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2017 Fiscal Year Annual Research Report

Development of synthetic biological tools for modulating metabolic fates of cells

Research Project

Project/Area Number 15H05371
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

小松 徹  東京大学, 大学院薬学系研究科(薬学部), 特任助教 (40599172)

Project Period (FY) 2015-04-01 – 2018-03-31
Keywordsケミカルバイオロジー / 酵素 / enzymomics
Outline of Annual Research Achievements

本研究では,代謝過程の担い手である酵素の機能を,機能性の有機小分子とタンパク質の組み合わせを利用して秒~分の単位で制御する合成生物学のツールを開発し,代謝経路の異常によって疾患が引き起こされるまでの代謝ダイナミクスの理解を実現する新たな方法論を確立することを目的として進められてきた.
この目的の下,(1) 酵素の基質に摂動を与える方法,(2) 酵素の機能自体に摂動を与える方法の両面からの方法論の開発をおこなった.(1) については,細胞外基質濃度の変化に対する細胞の応答の様子から生細胞の代謝活性の違いを明らかにするpathway-oriented assay法という概念を確立し,これを用いて癌細胞で亢進の見られる代謝活性を複数見出すことに成功した.本手法の応用は,癌特異的な代謝経路の発見だけにとどまらず,これを高スループットのスクリーニング系へと展開し,癌特異的代謝経路を制御する新たな抗癌剤候補化合物の取得にも成功した.これらの方法論の一部について特許出願をおこない,また,現在得られた主要な成果をまとめて論文投稿準備中となっており,代謝に基づく疾患の理解と制御に広く利用可能な本概念・手法の確立は,少なからぬインパクトを与えるものであると期待される.(2) については,有機小分子を利用したタンパク質の局在変化を可能とする実験系を用いて,様々な物質代謝に関わるタンパク質の細胞内挙動を変化させる実験を開発し,各種摂動が細胞に与える影響について観察をおこなった.これらのうちから,特に癌における物質代謝の変化について,細胞内の代謝反応の局所性の変化が強く関わっていることを示唆する非常に興味深い知見が得られた.今後,この知見を,新学術領域研究「分子夾雑の生命化学」公募研究へと引き継ぎ,癌の代謝異常の本質的な理解を目指す研究へと展開していく.

Research Progress Status

29年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

29年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (23 results)

All 2018 2017

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 6 results) Presentation (17 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 3 results)

  • [Journal Article] Establishment of Molecular Design Strategy To Obtain Activatable Fluorescent Probes for Carboxypeptidases2018

    • Author(s)
      Kuriki Yugo、Kamiya Mako、Kubo Hidemasa、Komatsu Toru、Ueno Tasuku、Tachibana Ryo、Hayashi Kento、Hanaoka Kenjiro、Yamashita Suguru、Ishizawa Takeaki、Kokudo Norihiro、Urano Yasuteru
    • Journal Title

      Journal of the American Chemical Society

      Volume: 140 Pages: 1767~1773

    • DOI

      10.1021/jacs.7b11014

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Development of a Series of Practical Fluorescent Chemical Tools To Measure pH Values in Living Samples2018

    • Author(s)
      Takahashi Shodai、Kagami Yu、Hanaoka Kenjiro、Terai Takuya、Komatsu Toru、Ueno Tasuku、Uchiyama Masanobu、Koyama-Honda Ikuko、Mizushima Noboru、Taguchi Tomohiko、Arai Hiroyuki、Nagano Tetsuo、Urano Yasuteru
    • Journal Title

      Journal of the American Chemical Society

      Volume: 印刷中 Pages: 印刷中

    • DOI

      10.1021/jacs.8b00277

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Fluorescence detection of serum albumin with a turnover-based sensor utilizing Kemp elimination reaction2017

    • Author(s)
      Sakamoto Shingo、Komatsu Toru、Ueno Tasuku、Hanaoka Kenjiro、Urano Yasuteru
    • Journal Title

      Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters

      Volume: 27 Pages: 3464~3467

    • DOI

      10.1016/j.bmcl.2017.05.076

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Development of an Azo-Based Photosensitizer Activated under Mild Hypoxia for Photodynamic Therapy2017

    • Author(s)
      Piao Wen、Hanaoka Kenjiro、Fujisawa Tomotsumi、Takeuchi Satoshi、Komatsu Toru、Ueno Tasuku、Terai Takuya、Tahara Tahei、Nagano Tetsuo、Urano Yasuteru
    • Journal Title

      Journal of the American Chemical Society

      Volume: 139 Pages: 13713~13719

    • DOI

      10.1021/jacs.7b05019

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] An Activatable Photosensitizer Targeted to γ-Glutamyltranspeptidase2017

    • Author(s)
      Chiba Mayumi、Ichikawa Yuki、Kamiya Mako、Komatsu Toru、Ueno Tasuku、Hanaoka Kenjiro、Nagano Tetsuo、Lange Norbert、Urano Yasuteru
    • Journal Title

      Angewandte Chemie International Edition

      Volume: 56 Pages: 10418~10422

    • DOI

      10.1002/anie.201704793

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Potential of Enzymomics Methodologies to Characterize Disease-Related Protein Functions2017

    • Author(s)
      Toru Komatsu
    • Journal Title

      Chemical and Pharmaceutical Bulletin

      Volume: 65 Pages: 605-610

    • DOI

      10.1248/cpb.c17-00144

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Discovery of Disease-related Alternation of Enzymatic Functions with Enzymomics Approach2018

    • Author(s)
      Toru Komatsu, Jun Onagi, Yuki Ichikawa, Yasuteru Urano
    • Organizer
      日本化学会第98年春季大会
    • Invited
  • [Presentation] Pathway-oriented screening法による解糖系酵素阻害剤の探索2018

    • Author(s)
      柳 光一 、小松徹、小島宏建、岡部隆義、長野哲雄、浦野泰照
    • Organizer
      日本薬学会第138年会
  • [Presentation] マイクロデバイスを用いた単一酵素活性検出による病態診断法の開発2018

    • Author(s)
      坂本眞伍、小松徹、渡邉力也、張翼、野地博行、浦野泰照
    • Organizer
      日本薬学会第138年会
  • [Presentation] 有機小分子蛍光プローブを用いた SAM高感度検出系の開発とその応用2018

    • Author(s)
      荻原州介、小松徹、浦野泰照
    • Organizer
      日本薬学会第138年会
  • [Presentation] Development of enzymomics approach to search for disease-related alternation of enzymatic functions2017

    • Author(s)
      Toru Komatsu, Jun Onagi, Yuki Ichihashi, Tetsuo Nagano and Yasuteru Urano
    • Organizer
      International Chemical Biology Society Meeting 2017
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Development of enzymomicsapproach to search for disease-related alternation of enzymatic functions2017

    • Author(s)
      Toru Komatsu, Jun Onagi, Yuki Ichihashi, Tetsuo Nagano and Yasuteru Urano
    • Organizer
      The Second International Symposium on Biofunctional Chemistry (ISBC 2017)
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Pathway-oriented screening法による解糖系酵素阻害剤の探索2017

    • Author(s)
      柳光一、小松徹、小島宏建、岡部隆義、長野哲雄、浦野泰照
    • Organizer
      日本ケミカルバイオロジー学会 第12回年会
  • [Presentation] マイクロデバイスを用いた単一酵素活性検出による病態診断法の開発2017

    • Author(s)
      坂本眞伍、小松徹、渡邉力也、張翼、野地博行、浦野泰照
    • Organizer
      日本ケミカルバイオロジー学会 第12回年会
  • [Presentation] ペプチドライブラリーを用いた酵素活性の網羅的解析法の確立と発展2017

    • Author(s)
      市橋裕樹、小名木淳、小松徹、神谷真子、松崎裕幸、畑啓介、渡邉聡明、浦野泰照
    • Organizer
      日本ケミカルバイオロジー学会 第12回年会
  • [Presentation] 蛍光物質Boron dipyrromethene (BODIPY) 2,6位化学修飾新規蛍光群開発2017

    • Author(s)
      小松徹、Cherythu Nusaiba MADAPPURAM、浦野泰照
    • Organizer
      生体機能関連化学部会若手の会第29回サマースクール
  • [Presentation] 小松徹、小名木淳、市橋裕樹、浦野泰照2017

    • Author(s)
      Diced Electrophoresis Gel (DICE) 法を用いた癌細胞における機能異常酵素の探索
    • Organizer
      日本プロテオーム学会2017年大会
  • [Presentation] ペプチドの「代謝」を視る技術を開発し新たな疾患関連タンパク質の機能を解明する2017

    • Author(s)
      小松徹
    • Organizer
      第49回若手ペプチド夏の勉強会
    • Invited
  • [Presentation] 酵素の動的機能の理解による疾患関連タンパク質の探索2017

    • Author(s)
      小松徹
    • Organizer
      第30回バイオメディカル分析科学シンポジウム(BMAS2017)
    • Invited
  • [Presentation] Pathway-oriented screening法による解糖系酵素阻害剤の探索2017

    • Author(s)
      柳光一、小松徹、小島宏建、岡部隆義、長野哲雄、浦野泰照
    • Organizer
      第11回バイオ関連化学シンポジウム
  • [Presentation] S-adenosyl-L-methionine(SAM)の高感度検出に基づく細胞内メチオニン代謝活性のハイスループット評価系の開発2017

    • Author(s)
      小松徹、荻原洲介、木村勇亮、浦野泰照
    • Organizer
      第35回メディシナルケミストリーシンポジウム
  • [Presentation] ペプチドライブラリーを用いたenzymomicsプラットフォームの構築2017

    • Author(s)
      小松徹、小名木淳、市橋裕樹、浦野泰照
    • Organizer
      第68回日本電気泳動学会総会
  • [Presentation] Pathway-oriented screening法による癌細胞の代謝制御化合物の探索2017

    • Author(s)
      小松徹、柳光一、荻原洲介、小島宏建、岡部隆義、長野哲雄、浦野泰照
    • Organizer
      "ConBio2017(生命科学系合同年次大会) (第40回日本分子生物学会年会、第90回日本生化学大会)"

URL: 

Published: 2018-12-17  

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