016

    • Author(s)
      中尾光善
    • Organizer
      第56回リンパ網内系学会総会・第26回日本樹状細胞研究会
    • Place of Presentation
      ホテル日航熊本、熊本市
    • Year and Date
      2016-09-02 – 2016-09-02
    • Invited
  • [Presentation] 代謝メモリー(DOHaD説)を科学する2016

    • Author(s)
      中尾光善
    • Organizer
      第52回日本周産期・新生児医学会学術集会
    • Place of Presentation
      富山国際会議場、富山市
    • Year and Date
      2016-07-17 – 2016-07-17
    • Invited
  • [Presentation] 細胞老化に関わるエピゲノム因子の探索と解析2016

    • Author(s)
      中尾光善
    • Organizer
      第43回日本毒性学会学術年会
    • Place of Presentation
      ウインクあいち、名古屋市
    • Year and Date
      2016-06-30 – 2016-06-30
    • Invited
  • [Presentation] エネルギー代謝とエピジェネティクス2016

    • Author(s)
      中尾光善
    • Organizer
      第59回日本糖尿病学会年次学術集会
    • Place of Presentation
      京都国際会議場、京都市
    • Year and Date
      2016-05-14 – 2016-05-14
    • Invited
  • [Presentation] エピジェネティクス(生命のプログラム)の基礎2016

    • Author(s)
      中尾光善
    • Organizer
      第119回日本小児科学会学術集会
    • Place of Presentation
      ロイトン札幌、札幌市
    • Year and Date
      2016-05-14 – 2016-05-14
    • Invited
  • [Book] 実験医学増刊(遺伝子制御の新たな主役 栄養シグナル)(分担執筆)2016

    • Author(s)
      日野信次朗、阿南浩太郎、高瀬隆太、興梠健作、中尾光善
    • Total Pages
      230
    • Publisher
      羊土社
  • [Book] Bio Clinica(エピゲノムの遺伝)(分担執筆)2016

    • Author(s)
      興梠健作、日野信次朗、中尾光善
    • Total Pages
      114
    • Publisher
      北隆館
  • [Remarks] 熊本大学発生医学研究所

    • URL

      http://www.imeg.kumamoto-u.ac.jp

URL: 

Published: 2018-01-16   Modified: 2022-10-07  

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