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2018 Fiscal Year Annual Research Report

Identification of functional compounds and biosynthetic genes by metagenomic methods

Research Project

Project/Area Number 15H05629
Research InstitutionHokkaido University

Principal Investigator

藤田 雅紀  北海道大学, 水産科学研究院, 准教授 (30505251)

Project Period (FY) 2015-04-01 – 2019-03-31
Keywordsメタゲノム / シデロフォア / 赤潮 / アオコ / クオラムセンシング / 海洋天然物
Outline of Annual Research Achievements

シデロフォア 赤潮殺藻細菌由来の新規シデロフォアについて立体化学も含めて構造を決定した。それらは赤潮原因藻類であるC. antiquaに対して顕著な殺藻活性を示した。この活性が鉄キレートによる鉄減少のためでは無い事を確認するために、構造上大きく異なる他のシデロフォア類についても殺藻活性を調べた。その結果、他のシデロフォア類も高濃度においては殺藻あるいは増殖抑制活性を示すが、新規シデロフォアと比較しその活性は弱く、鉄キレート以外の殺藻機構の存在が示唆された。さらに新規シデロフォアは日光照射下において、生物利用困難な三価鉄を二価鉄に還元する機能を持つことから、藻類の増殖と殺藻の両方に寄与するモデルが考えられた。
殺藻物質 五稜郭外堀由来のアオコ殺藻細菌を16S rRNA配列からPseudomonas protegensと同定した。また、生産する殺藻物質をピオテルリンと同定し、合わせて新規の類縁化合物も見出した。P. protegensは生物農薬として既に農業分野で実用化されており、湖沼におけるアオコ対策への応用も期待される。
クオラムセンシング物質 オートインデューサー(AI)様物質がメタゲノム由来の単一の酸化酵素により生産されることを見出していたが、生合成的考察から宿主である大腸菌由来の酵素の関与も推測された。そこでAI様物質の前駆物質を非組み換え大腸菌の培地に投与したところ、活性物質の生産が認められたことから、メタゲノム由来酵素と大腸菌の内在酵素の二つの関与が示された。
海綿由来生理活性物質 ミカーレ属海綿由来抗腫瘍物質の生産菌の共生機構の解明のために、その検出方法の確立を試みた。16S rRNA中の特異的な配列、および抗腫瘍物質の生合成遺伝子配列を指標にDNAプローブを作成し、共生細菌群衆懸濁液にたいしてCARD-FISHを行ったところ、特異的に染色される桿菌を見出した。

Research Progress Status

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (11 results)

All 2019 2018 2017 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (4 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 1 results) Presentation (4 results) Book (1 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Int'l Joint Research] ITQB-NOVA(ポルトガル)

    • Country Name
      PORTUGAL
    • Counterpart Institution
      ITQB-NOVA
  • [Journal Article] Structure and reactivity of a siderophore-interacting protein from the marine bacterium Shewanella reveals unanticipated functional versatility2018

    • Author(s)
      Inês Trindade, José M. Silva, Bruno M. Fonseca2, Teresa Catarino3, Masaki Fujita, Pedro M. Matias, Elin Moe and Ricardo O. Louro
    • Journal Title

      J. Biol. Chem

      Volume: 294 Pages: 157-167

    • DOI

      10.1074/jbc.RA118.005041

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Cloning of the Bisucaberin B Biosynthetic Gene Cluster from the Marine Bacterium Tenacibaculum mesophilum, and Heterologous Production of Bisucaberin B2018

    • Author(s)
      Masaki J. Fujita, Yusuke Goto and Ryuichi Sakai
    • Journal Title

      Mar. Drugs

      Volume: 16 Pages: 342-353

    • DOI

      10.3390/md16090342

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Elemental composition and ultrafine structure of the skeleton in shell-bearing protists-A case study of phaeodarians and radiolarians2018

    • Author(s)
      Nakamura, Yasuhide; Iwata, Izumi; Hori, Rie S.; Uchiyama, Naomi; Tuji, Akihiro; Fujita, Masaki J.; Honda, Daiske; Ohfuji, Hiroaki
    • Journal Title

      J. Struct. Biol

      Volume: 204 Pages: 45-51

    • DOI

      10.1016/j.jsb.2018.06.008

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] KB343, a Cyclic Tris-guanidine Alkaloid from Palauan Zoantharian Epizoanthus illoricatus2018

    • Author(s)
      Ken Matsumura, Tohru Taniguchi, James D. Reimer, Shuntaro Noguchi, Masaki J. Fujita, and Ryuichi Sakai
    • Journal Title

      Org. Lett.

      Volume: 20 Pages: 3039-3043

    • DOI

      10.1021/acs.orglett.8b01069

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Mycale Sponge Inherits Mycalolide Producers Through2019

    • Author(s)
      藤田雅紀
    • Organizer
      第4回 部局横断シンポジウム
  • [Presentation] Alteromonas 属殺藻細菌由来シデロフォアの同定と機能解析2019

    • Author(s)
      神手大輝、酒井隆一、藤田雅紀
    • Organizer
      平成31年度日本水産学会春季大会
  • [Presentation] 環境にやさしい赤潮対策~細菌による赤潮防除~2018

    • Author(s)
      神田衛、藤田雅紀
    • Organizer
      HAKODATEアカデミックリンク2018
  • [Presentation] 五稜郭の細菌でアオコを防ぐ!2018

    • Author(s)
      加藤健、藤田雅紀
    • Organizer
      HAKODATEアカデミックリンク2018
  • [Book] 海をまるごとサイエンス2018

    • Author(s)
      藤田雅紀 分担
    • Total Pages
      128
    • Publisher
      KAIBUNDO
    • ISBN
      978-4-303-80001-7
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 新規インドロキナゾリン型化合物およびその製造方法2017

    • Inventor(s)
      木村信忠、藤田雅紀
    • Industrial Property Rights Holder
      木村信忠、藤田雅紀
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      PCT/JP2017/043634

URL: 

Published: 2023-12-25  

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