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2017 Fiscal Year Annual Research Report

植物におけるエチレンガス感知機構の構造生物学的研究

Research Project

Project/Area Number 15J09304
Research InstitutionIbaraki University

Principal Investigator

北西 健一  茨城大学, 理工学研究科, 特別研究員(PD) (90815482)

Project Period (FY) 2015-04-24 – 2018-03-31
Keywordsヘム / 鉄 / 酸素 / センサー / ヒスチジンキナーゼ
Outline of Annual Research Achievements

微生物の酸素センシングの分子機構を解明するために、自身で同定した酸素の結合や酸化還元によって制御される新たなセンサータンパク質の構造と機能相関に関する研究を行った。特に、センサードメインであるグロビンやヘムエリスリンドメインの結晶化及び、高分解能での構造決定に成功した。ヘムエリスリンをセンサードメインとして持つセンサーヒスチジンキナーゼに関しては、昨年度に引き続き、ヘムエリスドメインの結晶化スクリーニングを行った。N末端を削ることによってヘムエリスドメインの結晶化に成功し、1.5 Åの分解能で結晶構造を決定することができた。酸素の結合部位及び酸化還元中心と考えられる鉄二核中心には、2個の鉄の間に酸素原子が架橋しており、一方の鉄には塩化物イオンが配位していた。次の目標として、鉄の酸化還元状態でどのような構造変化が起こるのかを原子レベルで明らかにする必要がある。また、グロビンドメインをセンサードメインとして持つセンサーヒスチジンキナーゼに関しては、結晶化スクリーニングの結果、ヘムFe(III)にイミダゾールが結合した結晶化条件を見つけることができた。また、結晶を還元剤溶液へソーキングし、酸素結合(Fe(II)-O2)型、及び還元型(Fe(II))の構造を決定した。その結果、生化学や分光学的な実験結果から示唆されていたヘム遠位にあるTyrが酸素と直接水素結合していることが明らかとなった。このTyrは、Fe(II)型、イミダゾール結合型ではヘムと離れる方向に配座しており、酸素結合に伴う構造変化により、シグナルをヒスチジンキナーゼドメインに伝播させる役割をしていることが示唆される。これらの結果より、微生物の酸素センシングの分子機構について原子レベルでの議論が可能となった。

Research Progress Status

29年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

29年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (6 results)

All 2018 2017

All Presentation (6 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results)

  • [Presentation] Novel Redox Sensing Two-component System in Iron-oxidizing Bacteria2018

    • Author(s)
      Kenichi Kitanishi, Masaki Unno
    • Organizer
      Gordon Research Conference- Sensory Transduction in Microorganisms
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 酸素センサーキナーゼのグロビンドメインの構造解析2018

    • Author(s)
      北西健一、海野昌喜
    • Organizer
      2017年度量子ビームサイエンスフェスタ
  • [Presentation] Ca2+/Zn2+結合型ヒトS100A3蛋白質四量体構造の解明に向けた研究2018

    • Author(s)
      井手賢司、木澤謙司、北西健一、海野昌喜
    • Organizer
      2017年度量子ビームサイエンスフェスタ
  • [Presentation] Ca2+/Zn2+結合型ヒトS100A3蛋白質四量体のX線結晶構造解析に向けての研究2017

    • Author(s)
      井手賢司、木澤謙司、北西健一、海野昌喜
    • Organizer
      第55回日本生物物理学会年会
  • [Presentation] Ca2+/Zn2+結合型ヒトS100A3蛋白質のX線結晶構造解析に向けた変異体の選択2017

    • Author(s)
      井手賢司、木澤謙司、北西健一、海野昌喜
    • Organizer
      第28回日本化学会関東支部茨城地区研究交流会
  • [Presentation] 酸化還元で制御される新しい二成分情報伝達系の同定2017

    • Author(s)
      北西健一、海野昌喜
    • Organizer
      2017年度生命科学系学会合同年次大会(ConBio2017)

URL: 

Published: 2018-12-17  

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