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2017 Fiscal Year Annual Research Report

複雑反応経路網に適用し得る速度解析法の開発

Research Project

Project/Area Number 15J02125
Research InstitutionHokkaido University

Principal Investigator

住谷 陽輔  北海道大学, 大学院総合化学院, 特別研究員(DC1)

Project Period (FY) 2015-04-24 – 2018-03-31
Keywords速度解析 / 反応経路自動探索 / 多成分連結反応 / 有機反応 / 反応経路ネットワーク / 表面反応
Outline of Annual Research Achievements

初年度に開発した速度定数行列縮約(RCMC)法の応用範囲を拡げた。RCMC法では、短時間で行き来する安定構造同士を一つにまとめ、安定構造の重み付き総和として得られる超状態間のオーバーオールの速度定数を計算できる。前年度はRCMC法を反応経路の自動探索を行う人工力誘起反応(AFIR)法と組み合わせたプログラムを作成したので、当該年度で本手法の更なる開発と応用を行った。
本手法では、RCMC法による速度解析を、反応経路自動探索のナビゲーションシステムとして利用する。これにより、速度論に基づいて反応経路の探索領域を制限し、反応物から指定した温度・反応時間で到達し得る反応経路を効率的に探索できる。本手法をPasserini反応に適用した。本反応は、多成分の反応基質が相互作用する複雑な反応だが、起こり得る反応機構を得ることができた。本手法の探索では、分子の結合情報や反応パターンなどの情報は使用せず、完全に系統的である。現在、プログラムのチューニングを終え、論文の投稿準備を進めている。
また、さらに計算を高速化する手順を考案し、論文で報告した。この方法では、2つの手順から反応経路ネットワークを作成する。具体的には、(1) 最初の探索ではAFIR法で近似的なlocally updated plane(LUP)経路を求める。(2) 得られたLUP経路ネットワークからボトルネックとして振る舞う経路をRCMC法で抽出し、その経路のみ遷移状態(TS)構造最適化を行い、固有反応座標(IRC)経路を求める。これにより、速度解析の結果にほぼ影響しない経路のTS構造最適化とIRC計算を削減できる。本手順は、Cu(111)表面上のH2Oの反応に適用した。これにより、ボトルネックであった結合組み替えの過程をIRC経路として、その他の高速で進行する過程をLUP経路とした反応経路ネットワークを得ることができた。

Research Progress Status

29年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

29年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (8 results)

All 2018 2017

All Journal Article (4 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results,  Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 2 results) Presentation (4 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results)

  • [Journal Article] Implementation and performance of the artificial force induced reaction method in the GRRM17 program2018

    • Author(s)
      S. Maeda, Y. Harabuchi, M. Takagi, K. Saita, K. Suzuki, T. Ichino, Y. Sumiya, K. Sugiyama, Y. Ono
    • Journal Title

      Journal of Computational Chemistry

      Volume: 4 Pages: 233-251

    • DOI

      10.1002/jcc.25106

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Global Reaction Route Mapping for Surface Adsorbed Molecules: A Case Study for H2O on Cu(111) Surface2018

    • Author(s)
      S. Maeda, K. Sugiyama, Y. Sumiya, M. Takagi, K. Saita
    • Journal Title

      Chemistry Letters

      Volume: 47 Pages: 396-399

    • DOI

      10.1246/cl.171194

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Designing Backbone of Hexasilabenzene Derivatives Possessing a High Unimolecular Kinetic Stability2018

    • Author(s)
      Y. Sumiya, S. Maeda
    • Journal Title

      Chemistry - A European Journal

      Volume: 印刷中 Pages: -

    • DOI

      10.1002/chem.201801699

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] An autocatalytic cycle in autoxidation of triethylborane2017

    • Author(s)
      R. Uematsu, C. Saka, Y. Sumiya, T. Ichino, T. Taketsugu, S. Maeda
    • Journal Title

      Chemical Communications

      Volume: 53 Pages: 7302-7305

    • DOI

      10.1039/C7CC02541F

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Presentation] 多成分連結反応の反応経路ネットワークとその速度論的理解:パッセリーニ反応2017

    • Author(s)
      住谷陽輔、前田理
    • Organizer
      第20回理論化学討論会
  • [Presentation] Conformational Entropy of Unimolecular Reactions Studied by a New Kinetic Approach2017

    • Author(s)
      Yosuke Sumiya, Tetsuya Taketsugu, Satoshi Maeda
    • Organizer
      13TH INTERNATIONAL CONFERENCE OF COMPUTATIONAL METHODS IN SCIENCES AND ENGINEERING (ICCMSE2017)
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Reaction mechanism and kinetics of organic multicomponent reactions studied by combined automatic reaction path search and rate constant matrix contraction methods2017

    • Author(s)
      Yosuke Sumiya, Satoshi Maeda
    • Organizer
      第33回化学反応討論会
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Conformational entropy of Claisen rearrangement calculated by rate constant matrix contraction method2017

    • Author(s)
      Yosuke Sumiya, Satoshi Maeda
    • Organizer
      11th Triennial Congress of the World Association of Theoretical and Computational Chemistry
    • Int'l Joint Research

URL: 

Published: 2018-12-17  

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