2017 Fiscal Year Annual Research Report
Elucidation of an epigenetic hierarchy mediated by CXXC proteins
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15H05602
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| Research Institution | Institute of Physical and Chemical Research |
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Principal Investigator |
伊藤 伸介 国立研究開発法人理化学研究所, 統合生命医科学研究センター, 研究員 (50612115)
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| Project Period (FY) |
2015-04-01 – 2019-03-31
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| Keywords | CpGアイランド / ポリコーム / ユビキチン / 転写抑制 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
CpGアイランドはエピジェネティック修飾のプラットフォームとして寄与し、転写制御の中心であると考えられているが、そのエピジェネティック修飾を忠実に導入するメカニズムは不明な点が多い。本研究課題においてはCpGアイランドを認識して結合するCXXCファミリータンパク質に着目して、エピジェネティック制御が如何に誘導されるか明らかにすることを目的としている。本年度は主にKDM2Bに焦点を当てて解析を行ってきた。
CpGアイランドを認識し、結合する因子であるKDM2Bはポリコーム転写抑制複合体(PRC1)をリクルートする。本年度は、KDM2B-PRC1複合体の再構成を行い、その複合体形成の制御メカニズムを明らかにした。またこの制御メカニズムが細胞内で機能していることをマウスES細胞を用いて、ChIP-seq、RNA-seqのような包括的手法により解明を試みている。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
KDM2B-PRC1複合体の制御メカニズム及び、CpGアイランド上での複合体の挙動の一端を明らかにした。
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| Strategy for Future Research Activity |
KDM2B-PRC1複合体の制御メカニズムに関する新たな知見が得られつつあるため、このモデルを検証するために細胞レベルの解析が必要である。また、生物学的意義を明らかにするためにも、発生段階のKDM2B-PRC1複合体の遷移を実験的に追求する必要があると考えている。
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Research Products
(3 results)
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[Journal Article] A Family of Vertebrate-Specific Polycombs Encoded by the LCOR/LCORL Genes Balance PRC2 Subtype Activities.2018
Author(s)
Conway E, Jerman E, Healy E, Ito S, Holoch D, Oliviero G, Deevy O, Glancy E, Fitzpatrick DJ, Mucha M, Watson A, Rice AM, Chammas P, Huang C, Pratt-Kelly I, Koseki Y, Nakayama M, Ishikura T, Streubel G, Wynne K, Hokamp K, McLysaght A, Ciferri C, Di Croce L, Cagney G, Margueron R, Koseki H, Bracken AP.
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Journal Title
Mol Cell.
Volume: 70
Pages: 408-421
DOI
Peer Reviewed / Int'l Joint Research
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[Journal Article] The SET1 Complex Selects Actively Transcribed Target Genes via Multivalent Interaction with CpG Island Chromatin2017
Author(s)
Brown DA, Di Cerbo V, Feldmann A, Ahn J, Ito S, Blackledge NP, Nakayama M, McClellan M, Dimitrova E, Turberfield AH, Long HK, King HW, Kriaucionis S, Schermelleh L, Kutateladze TG, Koseki H, Klose RJ.
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Journal Title
Cell Rep.
Volume: 20
Pages: 2313-2327
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
