2017 Fiscal Year Annual Research Report
Exploration of subseafloor microbial biosphere through technical developments
| Project/Area Number |
15H05608
|
|---|
| Research Institution | Japan Agency for Marine-Earth Science and Technology |
|---|
Principal Investigator |
諸野 祐樹 国立研究開発法人海洋研究開発機構, 高知コア研究所, グループリーダー代理 (30421845)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2015-04-01 – 2018-03-31
|
| Keywords | 海底下生命圏 / NanoSIMS |
|---|
| Outline of Annual Research Achievements |
本研究では、NanoSIMS (Nano-scale Secondary Ion Mass Spectroscopy) による元素同位体分析や分子生物学的解析等を駆使し、最大で1 億年前に堆積した海底下試料中に存在する未知微生物の姿形を捉えると同時に、それら微生物が「生きているのか？」「機能・役割は？」「代謝活性は？」という基本的かつ重要な問いに答えることを目標とする。多様な海底下環境で採取した試料から申請者が開発した独自の技術によって微生物細胞を分取し、安定同位体基質取り込み、ゲノム解析や元素組成分析等、多面的な解析を行う。
平成29年度は平成27年度以前に行われた国際深海科学掘削計画（IODP)航海において取得し、安定同位体ラベルされた基質を添加して培養を行っている試料のヘッドスペースガスの分析によって基質代謝活性が高まっていると判断された培養バイアルについて、高密度の溶液を用いた密度勾配遠心分離操作、さらに細胞内のDNAを染色してセルソーターによって、細胞と非生物粒子とをほぼ完全に分離した。これらの操作によって調製した試料についてNanoSIMSを用いた一細胞レベルでの基質取り込み活性検出を実施した。また、ソーティングによって堆積物粒子と分離した細胞について、分子生物学的解析も実施した。具体的には、ポリカーボネートメンブレン上にソーティングした微生物細胞から直接16S rRNA遺伝子を増幅し、その解析を実施することで、海底下で生残し、添加した基質を取り込んだ生命に関する知見を得た。
|
| Research Progress Status |
29年度が最終年度であるため、記入しない。
|
| Strategy for Future Research Activity |
29年度が最終年度であるため、記入しない。
|
Research Products
(19 results)
-
-
-
-
[Journal Article] Assessment for capacity to capture aerosol-DNA by clean filters for molecular biology experiments2018
Author(s)
Morono, Y., Hoshino, T., Terada, T., Suzuki, T., Sato, T., Yuasa, H., Kubota, Y., and Inagaki, F.
-
Journal Title
Microbes and Environments
Volume: in press
Pages: in press
-
[Journal Article] Microbial diversity in sediments from the bottom of the Challenger Deep, Mariana Trench2018
Author(s)
Nunoura, T., Nishizawa, M., Hirai, M., Shimamura, S., Harnvoravongchai, P., Koide, O., Morono, Y., Fukui, T., Inagaki, F., Miyazaki, J., Takaki, Y., and Takai, K.
-
Journal Title
Microbes and Environments
Volume: in press
Pages: in press
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
