2017 Fiscal Year Annual Research Report
日本列島におけるミヤコグサの開花期の地域適応と種内分化機構の解明
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15J00897
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| Research Institution | Kyoto University |
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Principal Investigator |
若林 智美 京都大学, 人間・環境学研究科, 特別研究員(DC1)
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| Project Period (FY) |
2015-04-24 – 2018-03-31
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| Keywords | ミヤコグサ / 環境適応 / 全ゲノム関連解析 / 開花時期 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
今年度に行った研究活動は大きく次のように大別できる。：（１）全ゲノム関連解析を用いた有力な候補遺伝子の検出；（２）候補遺伝子の機能解析；（３）ゲノムワイドな手法を用いた集団遺伝学的解析；（４）共通圃場実験による形質データの収集及び観察；（５）研究成果の発信
（１）これまでの経験を生かし、複数のモデルと複数の環境下で収集された形質データを用いて、より有力な候補遺伝子の検出を試みた。本年度はこれまでの全ゲノム関連解析とは異なり、新たに得られた宮城県鹿島台の圃場における形質データを加えて行われた。より明確な結果を得られ、既知の開花関連遺伝子の相同遺伝子を複数含む信頼性の高い候補遺伝子を得た。（２）基礎生物学研究所の川口正代司教授のご指導のもと、これまでに挙げられていた候補遺伝子に対する機能解析を引き続き行った。平成２７年度に作成していた形質転換体を用いて、世代を重ねる作業と形質（開花時期）の計測を行た。
（３）前年度に引き続き、デンマーク及び国内の共同研究者らと連携して、国内野生系統を用いたゲノムワイドな集団遺伝解析を行った。１３３系統の４０万以上のSNPs情報を元に、集団構造解析や、PSMC解析及びFSTの値をもとにした集団間分化や過去の集団サイズの変動の推定を行った。得られた結果は現在共同研究者らと連携して論文化を進めている。
（４）沖縄県糸満市の圃場において国内野生系統及び組替自殖系統を、それぞれ１３０系統、１００系統用いた共通圃場実験を開始した。新たに得られる形質データを加えることで、解析の強度を上げることが期待できる。
（５）新たに得られた結果も含め、国内の学会での口頭発表を１回、ポスター発表を１回、国際学会でのポスター発表を１回行った。また、これまでの研究成果を論文にまとめており、現在投稿中の論文が１本、投稿準備中の論文が２本あり、順次受理に向けて進めていく予定である。
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| Research Progress Status |
29年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
29年度が最終年度であるため、記入しない。
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