2017 Fiscal Year Annual Research Report
Diversity and evolution of anaerobic/microaerophilic eukaryotic microorganisms
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15H05231
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| Research Institution | University of Tsukuba |
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Principal Investigator |
橋本 哲男 筑波大学, 生命環境系, 教授 (50208451)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
石田 健一郎 筑波大学, 生命環境系, 教授 (30282198)
稲垣 祐司 筑波大学, 計算科学研究センター, 教授 (50387958)
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| Project Period (FY) |
2015-04-01 – 2018-03-31
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| Keywords | 嫌気環境 / 真核微生物 / ミトコンドリア関連オルガネラ / 縮退進化 / 代謝多様性 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
嫌気性真核生物の真の多様性を探るために、パラオ共和国の海水湖、マレーシアのPOM池などの嫌気水圏環境の調査を行い、複数の新奇嫌気・微好気性真核微生物の候補を単離し、培養株を樹立した。前年度までに単離・株化した生物を含め、SSUrRNAによる系統解析で既知の真核生物の系統と明確な近縁性を示さないものについて、RNAを抽出し次世代シーケンサーを用いてトランスクリプトームデータを得た。これらをもとに多数の系統マーカー遺伝子からなる連結データを作成しファイロジェノミクス解析を行ったところ、フォルニカータ生物群の系統樹の基部から分岐する新奇生物、ヘテロロボサ生物群の新奇生物、ユーグレノゾア生物群の系統樹の基部から分岐する新奇生物などについて、それらの系統的位置づけを明確にすることができた。さらに、前2者については、典型的なミトコンドリアを失い縮退型のミトコンドリア（Mitochondrion Related Organelles, MROs）をもつに至った生物である可能性が強く示唆されたたため、トランスクリプトームデータをもとに、MROの機能推定を行い、近縁生物種のMROの機能と比較することにより、嫌気・微好気適応に伴うミトコンドリア/MROの縮退進化の一端を明らかにした。
一方、マレーシアおよび日本各地にて採集した陸生節足動物から、消化管に生息する嫌気性真核生物であるグレガリナ様寄生虫を単離し、トランスクリプトーム解析のデータをもとに、複数遺伝子連結分子系統解析を行いグレガリナ類の系統進化に関する知見を得るとともに、色素体様オルガネラで機能していると考えられる遺伝子を同定した。
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| Research Progress Status |
29年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
29年度が最終年度であるため、記入しない。
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Research Products
(15 results)
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[Journal Article] Organelles that illuminate the origins of Trichomonas hydrogenosomes and Giardia mitosomes2017
Author(s)
Leger MM, Kolisko M, Kamikawa R, Stairs CW, Kume K, Cepicka I, Silberman JD, Andersson JO, Xu F, Yabuki A, Eme L, Zhang Q, Takishita K, Inagaki Y, Simpson AGB, Hashimoto T, Roger AJ
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Journal Title
Nature Ecology & Evolution
Volume: 1
Pages: 0092
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
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[Journal Article] A Non-photosynthetic Diatom Reveals Early Steps of Reductive Evolution in Plastids2017
Author(s)
Kamikawa R, Moog D, Zauner S, Tanifuji G, Ishida K, Miyashita H, Mayama S, Hashimoto T, Maier UG, Archibald JM, Inagaki Y
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Journal Title
Molecular Biology and Evolution
Volume: 34
Pages: 2355-2366
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
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