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2015 Fiscal Year Annual Research Report

人工RNPナノシステムを活用した細胞プログラミング技術の創出

Research Project

Project/Area Number 15H05722
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

齊藤 博英  京都大学, iPS細胞研究所, 教授 (20423014)

Project Period (FY) 2015-05-29 – 2020-03-31
KeywordsRNA / RNP / 合成生物学 / ナノテクノロジー / マイクロRNA / iPS細胞 / 分化 / 再生医療
Outline of Annual Research Achievements

本年度は、RNAスイッチシステムによる標的哺乳類細胞の選別、運命制御技術の確立を基軸にすえ研究を進めた結果、以下の研究成果を得た。
A. 人工RNA回路による精密な細胞運命制御
我々は、合成RNAを細胞に導入することで機能するさまざまな人工回路を哺乳類細胞内で構築した。RNAとRNA結合タンパク質から構成される人工回路の作製に取り組んだ結果、細胞内部状態を検出できる回路、多段階のシグナル伝達回路、細胞内の状態を保持するスイッチ回路などの開発に成功した。さらにモデル実験として、人工RNA回路を細胞集団に導入することで、標的細胞のみ細胞死を誘導することに成功した。今後、細胞内の状態に応じて、安全かつ精密にその運命決定を制御できる人工回路の構築が期待される。
B. マイクロRNAスイッチによる標的生細胞の選別・自動除去システムの開発
我々は、合成mRNAをiPS細胞に導入することにより、 iPS細胞に特異的に発現するマイクロRNA (miRNA) の活性を検知してiPS細胞を精密に見分け、部分的に分化したiPS細胞をも識別・除去できる方法 (miRNA-302スイッチ) を開発した。この合成mRNAを細胞に導入することで、iPS細胞とそれ以外の細胞が混在した細胞集団からiPS細胞を選択的に識別・分離でき、生体内での奇形腫の形成を抑制できた。また、分化した神経細胞に混在するiPS細胞を機械を用いることなく自動除去することに成功した。さらに、わずかなmiRNA活性の差(2倍弱程度)に基づき、異なる種類の生細胞を精密に分離する方法の開発にも成功した。上記成果は、細胞内部の状態を「人工RNAで精密に識別」することで、これまでの技術では困難であった、細胞内状態に応じた安全かつ精密な運命制御技術へと発展できる。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

当初目的に掲げた課題の一つである、「標的哺乳類細胞の選別・運命制御法の開発」に成功した。ここでは独自に開発したマイクロRNAスイッチ技術を活用することで、iPS細胞を含む様々な哺乳類細胞を自由に選別、できることが明らかとなった。また、人工RNA回路を活用することで、細胞内状態に応じて細胞死を誘導することに成功し、本目的をほぼ達成したため、研究は順調に進展していると考える。

Strategy for Future Research Activity

本研究目的に掲げた、RNAスイッチや人工回路の機能拡張、及び細胞内で機能する人工RNPナノ構造体の構築を目標に研究を推進する。人工RNAを細胞内に直接導入する技術を活用することにより、標的細胞内でナノサイズ人工RNAスイッチやRNP構造体(RNA scaffold)を構築し、細胞内で発現する特定のタンパク質をRNA 構造体に精密に集積・活性化させることで、シグナル伝達を特異的に制御する技術を開発する。

  • Research Products

    (21 results)

All 2016 2015

All Journal Article (5 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 5 results,  Open Access: 2 results,  Acknowledgement Compliant: 3 results) Presentation (12 results) (of which Int'l Joint Research: 5 results,  Invited: 12 results) Patent(Industrial Property Rights) (4 results)

  • [Journal Article] High-resolution Identification and Separation of Living Cell Types by Multiple microRNA-responsive Synthetic mRNAs.2016

    • Author(s)
      Endo, Kei and Hayashi, Karin and Saito, Hirohide
    • Journal Title

      Scientific reports

      Volume: 6 Pages: 21991

    • DOI

      10.1038/srep21991

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] RNA and RNP as Building Blocks for Nanotechnology and Synthetic Biology.2016

    • Author(s)
      Ohno, Hirohisa and Saito, Hirohide
    • Journal Title

      Prog. Mol. Biol. Transl. Sci.

      Volume: 139 Pages: 165-185

    • DOI

      10.1016/bs.pmbts.2015.12.004

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] MicroRNA-302 switch to identify and eliminate undi erentiated human pluripotent stem cells2016

    • Author(s)
      Callum J. C. Parr1,*, Shota Katayama1,*, Kenji Miki1, Yi Kuang1, Yoshinori Yoshida1, Asuka Morizane2, Jun Takahashi2, Shinya Yamanaka1,3 & Hirohide Saito1
    • Journal Title

      Scientific reports

      Volume: 6 Pages: 32532

    • DOI

      10.1038/srep32532

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Droplet-Shooting and Size-Filtration (DSSF) Method for Synthesis of Cell-Sized Liposomes with Controlled Lipid Compositions.2015

    • Author(s)
      Morita M, Onoe H, Yanagisawa M, Ito H, Ichikawa M, Fujiwara K, Saito H, Takinoue M
    • Journal Title

      Chembiochem : a European journal of chemical biology

      Volume: 16(14) Pages: 2029-2035

    • DOI

      10.1002/cbic.201500354

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Mammalian synthetic circuits with RNA binding proteins for RNA-only delivery.2015

    • Author(s)
      Wroblewska L, Kitada T, Endo K, Siciliano V, Stillo B, Saito H, Weiss R
    • Journal Title

      Nature biotechnology

      Volume: 33(8) Pages: 839-841

    • DOI

      10.1038/nbt.3301

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] MicroRNA SWITCHES THAT IDENTIFY AND ISOLATE TARGET CELLS IN HIGH-RESOLUTION2016

    • Author(s)
      Hirohide Saito
    • Organizer
      ISSCR
    • Place of Presentation
      Moscone West 800 Howard St. San Francisco, CA 94103 USA
    • Year and Date
      2016-06-22 – 2016-06-25
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Synthetic RNA switches & nanostructures: programming mammalian cell fate2016

    • Author(s)
      Hirohide Saito
    • Organizer
      special bioengineering seminar in Caltech
    • Place of Presentation
      カリフォルニア工科大学
    • Year and Date
      2016-06-19 – 2016-06-20
    • Invited
  • [Presentation] Synthetic RNA Switches and Circuits to Program Target Cell Populations2016

    • Author(s)
      Hirohide Saito
    • Organizer
      mSBW3.0
    • Place of Presentation
      マサチューセッツ工科大学(MIT)Cambridge,MA,
    • Year and Date
      2016-05-21 – 2016-05-22
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Development of Molecular Sensor and Device for Intelligent Molecular Robots2016

    • Author(s)
      Hirohide Saito
    • Organizer
      IEEE-NEMS2016
    • Place of Presentation
      Matsushima, Sendai, Miyagi Prefecture
    • Year and Date
      2016-04-17 – 2016-04-20
    • Invited
  • [Presentation] Synthetic RNA Switches and Circuits to Detect and Purify Target Live Cells2016

    • Author(s)
      Hirohide Saito
    • Organizer
      UC San Diego Kyoto University joint Sympojium
    • Place of Presentation
      University of Califonia ,San Diego(USA・SanDiego)
    • Year and Date
      2016-03-14 – 2016-03-16
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 「RNAスイッチによる標的細胞の選別と運命制御2016

    • Author(s)
      齊藤博英
    • Organizer
      福井大学テニュアトラックシンポジウム
    • Place of Presentation
      福井大学文京キャンパス(福井大学・福井市)
    • Year and Date
      2016-02-22
    • Invited
  • [Presentation] 哺乳類合成生物学と分子ロボティクスの未来2016

    • Author(s)
      齊藤博英
    • Organizer
      nano tech 2016 特別シンポジウム”Nanotech Agenda 2020"
    • Place of Presentation
      東京ビックサイト(東京都・江東区)
    • Year and Date
      2016-01-26
    • Invited
  • [Presentation] Synthetic RNA Switches and Nanostructures ti Detect,Purify,and Control Target Mammalian Calls2016

    • Author(s)
      Hirohide Saito
    • Organizer
      SBE's 6th International Conference on Biomolecular Engineerin
    • Place of Presentation
      Grand Hyatt Singapore(Singapore)
    • Year and Date
      2016-01-04 – 2016-01-08
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 人工RNAナノシムテムを基盤とする細胞プログラムミング2015

    • Author(s)
      齊藤博英
    • Organizer
      RNAフロンティアミーティング
    • Place of Presentation
      タカミヤヴィレッジホテル樹林(山形県・山形市)
    • Year and Date
      2015-12-08 – 2015-12-10
    • Invited
  • [Presentation] 分子ロボティクスの感覚と触覚について2015

    • Author(s)
      齊藤博英
    • Organizer
      感性センシング応用ロードマップ技術分科会(一般社団法人電子情報技術産業協会)
    • Place of Presentation
      大手センタービル(東京都・千代田区)
    • Year and Date
      2015-12-04
    • Invited
  • [Presentation] マイクロRNAスイッチ技術の紹介とその応用2015

    • Author(s)
      齊藤博英
    • Organizer
      講演会「マイクロRNAスイッチ技術の紹介とその応用」
    • Place of Presentation
      武田薬品工業株式会社湘南研究所(神奈川県)
    • Year and Date
      2015-10-26
    • Invited
  • [Presentation] Synthetic RNA technologies to detect, purify, and control live cell populations2015

    • Author(s)
      齊藤博英
    • Organizer
      Paris Symposium on Integrated Cell-Material Sciences
    • Place of Presentation
      Institut Pierre-Gilles de Gennes pour la Microfluidique(Paris,France)
    • Year and Date
      2015-10-12 – 2015-10-13
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 細胞特異的にヌクレアーゼを制御する方法2016

    • Inventor(s)
      齊藤博英/弘澤萌
    • Industrial Property Rights Holder
      齊藤博英/弘澤萌
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      特願2016-126944
    • Filing Date
      2016-06-27
  • [Patent(Industrial Property Rights)] RNA構造ライブラリ2016

    • Inventor(s)
      齊藤博英/小松リチャード馨
    • Industrial Property Rights Holder
      齊藤博英/小松リチャード馨
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      特願2016-127002
    • Filing Date
      2016-06-27
  • [Patent(Industrial Property Rights)] miRNAの発現に応答して蛋白質遺伝子を発現させる方法2016

    • Inventor(s)
      齊藤博英/藤田祥彦
    • Industrial Property Rights Holder
      齊藤博英/藤田祥彦
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      特願2016-126982
    • Filing Date
      2016-06-27
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 細胞分離を行うためのmiRNAの選択方法2015

    • Inventor(s)
      齊藤博英/遠藤慧
    • Industrial Property Rights Holder
      齊藤博英/遠藤慧
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      特願2015-212176
    • Filing Date
      2015-10-28

URL: 

Published: 2018-01-16  

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