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2015 Fiscal Year Annual Research Report

X線レーザー回折による生細胞ダイナミクス

Research Project

Project/Area Number 15H05737
Research InstitutionHokkaido University

Principal Investigator

西野 吉則  北海道大学, 電子科学研究所, 教授 (40392063)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 木村 隆志  北海道大学, 電子科学研究所, 助教 (50531472)
大島 泰郎  東京薬科大学, 生命科学部, 名誉教授 (60167301)
Project Period (FY) 2015-05-29 – 2020-03-31
KeywordsX線自由電子レーザー / 可視化 / 細菌 / 超精密計測
Outline of Annual Research Achievements

本研究課題では、X線自由電子レーザー(XFEL)のフェムト秒オーダーのパルス幅を利用して、異なる状態の細胞を、独自開発したパルス状コヒーレントX線溶液散乱(PCXSS)法により放射線損傷なくイメージングすることにより、生細胞のナノレベルダイナミクスを観察することを目指している。異なる状態の細胞の調製方法として、同調培養による細胞周期の同期、温度制御、ケージド化合物を用いたフラッシュ・フォトリシスなど異なる手法の検討を進めた。
同調培養に関しては、PCXSS測定に適するMicrobacterium菌の細胞周期を検討し、同調培養の条件を定めた。さらに、調製したMicrobacterium菌に対してXFEL施設SACLAを用いたPCXSS測定を行い、細胞の画像をナノレベルで得ることに成功した。温度制御に関しては、装置の仕様を検討・策定し開発を行った。ケージド化合物を用いたフラッシュ・フォトリシスに関しては、ケージドプロトンによるpHの制御やMicrobacterium菌への適用などのスタディーに着手した。
また、細胞のダイナミクスをXFELとは相補的に観察することを目的として、高速原子間力顕微鏡および蛍光顕微鏡のカメラシステムを導入した。さらに、PCXSS測定技術や試料像再構成(位相回復)技術を高度化する技術開発などを進めた。
SACLAを用いたPCXSS測定に関して、ドラッグデリバリーにおける薬剤のキャリアなどへの応用に向けて開発された金ナノ粒子集合体や自動車排ガス浄化用触媒材料の溶液中の構造をナノレベルでイメージングすることに成功し、論文発表を行った。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

細胞の状態を同期させる方法として取り組んだ、同調培養、温度制御、フラッシュ・フォトリシスのいずれにおいても、当初の計画通りに技術開発が進行した。また、PCXSS測定技術、試料像再構成(位相回復)技術、高速原子間力顕微鏡、蛍光顕微鏡などに関しても、新たな技術開発や装置の導入が予定通りに進行した。さらに、SACLAを用いたPCXSS測定も順調に進み、論文発表や学会発表等を行うことができた。

Strategy for Future Research Activity

本研究課題では、いくつかのアプローチにより細胞の状態を同期させ、異なる状態の細胞を、X線自由電子レーザー(XFEL)を用いたパルス状コヒーレントX線溶液散乱(PCXSS)法でイメージングすることにより、生きた細胞のナノレベルダイナミクスの観察を目指す。
同調培養に関しては、今後、細胞分裂周期の特定の段階にある細胞を調製する手法を開発し、SACLAにおいて細胞分裂周期の各段階でのイメージングを目指す。温度制御に関しては、平成27年度に開発を行った装置を用いてPCXSS測定を進める。フラッシュ・フォトリシスでは、PCXSS測定において細胞を封入するマイクロ液体封入アレイ(MLEA)チップ内で、ケージド化合物により細胞環境を制御する技術開発を行い、その後のPCXSS測定に繋げる。
さらに、MLEAチップやPCXSS測定技術や試料像再構成(位相回復)技術を高度化する研究を進める。細胞試料に関しては、既知の好熱菌などの加工・調製を行うほか、測定により適した新規微生物の探索を行う。

  • Research Products

    (42 results)

All 2016 2015 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (8 results) (of which Int'l Joint Research: 6 results,  Peer Reviewed: 4 results,  Acknowledgement Compliant: 5 results,  Open Access: 2 results) Presentation (32 results) (of which Int'l Joint Research: 9 results,  Invited: 17 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] Academia Sinica(台湾)

    • Country Name
      その他の国・地域
    • Counterpart Institution
      Academia Sinica
  • [Journal Article] Yolk/Shell Assembly of Gold Nanoparticles by Size Segregation in Solution2016

    • Author(s)
      Jinjian Wei, Kenichi Niikura, Takeshi Higuchi, Takashi Kimura, Hideyuki Mitomo, Hiroshi Jinnai, Yasumasa Joti, Yoshitaka Bessho, Yoshinori Nishino, Yasutaka Matsuo, and Kuniharu Ijiro
    • Journal Title

      Journal of the American Chemical Society

      Volume: 138 Pages: 3274-3277

    • DOI

      10.1021/jacs.5b12456

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Extending the potential of x-ray free-electron lasers to industrial applications - an initiatory attempt at coherent diffractive imaging on car-related nanomaterials2015

    • Author(s)
      Rikiya Yoshida, Hisao Yamashige, Masahide Miura, Takashi Kimura, Yasumasa Joti, Yoshitaka Bessho, Mayumi Kuramoto, Jian Yu, Krishna Khakurel, Kensuke Tono, Makina Yabashi, Tetsuya Ishikawa, and Yoshinori Nishino
    • Journal Title

      Journal of Physics B: Atomic, Molecular and Optical Physics

      Volume: 48 Pages: 244008

    • DOI

      10.1088/0953-4075/48/24/244008

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Coherent diffraction imaging of non-isolated object with apodized illumination2015

    • Author(s)
      Krishna P. Khakurel, Takashi Kimura, Yasumasa Joti, Satoshi Matsuyama, Kazuto Yamauchi, and Yoshinori Nishino
    • Journal Title

      Optics Express

      Volume: 23 Pages: 28182-28190

    • DOI

      10.1364/OE.23.028182

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Imaging live cells by X-ray laser diffraction2015

    • Author(s)
      Y. Nishino, T. Kimura, Y. Joti, and Y. Bessho
    • Journal Title

      SPring-8 Research Frontiers 2014

      Volume: - Pages: 126-127

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] X線レーザー回折による生きた細胞のナノイメージング2015

    • Author(s)
      西野吉則、木村隆志、城地保昌、別所義隆
    • Journal Title

      オプトロニクス

      Volume: 35 Pages: 48-52

    • Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] X 線自由電子レーザーを用いた生きた細胞のナノイメージング ─フェムト秒の発光時間のX線で生きた細胞の一瞬の姿を映し出す2015

    • Author(s)
      西野吉則
    • Journal Title

      化学と工業

      Volume: 68 Pages: 1018-1020

  • [Journal Article] X線自由電子レーザーを用いた生きた細胞のナノイメージング2015

    • Author(s)
      西野吉則、木村隆志、城地保昌、別所義隆
    • Journal Title

      SPring-8/SACLA利用者情報

      Volume: 20 Pages: 237-240

    • Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] パルス状コヒーレントX線溶液散乱法のための溶液試料ホルダの開発2015

    • Author(s)
      木村隆志、城地保昌、別所義隆、西野吉則、松尾保孝
    • Journal Title

      NanotechJapan Bulletin

      Volume: 8(3) Pages: -

    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] X線顕微鏡2016

    • Author(s)
      西野吉則
    • Organizer
      大阪大学ナノサイエンス・ナノテクノロジー高度学際教育研究プログラム
    • Place of Presentation
      大阪大学中之島センター(大阪府大阪市)
    • Year and Date
      2016-11-04 – 2016-11-04
    • Invited
  • [Presentation] コヒーレントX線イメージング2016

    • Author(s)
      西野吉則
    • Organizer
      平成27年度ソフトマター中性子散乱研究会
    • Place of Presentation
      エッサム神田ホール(東京都千代田区)
    • Year and Date
      2016-03-22 – 2016-03-22
    • Invited
  • [Presentation] X線自由電子レーザーを用いた生きた細胞のナノイメージング2016

    • Author(s)
      西野吉則
    • Organizer
      ISSPワークショップ 「SPring-8 BL07LSUの現状 -X線分光と回折の協奏へ-」
    • Place of Presentation
      東京大学物性研究所(千葉県柏市)
    • Year and Date
      2016-03-01 – 2016-03-01
    • Invited
  • [Presentation] Frontiers in high-contrast nano-imaging opened up by coherent X-rays2016

    • Author(s)
      Yoshinori Nishino
    • Organizer
      International Forum on Detectors for Photon Science (IFDEPS)
    • Place of Presentation
      Fuji View Hotel (Fujikawaguchiko-machi, Minamitsuru-gun, Yamanashi)
    • Year and Date
      2016-02-28 – 2016-03-02
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] X線自由電子レーザーを用いた生きた細胞のナノイメージング2016

    • Author(s)
      西野吉則
    • Organizer
      日本顕微鏡学会第40回関東支部講演会「顕微鏡が切り拓く最先端科学 ―Leading edge of science advanced by microscopy」
    • Place of Presentation
      帝京大学板橋キャンパス(東京都板橋区)
    • Year and Date
      2016-02-27 – 2016-02-27
    • Invited
  • [Presentation] エックス線レーザーで観た、生きた細胞2016

    • Author(s)
      西野吉則
    • Organizer
      「国民との科学・技術対話推進事業」藤女子中学校・高等学校出張講義
    • Place of Presentation
      藤女子中学校・高等学校(北海道札幌市)
    • Year and Date
      2016-02-16 – 2016-02-16
    • Invited
  • [Presentation] High-contrast nano-imaging of unstained biological samples opened up by coherent X-rays2016

    • Author(s)
      Yoshinori Nishino
    • Organizer
      The 1st international seminar on synchrotron X-ray bioimaging
    • Place of Presentation
      Hokkaido Univiersity (Sapporo, Hokkaido)
    • Year and Date
      2016-01-27 – 2016-01-27
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 東京大学柏の葉キャンパス駅前サテライト2016

    • Author(s)
      X線自由電子レーザーによる溶液中試料ダイナミクス計測の試み
    • Organizer
      第29回日本放射光学会年会・放射光科学合同シンポジウム
    • Place of Presentation
      東京大学柏の葉キャンパス駅前サテライト(千葉県柏市)
    • Year and Date
      2016-01-09 – 2016-01-11
  • [Presentation] 生物試料イメージング実験における測定効率の向上2016

    • Author(s)
      後藤遼平、木村隆志、城地保昌、大島泰郎、別所義隆、西野吉則
    • Organizer
      第29回日本放射光学会年会・放射光科学合同シンポジウム
    • Place of Presentation
      東京大学柏の葉キャンパス駅前サテライト(千葉県柏市)
    • Year and Date
      2016-01-09 – 2016-01-11
  • [Presentation] X線レーザー回折イメージングによる溶液中試料の反応解析に向けたサンプルホルダーの改良2016

    • Author(s)
      丸岡篤史、木村隆志、城地保昌、別所義隆、西野吉則
    • Organizer
      第29回日本放射光学会年会・放射光科学合同シンポジウム
    • Place of Presentation
      東京大学柏の葉キャンパス駅前サテライト(千葉県柏市)
    • Year and Date
      2016-01-09 – 2016-01-11
  • [Presentation] X線レーザーで観た、生きた細胞2016

    • Author(s)
      西野吉則
    • Organizer
      第53回北海道高等学校教育研究会(高教研)理科部会物理分科会
    • Place of Presentation
      札幌市立札幌大通高校(北海道札幌市)
    • Year and Date
      2016-01-08 – 2016-01-08
    • Invited
  • [Presentation] コヒーレントX線が照らすナノ世界2015

    • Author(s)
      西野吉則
    • Organizer
      CREST「先端光源を駆使した光科学・光技術の融合展開」領域公開研究報告会
    • Place of Presentation
      JST東京本部別館(東京都千代田区)
    • Year and Date
      2015-12-19 – 2015-12-19
  • [Presentation] Live cell nano-imaging free from radiation damage by using X-ray free-electron laser2015

    • Author(s)
      Yoshinori Nishino, Takashi Kimura, Yasumasa Joti, Tairo Oshima, and Yoshitaka Bessho
    • Organizer
      The 13th Conference of the Asian Crystallographic Association (AsCA 2015)
    • Place of Presentation
      Kolkata (India)
    • Year and Date
      2015-12-05 – 2015-12-08
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Live cell nano-imaging free from radiation damage by using X-ray free-electron laser2015

    • Author(s)
      西野吉則、木村隆志、城地保昌、大島泰郎、別所義隆
    • Organizer
      第38回分子生物学会年会・第88回生化学会大会合同大会(BMB2015)
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド(兵庫県神戸市)
    • Year and Date
      2015-12-01 – 2015-12-04
    • Invited
  • [Presentation] Live cell nano-imaging free from radiation damage by using X-ray free-electron laser2015

    • Author(s)
      Yoshinori Nishino, Takashi Kimura, Yasumasa Joti, and Yoshitaka Bessho
    • Organizer
      The 9th Asia Oceania Forum for Synchrotron Radiation Research (AOFSRR 2015)
    • Place of Presentation
      Melbourne (Australia)
    • Year and Date
      2015-11-25 – 2015-11-27
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] X 線自由電子レーザーを用いた環境制御ナノイメージング2015

    • Author(s)
      西野吉則、木村隆志、城地保昌、大島泰郎、別所義隆
    • Organizer
      第13回X 線結像光学シンポジウム
    • Place of Presentation
      名古屋大学(愛知県名古屋市)
    • Year and Date
      2015-11-17 – 2015-11-18
    • Invited
  • [Presentation] X 線自由電子レーザーを用いた生きた細胞のナノイメージング2015

    • Author(s)
      西野吉則
    • Organizer
      平成27年度第1回生物構造学研究会
    • Place of Presentation
      エッサム神田ホール(東京都千代田区)
    • Year and Date
      2015-11-17 – 2015-11-17
    • Invited
  • [Presentation] 液中試料ダイナミクスのコヒーレント回折イメージングによる計測の試み2015

    • Author(s)
      木村隆志、城地保昌、別所義隆、西野吉則
    • Organizer
      附置研究所間アライアンス第三回若手研究交流会
    • Place of Presentation
      九州大学 筑紫地区キャンパス(福岡県春日市)
    • Year and Date
      2015-11-16 – 2015-11-17
  • [Presentation] コヒーレント回折イメージングによる液中試料の動的構造計測に向けた取り組み2015

    • Author(s)
      木村隆志
    • Organizer
      ナノマクロ物質・デバイス・システム創製アライアンス 医療材料・デバイス・システムグループG3 分科会
    • Place of Presentation
      大阪大学中之島センター(大阪府大阪市)
    • Year and Date
      2015-11-12 – 2015-11-13
  • [Presentation] Nano Imaging Under Controlled Environment Using X-ray Free-Electron Lasers2015

    • Author(s)
      西野吉則
    • Organizer
      ナノマクロ物質・デバイス・システム創製アライアンス 医療材料・デバイス・システムグループG3 分科会
    • Place of Presentation
      大阪大学中之島センター(大阪府大阪市)
    • Year and Date
      2015-11-12 – 2015-11-13
  • [Presentation] Damage Free Imaging of Samples in Solution by X-ray Free-Electron Laser Diffraction2015

    • Author(s)
      Takashi Kimura, Yasumasa Joti, Yasutaka Bessho , and Yoshinori Nishino
    • Organizer
      The 16th Ries-Hokudai International Symposium
    • Place of Presentation
      Chateraise Gateaux Kingdom Sapporo (Sapporo, Hokkaido)
    • Year and Date
      2015-11-10 – 2015-11-11
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Numerical simulation of XFEL diffraction patterns of biological macromolecules in solution for PCXSS2015

    • Author(s)
      Jian Yu, Yasumasa Joti, Takashi Kimura, Yasutaka Bessho , and Yoshinori Nishino
    • Organizer
      The 16th Ries-Hokudai International Symposium
    • Place of Presentation
      Chateraise Gateaux Kingdom Sapporo (Sapporo, Hokkaido)
    • Year and Date
      2015-11-10 – 2015-11-11
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] X-ray Laser Diffraction In-Solution Imaging Using Environmental Cell Array Chips with Graphene Windows2015

    • Author(s)
      Yuki Takabatake, Takashi Kimura, Kenji Yamazaki, Yosuke Maehara, Jinjian Wei, Kenichi Niikura, Kuniharu Ijiro, Yasumasa Joti, Yositaka Bessho, Kazutoshi Gohara, and Yoshinori Nishino
    • Organizer
      The 16th Ries-Hokudai International Symposium
    • Place of Presentation
      Chateraise Gateaux Kingdom Sapporo (Sapporo, Hokkaido)
    • Year and Date
      2015-11-10 – 2015-11-11
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Nano-patterning of organic samples for signal enhancement Using in X-ray laser diffraction imaging2015

    • Author(s)
      Tomoya Sasaki, Kohei Yamamoto, Takashi Kimura, Takayuki Uchihashi, Toshio Ando, Yasumasa Joti, Yoshitaka Bessho, and Yoshinori Nishino
    • Organizer
      The 16th Ries-Hokudai International Symposium
    • Place of Presentation
      Chateraise Gateaux Kingdom Sapporo (Sapporo, Hokkaido)
    • Year and Date
      2015-11-10 – 2015-11-11
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] X 線自由電子レーザーを用いた生きた細胞のナノイメージング2015

    • Author(s)
      西野吉則、木村隆志、城地保昌、大島泰郎、別所義隆
    • Organizer
      第110回日本医学物理学会学術大会
    • Place of Presentation
      北海道大学(北海道札幌市)
    • Year and Date
      2015-09-18 – 2015-09-20
    • Invited
  • [Presentation] X線自由電子レーザーを用いた環境を制御したナノイメージング2015

    • Author(s)
      西野吉則、木村隆志、魏金建、飯田良、新倉謙一、三友秀之、居城邦治、城地保昌、別所義隆
    • Organizer
      第64回高分子討論会
    • Place of Presentation
      東北大学川内キャンパス(宮城県仙台市)
    • Year and Date
      2015-09-15 – 2015-09-17
    • Invited
  • [Presentation] Imaging live cells by X-ray laser diffraction2015

    • Author(s)
      西野吉則、木村隆志、城地保昌、別所義隆
    • Organizer
      日本生物物理学会
    • Place of Presentation
      金沢大学角間キャンパス(石川県金沢市)
    • Year and Date
      2015-09-13 – 2015-09-15
    • Invited
  • [Presentation] Polyamines in thermophiles: Functions and metabolisms2015

    • Author(s)
      Tairo Oshima
    • Organizer
      The 13th International Meeting on Thermophiles (thermophiles 2015)
    • Place of Presentation
      Ssntiago (Chile)
    • Year and Date
      2015-08-30 – 2015-09-04
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] X線自由電子レーザーを用いた生きた細胞のナノイメージング2015

    • Author(s)
      西野吉則
    • Organizer
      2015年度第1回バイオ単分子研究会
    • Place of Presentation
      (公財)新世代研究所(東京都千代田区)
    • Year and Date
      2015-08-26 – 2015-08-26
  • [Presentation] X線レーザーで観た、生きた細胞2015

    • Author(s)
      西野吉則
    • Organizer
      「北海道札幌西高等学校スーパーサイエンスハイスクール事業」出張講義
    • Place of Presentation
      北海道札幌西高等学校(北海道札幌市)
    • Year and Date
      2015-07-24 – 2015-07-24
    • Invited
  • [Presentation] X線自由電子レーザーによる生きた細胞のナノイメージング2015

    • Author(s)
      西野吉則、木村隆志、吉田力矢、于健、城地保昌、別所義隆
    • Organizer
      第15回蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      あわぎんホール(徳島県徳島市)
    • Year and Date
      2015-06-24 – 2015-06-26
    • Invited
  • [Presentation] エックス線レーザーで観た、生きた細胞2015

    • Author(s)
      西野吉則
    • Organizer
      北海道大学電子科学研究所一般公開サイエンストーク(市民講座)
    • Place of Presentation
      北海道大学(北海道札幌市)
    • Year and Date
      2015-06-06 – 2015-06-06
    • Invited
  • [Remarks] コヒーレント光研究分野 (西野吉則 研究室)

    • URL

      http://cxo-www.es.hokudai.ac.jp/

URL: 

Published: 2017-01-06   Modified: 2022-08-25  

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