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2017 Fiscal Year Annual Research Report

光合成能喪失藻類をモデルとした従属栄養性への進化を駆動する因子の提唱

Research Project

Project/Area Number 15H05606
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

神川 龍馬  京都大学, 地球環境学堂, 助教 (40627634)

Project Period (FY) 2015-04-01 – 2019-03-31
Keywords光合成 / 進化 / 藻類
Outline of Annual Research Achievements

昨年度までに同定した炭素源トランスポーター遺伝子のうち、従属栄養性珪藻類はもつが光合成性珪藻類はもたない2つの遺伝子をGFP遺伝子と融合させ、モデル光合成性珪藻類細胞内で発現させた。その結果、GFP蛍光はクロロフィル蛍光と重なる部位に観察されたため、今回の実験に用いた炭素源トランスポーターは葉緑体膜に局在している可能性が示唆された。そのため、外部からの炭素源取り込みに寄与していることは示すことができなかった。
従属栄養性珪藻類が利用できる炭素源の探索を昨年度に引き続き行った。コントロールとして用いた光合成性珪藻類の一種はグルコースを利用できないことを確認した。従属栄養性珪藻類の一種もグルコースは利用できないので、この性質は光合成性であった祖先から受け継いだ形質であると考えられる。また、従属栄養性珪藻類は金属イオンのキレート剤として用いられる物質が炭素源およびエネルギー源として利用可能であることが示唆された。この可能性については、引き続き追加確認実験を行う。
あらたに行ったマングローブ林での従属栄養性珪藻類の分布調査に関連して、マングローブ林の光量および光質の解析を行った。その結果、サンプリングを行っているサイト付近のマングローブ林内では、林外部の100分一程度の光量しかなく、また700 nm以上の赤外光がほとんどを占めていた。マングローブ内の従属栄養性珪藻類の分布・増殖と光の関係について、今後研究をしていく必要があることを示唆している。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

炭素源の取り込みに重要な、従属栄養性珪藻類特異的トランスポーターは同定できていないものの、来年度に別の候補遺伝子の詳細な解析を進める予定である。その一方で利用可能な炭素源の同定や生態に関するデータの蓄積は進んでいることから順調に研究が進展していると考えている。

Strategy for Future Research Activity

おおむね順調に進展していることから、研究計画通りに進めていく。

  • Research Products

    (16 results)

All 2018 2017 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Journal Article (6 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results,  Peer Reviewed: 6 results,  Open Access: 3 results) Presentation (8 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 4 results)

  • [Int'l Joint Research] Philipps-Universitat Marburg/LOEWE-Zentrum fur SynMikro(Germany)

    • Country Name
      Germany
    • Counterpart Institution
      Philipps-Universitat Marburg/LOEWE-Zentrum fur SynMikro
  • [Int'l Joint Research] Dalhousie University(Canada)

    • Country Name
      Canada
    • Counterpart Institution
      Dalhousie University
  • [Journal Article] Phylogenomics places orphan protistan lineages in a novel eukaryotic super-group2018

    • Author(s)
      Brown MW, Heis AA, Ryoma Kamikawa, Inagaki Y, Yabuki A, Tice AK, Shiratori T, Ishida K, Hashimoto T, Simpson AGB, Roger AJ
    • Journal Title

      Genome Biology and Evolution

      Volume: 10 Pages: 427-433

    • DOI

      10.1093/gbe/evy014

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] The draft genome of Kipferlia bialata reveals reductive genome evolution in fornicate parasites2018

    • Author(s)
      Tanifuji G, Takabayashi S, Kume K, Takagi M, Nakayama T, Ryoma Kamikawa, Inagaki Y, Hashimoto T
    • Journal Title

      PLoS One

      Volume: 13 Pages: e0194487

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0194487

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] The Origin and Diversification of Mitochondria2017

    • Author(s)
      Roger AJ, Munoz-Gomez SA, Kamikawa R
    • Journal Title

      Current Biology

      Volume: 27 Pages: R1177-R1192

    • DOI

      10.1016/j.cub.2017.09.015

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] A Non-photosynthetic Diatom Reveals Early Steps of Reductive Evolution in Plastids2017

    • Author(s)
      Kamikawa R, Moog D, Zauner S, Tanifuji G, Ishida KI, Miyashita H, Mayama S, Hashimoto T, Maier UG, Archibald JM, Inagaki Y
    • Journal Title

      Molecular Biology and Evolution

      Volume: 34 Pages: 2355-2366

    • DOI

      10.1093/molbev/msx172

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Mitochondrial Genome Evolution and a Novel RNA Editing System in Deep-Branching Heteroloboseids2017

    • Author(s)
      Yang J, Harding T, Kamikawa R, Simpson AGB, Roger AJ
    • Journal Title

      Genome Biology and Evolution

      Volume: 9 Pages: 1161-1174

    • DOI

      10.1093/gbe/evx086

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Growth characterization of non-photosynthetic diatoms, Nitzschia spp., inhabiting estuarine mangrove forests of Ishigaki Island, Japan2017

    • Author(s)
      Ishii K, Ryoma Kamikawa
    • Journal Title

      Plankton and Benthos Research

      Volume: 12 Pages: 164-170

    • DOI

      10.3800/pbr.12.164

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 非光合成性珪藻類葉緑体トリオースリン酸輸送体の基質特異性と紅藻類由来葉緑体の進化2018

    • Author(s)
      神川龍馬、Daniel Moog、野澤彰、戸澤譲
    • Organizer
      日本藻類学会第42回大会
  • [Presentation] “非”光合成性珪藻類:進化・多様性・応用への展望2017

    • Author(s)
      神川龍馬
    • Organizer
      平成29年度 マリンバイオテクノロジー学会「若手の会シンポジウム」
    • Invited
  • [Presentation] 藻類が光合成を捨てるとき2017

    • Author(s)
      神川龍馬
    • Organizer
      第11回ゲノム微生物学会若手の会
    • Invited
  • [Presentation] イントロダクション:現存真核生物の多様性2017

    • Author(s)
      神川龍馬
    • Organizer
      第19回進化学会シンポジウム
    • Invited
  • [Presentation] Reductive evolution of plastids in diatoms after loss of photosynthesis2017

    • Author(s)
      Ryoma Kamikawa
    • Organizer
      International Phycological Conference
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Evolutionary cross talk between the non-photosynthetic plastids and the cytosol of Nitzschia.2017

    • Author(s)
      Ryoma Kamikawa, Daniel Moog, Akira Nozawa, Yuzuru Tozawa
    • Organizer
      The IVth Molecular Life of Diatoms
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Giardiaに近縁な自由生活性鞭毛虫Dysnectes brevisのMRO機能の推測2017

    • Author(s)
      井上貴史、谷藤吾朗、神川龍馬、久米慶太郎、稲垣祐司、橋本哲男
    • Organizer
      第86回日本寄生虫学会
  • [Presentation] ランブル鞭毛虫近縁種における分割イントロン(splintron)の探索:splintronの普遍性と成立過程の解明に向けて2017

    • Author(s)
      杉崎真、神川龍馬、稲垣祐司、橋本哲男、谷藤吾朗
    • Organizer
      第86回日本寄生虫学会大会

URL: 

Published: 2018-12-17  

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